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Gynecologic Oncololgy | 通过卫生棉条采集样本,结合拷贝数、甲基化标志物和突变检测子宫内膜癌
译者:刘阳
单位:浙江大学医学院附属妇产科医院
目的
旨在通过分析拷贝数,甲基化标志物和突变来评估是否可以通过卫生棉条收集的脱落DNA检测子宫内膜癌(EC)。
方法
于子宫切除术前收集38例EC患者和28例患有良性疾病妇女的卫生棉条。提取卫生棉条中的DNA并进行以下操作:1)通过低覆盖率全基因组测序(LC-WGS)以评估拷贝数;2)利用焦磷酸测序以测量HOXA9,RASSF1和CDH13的启动子区甲基化百分比;3)利用二代测序(NGS)鉴定与EC相关的19个基因的突变,该类型突变已通过癌症基因组图谱确定。计算每种测试和测试组合的敏感性和特异度。
结果
甲基化分析具有最高的特异度,但灵敏度最低(灵敏度:37-40%;HOXA9,RASSF1和HTR1B的特异度:100%),而突变分析的灵敏度更高(灵敏度:50%;特异度:83%)。但在因良性疾病行手术治疗的女性中,基于拷贝数变异检测,发现仅一例患者出现拷贝数变异“假阳性”结果,该结果仅与(子宫切除术患者术后诊断的)平滑肌肉瘤相关。将3种生物标志物类别中的任何一种视为阳性,则灵敏度为92%,特异度为86%。突变分析并没有增加对拷贝数和甲基化联合分析的灵敏度。
结论
这项研究为无创而精确检测子宫内膜癌提供证据支持。通过改良的的生物标志物检测,有可能开发一种能用于临床检测EC的方法。
责任编辑:Janice
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