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非编码RNA数据分析及研究思路研讨会




非编码RNA数据分析及研究思路研讨会


上海班:2019/11/23-24(22日报到)    


上海浦东中兴和泰酒店



学习班简介
培训目的

    非编码RNA(miRNA、lncRNA、circRNA等)是生物医药领域非常重要的一种调控分子。众所周知,非编码RNA虽然不参与蛋白编码不能直接行使功能,但是它可以通过多样化的调控方式参与众多的通路和生物过程。目前,非编码RNA的研究是主流的创新研究思路,也是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。因此,我们研究设计了这次非编码RNA分析与设计培训班,通过集中和系统的学习,可以掌握非编码RNA分析与设计相关的数据库、在线工具、本地软件的使用以及非编码RNA的创新思路设计。


    如果您是从事医学、动物、植物学等生物学方向的科研工作者(学术),无需有工具操作和编程语言基础,都可以来参加本次培训班。


培训预期

    通过整整两天的培训,掌握非编码RNA相关数据库/工具的使用、分析思路和实用操作知识点,设计贴合自身研究课题的方案。



课程安排

时间安排

课程表

介绍

第一天

9:00~10:20

基础简介

生物信息介绍

非编码RNA的机制、调控模式(miRNA、lncRNA与circRNA)

非编码RNA的创新文献解读(含miRNA、lncRNA和circRNA)

10:40~12:00

数据库简介

NCBI GEO数据库解读

miRNA 注释数据库(注释及序列下载)

lncRNA注释数据库(注释及名称转换)

circRNA注释数据库

13:30~15:00

miRNA分析

miRNA-seq高通量测序解读

(1) 差异miRNA分析

(2) miRNA-mRNA数据库(验证和预测结果)

(3) miRNA与靶基因结合位点(MRE)分析(4) VENN图分析

(5) 癌症的miRNA预后分析

15:20~17:00

lncRNA分析

lncRNA-seq高通量测序解读

(1) miRNA-lncRNA数据库

(2) lncRNA-target分析

(3) lncRNA参与的ceRNA分析

第二天

9:00~10:20

circRNA分析

circRNA-seq高通量测序解读

(1) miRNA-circRNA数据库

(2) circRNA参与ceRNA的分析

10:40~12:00

ceRNA分析

ceRNA(竞争性内源RNA)的机制

ceRNA关系对分析

ceRNA网络构建

13:30~15:00

功能富集分析

lncRNA-mRNA共表达分析

miRNA功能分析(GO和pathway富集)

lncRNA功能分析(GO和pathway富集)

circRNA功能分析(GO和pathway富集)

15:20~16:30

研究思路

miRNA高通量数据分析的创新思路

lncRNA高通量数据分析的常见思路

circRNA高通量数据分析的常见思路

注意事项:携带windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。


示例图  高通量数据处理与VENN分析图

示例图  ceRNA网络图


示例图  非编码RNA调控网络及功能富集分析(pathway) 

示例图  共表达分析散点图
讲师简介
宋博士

科研成果参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。


研究方向有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。


培训经历在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。


培训方向《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》、《TCGA/GEO生信高通量数据挖掘》、《非编码RNA分析与设计》等。

培训安排及费用
培训时间及地点

2019/11/23-24 (22日报到)  上海中兴和泰酒店

培训地点:上海市浦东新区科苑路866号


住宿推荐:推荐中兴和泰酒店 500元/天 费用自理(可就近预定其他酒店)

预定电话:可自行预定,或者请在报名表中注明日期和房型要求

培训费用

 2800元/人 ,注册费包含会场、教材、专家讲课费等费用,不含住宿费。

优惠政策:                                                                       

1. 提前转账可以提前拿到学习资料。                                   

2. 三人组团报名,每人可优惠100元每人。                           

3. 四人组团报名,每人可优惠200元每人。                           

4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册。                       

5. 参加免注册费复听的老学员,仅需缴纳500元服务费。  

6. 参加过医药加非编码RNA或数据挖掘班的学员可以享受1000元的优惠。       

报名咨询
培训主办方

主办方:医药加科研培训中心

承办方:上海循掘生物科技中心


注意事项:携带windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。

报名咨询

咨询报名:王老师,13818765978,金老师,18917745941




单细胞测序数据分析与课题设计面授

10.19-20   北京金泰绿洲酒店  

 11.23-24 清华大学伯克利深圳学院

 

 

会议背景】单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行研究。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现,彻底降低了单细胞测序的成本门槛。自此,单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。通过单细胞测序可以最大程度的反映细胞的异质性,发现新的细胞群和细胞亚群,并为阐明细胞状态转换的调控机理提供了技术保障。单细胞技术以及数据分析方法在肿瘤、发育生物学、免疫学、神经科学等领域有重要应用,是现今生命科学研究的焦点。

 

 

【会议特色】

本次课程以近期CNS文章为案例主线,逐一详细剖析,全程电脑实战教学。理论与实践相结合,老师将以最简单易懂的方式,既介绍单细胞测序的研究方法、分析内容和最新前沿进展,又介绍具体的数据库、工具和软件的使用,并在课堂上进行上机指导。讲师经验丰富,教学深入浅出,能让大家获得从单细胞组学原始数据实现CNS图形绘制的实战能力。


【讲师背景】来自中科院,长期从事单细胞多组学方面的项目研究,目前已在Nature等杂志发表文章四十多篇,承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。


【主要内容】详细内容见课表

1.熟悉单细胞组学图表解读和研究思路。

2.掌握单细胞组学分析标准流程和常用软件。

3.熟悉单细胞数据的分型和marker基因鉴定。

4.掌握单细胞数据的轨迹分析及功能富集分析。

5.了解单细胞课题设计方法及研究思路。

 

【预期目标】本学习班由多年从事单细胞组学研究的科研人员授课,通过深入浅出的理论讲解和实例案例,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的单细胞组学分析流程、方法和软件,从零基础实现到CNS图表的绘制,同时提升研究深度和广度,拓宽研究思路。

医药加金牌讲师团会在现场给学员们面授科研策略与技能。


医药加金牌学习班特色:

医药加金牌学习班自开办以来,已经成功举办了几百期,培训了全国(包涵港、澳、台地区)及加拿大、丹麦、澳大利亚等国家超过千家科研单位的近万名学员。良好的课堂氛围和讲师耐心的课后跟进,获得了学员的交口称赞。医药加金牌学习班,是让学员们真正能够学以致用,在科研上更上一层楼的学习班。

10-11月份医药加学习班课程安排


咨询报名:请加学习班秘书微信bioojia01



10.19-20北京金泰绿洲酒店第37期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班
10.19-20北京金泰绿洲酒店单细胞测序数据分析挖掘与研究思路面授会
10.19-20上海中兴和泰酒店第13期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班
10.26-27上海好望角饭店第11期TCGA/GEO高通量公共数据库挖掘学习班
10.25-27长春金安大饭店第47期循证医学与meta分析(含网状meta分析)三天精讲学习班
10.26-27上海中兴和泰酒店第7期全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班
10.26-28上海中兴和泰酒店第16期基因编辑技术学习班
11.2-3号北京金泰绿洲酒店2020国自然基金标书课题构思辅导班(含有个性化点评辅导)
11.9-10广州南洋长胜酒店2019全国AI科研作图高级学习班
11.9-10广州南洋长胜酒店第11期肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班
11.9-10广州南洋长胜酒店2020国自然基金标书课题构思辅导班(含有个性化点评辅导)
11.8-10北京金泰绿洲酒店第48期循证医学与meta分析(含网状meta分析)三天精讲学习班
11.9-10北京金泰绿洲酒店临床研究设计与实用医学统计研讨班
11.9-10北京金泰绿洲酒店第15期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班
11.16-17上海中兴和泰酒店基于R语言的机器学习与医学研究
11.16-17上海中兴和泰酒店高通量数据挖掘与网络构建作图班
11.23-24上海中兴和泰酒店非编码RNA数据分析与课题设计学习班
11.23-24上海中兴和泰酒店临床研究设计与实用医学统计研讨班
11.23-24清华伯克利深圳学院单细胞测序数据分析挖掘与课题设计面授会
11.22-24清华伯克利深圳学院第38期调控性非编码RNA与外泌体研究实战研讨班
11.22-24清华伯克利深圳学院python语言零基础三天学习班
11.30-12.1北京金泰绿洲酒店第8期全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班



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