Nat Commun:原发性前列腺癌整体表观遗传学分类研究
景杰生物/报道
编者按:前列腺癌指的是发生在前列腺的上皮性恶性肿瘤,这种疾病的发病率在男性恶性肿瘤中居于前列。雄激素受体(AR)是前列腺癌中的关键驱使转录因子,受表观遗传学的紧密调控。到目前为止,大多数表观遗传学分析都在细胞系或者有限的组织样本中进行。
最近,国际专业学术期刊Nature Communications发表了针对原发性前列腺癌的整体表观遗传学分类研究。研究人员为了综合的研究原发性前列腺癌的表观遗传学背景,在100个前列腺癌肿瘤中对雄激素受体AR和组蛋白修饰标记(H3K27ac, H3K4me3, H3K27me3)进行了RNA-seq和ChIP-seq分析。
研究发现,5种数据类型的整体分子亚型阐释了3种主要的原发性前列腺癌亚型,其中2种与TMPRSS2-ERG明显相关。重要的是,他们鉴定了第3种亚型,表现为AR低的染色质结合能力和火星,但是FGF和WNT信号活性很高。虽然神经内分泌标记基因为阳性,这些肿瘤与拷贝数无关,并且突变程度低,且与其他亚型相关的不良治疗结果基因特性显著减少。
研究通过阐述前列腺癌中转录和表观遗传控制的一种特殊机制,表明了3种亚型中AR决定的严格基因调控的差异性。
参考文献:
Suzan Stelloo, et al., 2018, Integrative epigenetic taxonomy of primary prostate cancer. Nat Commun.
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