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HM350代谢组、脂质组暖春特惠
两大产品强强联合,双向为您解析初级代谢谱图
作为代谢组(metabolome)的主要组成成分,初级代谢物(如氨基酸、碳水化物、有机酸及脂质等)在不同的物种中高度保守,主要作为细胞燃料、细胞结构成分及生物活性和信号分子等存在,对生命体生存起着至关重要的作用[1]。
这些代谢分子结构多样、浓度范围极为广泛,难以通过单一的通用技术进行整体的检测和评估。因而精选重点代谢物做靶向检测,并与脂质组整合起来、进行互补,有利于全面展示有机体中的初级代谢景观谱图、从代谢的角度解析生理病理机制。
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热点应用
2022 BGITech
肠道菌群研究 生物标志物研究
疾病机制研究 疾病分型研究
人群队列研究 营养代谢研究
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精选案例
2022 BGITech
1、肠道菌群研究
McB裂解物可调节肠道菌群并改善免疫代谢稳态[2]
样本设计:
LFD小鼠(低脂饮食);WD小鼠(西方饮食,高脂高糖),包含:WDREF小鼠(19.5% 酪蛋白)、WDCNTL小鼠(16.5% 酪蛋白+3% 澳洲坚果油)及WDMcB小鼠(19.5% McB全细胞细菌裂解物)
研究方法:
靶向代谢组学(短链脂肪酸)、脂质组学、16S 测序、RT-PCR等
主要结论:
在不同程度的热应激条件下(22℃、30℃),使用McB全细胞细菌裂解物作为WD饮食中的蛋白来源都能使WD饮食导致的肠道菌群变化得到恢复;伴随肠道菌群的改善,WDMcB小鼠相比其他WD小鼠,表现出葡萄糖代谢改善、肥胖缓解、肝脏脂质代谢改善及肝脏免疫浸润减少等现象;同时WDMcB小鼠的副拟杆菌属富集、肠道中(Foxp3+RORγt+IL-17+)调节性T细胞表达上调等表现共同表明McB裂解物具有调节宿主肠道菌群及免疫代谢稳态的能力。
原文链接:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.13522283
2、生物标志物研究
探究外泌体在新冠病毒感染中的重要作用[3]
样本设计:
健康组(n=26)及COVID-19轻症患者(n=18)、中症患者(n=19)、重症患者(n=13)
研究方法:
代谢组学、脂质组学
主要结论:
研究共鉴定到598种脂质与404种极性代谢物,发现差异代谢物(10种)模型可有效地将健康组与疾病组分开(AUC=0.975);脂质组学分析表明与COVID-19发病机制相关的血浆脂质改变类似于外泌体特异的脂质谱——鞘磷脂(SMs)和单唾液二己糖神经节苷脂(GM3)的含量提高,二酰甘油(DAGs)含量降低;进一步血浆外泌体做脂质组学检测,发现GM3的含量与疾病严重程度成正相关,富含GM3的外泌体参与COVID-19的发病。
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cmet.2020.06.016
3、机制研究
揭示FXR激活预防NAFLD的作用机制[4]
样本设计:
① 临床研究:胆结石患者安慰剂组及澳贝胆酸(OCA)治疗组;
② 小鼠模型:野生型WT小鼠、Fxr–/– 小鼠、Shp–/– 小鼠、Srebp1c–/– 小鼠、Ppara–/– 小鼠、Fxrfl/fl 小鼠。所有研究:viechle组(水)及GSK2324(FXR激动剂)组;西方饮食(WD)喂养研究:WD组、SD组(实验室标准饮食)、胆酸饮食组;吸收研究:SD组及胆酸饮食组;氘标记研究:D2O喂养
研究方法:
靶向代谢组学(脂肪酸、胆汁酸)、脂质组学、qPCR等
主要结论:
FXR激活可降低小鼠及人类肝细胞中的单不饱和脂肪酸(MUFA)及多不饱和脂肪酸(PUFA)的水平,其中MUFA的减少是由于FXR依赖性抑制的Scd1、Dgat2及Lpin1的表达,这与SHP和SREBP1c无关;而PUFA的FXR依赖性减少则与肠道脂质吸收降低有关。
此外研究通过小鼠模型研究发现了FXR激活通过两种不同的机制降低肝脏甘油三酯(TAG):① FXR激活通过调节胆汁酸水平来影响肠道脂质吸收;② 肝脏FXR控制脂肪合成、而肠道FXR调节脂质吸收,这两种途径共同调节肝脏中TAG的含量。
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cmet.2021.06.012
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2022 BGITech
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参考文献:
[1] Gallart‐Ayala, Hector, Tony Teav, and Julijana Ivanisevic. "Metabolomics meets lipidomics: Assessing the small molecule component of metabolism." BioEssays 42.12 (2020): 2000052.
[2] Jensen, Benjamin AH, et al. "Lysates of Methylococcus capsulatus Bath induce a lean-like microbiota, intestinal FoxP3+ RORγt+ IL-17+ Tregs and improve metabolism." Nature communications 12.1 (2021): 1-19.
[3] Song, Jin-Wen, et al. "Omics-driven systems interrogation of metabolic dysregulation in COVID-19 pathogenesis." Cell metabolism 32.2 (2020): 188-202.
[4] Clifford, Bethan L., et al. "FXR activation protects against NAFLD via bile-acid-dependent reductions in lipid absorption." Cell Metabolism 33.8 (2021): 1671-1684.
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