点一点，生信小白秒变老司机 | Dr.Tom 2.0重磅上线！

2018年8月，华大自主研发的交互式数据挖掘系统Dr.Tom正式上线，迅速赢得老师们的青睐！时隔半年多，全新Dr Tom 2.0版本——多组学交互式数据挖掘系统终于上线！相比1.0版本只在mRNA上搞事情，2.0版本的内容更加丰富，更加酷炫，也更加实用！接下来就让科技君和大家一起先睹为快吧。

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测一得“三”

相比于常规的mRNA转录组测序，全转录组阐释生物学问题更全面、更清晰。但是全转录组测序结果数据复杂，到底怎么分析？或者因为样品特殊，只测序了mRNA或者Small RNA，能否通过信息分析拉取出和已知结果有互作关系的其他类型RNA呢？没问题！这些Dr.Tom都可以帮您完成。

图1  选中目的基因，点击关联转换，即可根据互作关系或者位置关系查看所有与所选基因相关联的其他RNA，并可通过多种小工具，一键可视化互作关系。

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多数据库联合分析，定向数据调取

除了常见的NCBI数据库之外，Dr.Tom 2.0还新增了TCGA、ARCHS4等多数据库联合分析，深度挖掘数据，拉取目的基因在肿瘤或常规组织中的表达情况，为后续分析方向提供更多可能。

图2  在任意基因表格中通过扩展列-外部数据库-在TCGA,ARCHS4数据库中调取感兴趣的方向，选取后即可在表格中看到基因在外部数据库中的表达情况。

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告别查阅，一键读取基因&文献详情

挑选出目的基因，注释和功能是什么？和其他哪些基因有互作？GO、Pathway功能是什么？又有哪些文献支持？在Dr.Tom 2.0中，一键点击即可拉取所有信息。

图3  点击感兴趣的基因即可直接进入基因详情页，可以直接获取基因的注释链接，序列，表达情况，关联以及已经研究发表的文献列表，文献直接点击即可进入阅读界面。

图4  在基因互作图界面，直接点击两个基因之间的连接线，即可弹出支持互作关系的文献列表，一键点击即可进入阅读界面。

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多维度数据展示，低分到高分思维转变

在高分文章中，多维度的图片展示已经成为不可或缺的一环，比如在常规热图中，经常出现需要展示某一类热图功能是什么。如果可以在同一张图中体现第三维度的绘图，就可直接展现同样表达量聚类的基因归属于何种功能。这一点，同样可以在Dr.Tom 2.0系统中轻松实现。

图5  多维度的作图在多个图表中都可以展示，图例在表达量聚类中，点击右上角的设置，即可添加多个内容作为纵向/横向分类，在常规的热图基础上，增加第三维度的分类信息，直接点击分类信息后左边的基因表格也会切换到对应内容。

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自定义模块，更个性化的数据处理单

旧项目数据也想一起分析？没问题，可自定义上传同一参考基因组版本的其他定量数据，使用丰富的小工具模块自己分析。除此之外，还可以针对目的基因的特征，重新定义基因分类，更加个性化地整合单项目研究重点。

图6  用户根据系统上给出的表格格式，填写好基因信息，并一键上传，即可调用系统上多个小工具进行数据分析。

看到这里，相信大家已经跃跃欲试了吧！5月份，Dr.Tom 2.0正式上线，真核有参转录组测序、RNA-seq、Small RNA测序和LncRNA测序都可以使用此系统交付。

如果您想了解更多Dr.Tom相关内容和使用细节，还请联系当地销售经理免费体验或扫描二维码（左）报名试用。在后续使用过程中，可以联系华大的技术支持小伙伴（0755-36307094）或扫描二维码（右），登录华大技术支持知识库获取教程（PS. 知识库中还有超多NGS相关干货等您来学）。

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Dr.Tom 1.0版本回顾

2018年8月，华大自主研发的交互式数据挖掘系统Dr.Tom正式上线，全新的数据循环挖掘模式、丰富的作图小工具和个性化极强的图表交互功能，使得转录组数据分析进入了新时代，也让越来越多零信息分析基础的生信小伙伴，迅速成为叱咤风云的数据处理大师。

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撰稿：孙宇欣

编辑：市场部

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