滴，科普卡~ 食管癌细胞的自述

大家好！我是食管癌细胞，人们根据细胞类型又给我取了两个名字，当我以鳞状形式排列于食管壁上时，大家叫我食管鳞状细胞癌（ESCC），而我要是存在于食管粘膜下腺体或者贲门腺体时，我的名字就叫做食管腺癌（EAC）。

可千万别小看我，我可是世界第八大癌症！每年我会造成全球48万人患病。据研究报道，我在发展中国家出现的概率比较高，在中国的影响力可非同一般，导致中国是世界上食管癌发病率最高的国家之一。并且我还具有明显的地理聚集现象，在河北、河南、江苏、山西、陕西、安徽、湖北等省份的发病率明显高于其他地区^[1]。

我的出现，确实给人类带来了很多不便，你会感到吞咽疼痛而影响进食。俗话说，人是铁饭是钢，一顿不吃饿得慌！非常抱歉，你的体重又下降了，声音嘶哑并且不停的咳嗽，并且伴随着出校消化不良和烧心的症状。我也渴望可以像正常细胞那样，和你们友好相处。

但如今随着高通量测序和基因组分析技术的飞速发展，人们对我的基因组背景，发病机制研究的越来越深入，可以开始对我进行控制，我感到非常的欣慰。那么，快来瞧瞧，现在人们利用二代高通量测序对我的研究究竟有多么的透彻！

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食管腺癌和食管鳞癌的基因组比较^[2]

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科学家通过对11例EAC和12例ESCC样本进行外显子测序，发现在ESCC和EA中，TP53突变频率最高；在ESCC中，NOTCH1基因在北美人群中的突变频率比在中国人群中更高；EAC中的大多数突变已经存在于匹配的Barrett食管（BE）中，如表1所示。

表1 食管癌序列突变统计表

该研究发现了EAC和ESCC基因组间的突变差异，美国和中国人群ESCC之间的关键遗传差异，并表明NOTCH1是食管癌中的肿瘤抑制基因，为BE向EAC的进化提供遗传基础。此研究成果发表在Cancer Discov上。

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食管腺癌基因组特征整合分析^[3]

本研究通过对164个食管癌（90 ESCC，72 EAC，2个未分化癌），359个胃癌，外加36个食管胃连接处（GEJ）癌症患者进行了WES，SNP基因分型分析高频扩增和缺失区域（SCNA），同时进行了DNA甲基化测序，mRNA测序和microRNA测序，研究成果发表在Nature上，为食管癌的分型和新疗法开发提供了基础。多组学联合分析得到结果如下：

✩食管癌中Somatic突变

1、ESCC中，TP53, NFE2L2, MLL2, ZNF750, NOTCH1和TGFBR2为显著突变基因；EAC中，TP53, CDKN2A, ARID1A, SMAD4和ERBB2为显著突变基因。

2、ESCC和EAC有共同的SCNA，但也有大量的不同。

3、突变频率高的通路：细胞周期通路、受体酪氨酸激酶（RTK）通路、胚胎发育和细胞增殖相关的通路、细胞分化通路、染色质重构通路。

4、调节细胞周期的突变和SCAN出现得最频繁，细胞周期激酶抑制剂是一个潜在的治疗靶点。

✩ESCC分子分型

1、ESCC分为了3种分子亚型，ESCC亚型展示了与地理位置的关联，亚洲人倾向为ESCC1，东欧和南美人倾向为ESCC2，北美为ESCC3。

2、跟EAC对比，ESCC的C > A替换和APOBEC标签富集：前者跟抽烟有关，后者在ESCC2样品（特别是乌克兰和俄罗斯）中富集。

✩与胃癌分型的关系

1、ESCC的特征跟头颈鳞癌相似，EAC的特征跟胃腺癌相似。EAC与胃癌的染色体不稳定（CIN）型高度类似，跟其他3类胃癌分型显著区别。

2、胃食管腺癌-染色体不稳定型的特征（GEA-CIN）：甲基化程度一般比正常的高，可分为4类。在Somatic突变特征上：EAC样品SMARCA4突变率、RUNX1的缺失比例高于胃癌；APC突变率较低，说明Wnt/β-连环蛋白在EAC中不起主导作用；拷贝数变化上，WWOX和FHIT的缺失比例高。这些数据表明，EAC和GAC-CIN可能是同一种癌症类型。

图1食管腺癌与CIN型胃癌变异的相似性

✩总结不同发病区的型别构成

如图1所示，从近食管端向胃末端的胃食管癌亚型比例变化，色带的宽度表示存在于组织区域内的亚型的比例，亚型的主要特征在上述文献解读中显示。

图2 胃食管癌分子亚类分级

参考文献

[1].潘祖林, 刘俊峰. 食管癌中p16蛋白的研究现状[J]. 食管外科电子杂志, 2014(1):16-19.

[2].Agrawal N,Jiao Y,Bettegowda C,et al.Comparative genomic analysis of esophageal adenocarcinoma and squamous cell carcinoma[J]. Cancer Discovery, 2012, 2(10):899-905.

[3].Cancer Genome Atlas Research Network.Integrated genomic characterization of oesophageal carcinoma[J]. Nature, 2017, 541(7636): 169-175.

华大科技肿瘤组

专注于肿瘤基因组学生物信息分析，致力于提供最专业的肿瘤基因组学科技服务。团队由经验丰富的肿瘤基因组学专家队伍组成，依托于华大基因在肿瘤领域长期研究经验，为全行业提供项目方案设计、测序服务、数据分析、平台建设、技术优化等全面的解决方案。同全球科学家合作阐释肿瘤分子机制并实施转化应用开发，为肿瘤精准医学的研究与应用提供技术支撑。团队已在国际顶级杂志发表文章30余篇，目前重点关注肿瘤基因组数据分析与挖掘，肿瘤基因组数据库建设以及精准医学数据评价。

撰稿：肿瘤组、郑小乐

编辑：市场部

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