叮!有一份重要的DNBelab C系列单细胞测评报告,请查收!
单细胞研究的“高清”时代已来临,多种单细胞分选结合高通量测序技术服务方案层出不穷,该如何选择?
华大科技提供单细胞服务一站式高性价比方案,提供组织解离,采用华大自主DNBelab C系列平台单细胞分选,结合DNBSEQ™高保真测序,应用Dr. Tom数据无限挖掘分析,拓展多种分析思路,一站式全方位服务,为您的单细胞研究之路提供最优解决方案。
为了更好的赋能单细胞研究,近期,我们采用多种测评方案,拓展多种组织类型,包括模式物种在内及细胞核分选模式,无论平台平行比较,还是单次分析结果,都再次证明采用华大自主单细胞分选平台,可以有效实现单细胞分选和单细胞类型鉴定;利用此高性价比合作模式,是您在规模化单细胞研究之路上的不二之选。
实力终究要靠数据说话,是时候展示DNBelab C系列高通量单细胞分选平台测评结果了!
测评一
1.1
测评目的
DNBelab C系列平台是否能灵活捕获稀有细胞?
1.2
测评方案
将两种不同状态的人多功能干细胞(PPSCs以及NPSCs)以99:1的比例混合,进行DNBelab C4单细胞RNA文库制备和测序。
1.3
测评结果
鉴定到NPSCs细胞比例为1.3%,表明该平台具备可靠的含量低的细胞捕获能力。
图1 各类细胞分选检出比例
1.4
测评结论
DNBelab C系列平台可实现高效捕获稀有类型细胞。
测评二
2.1
测评目的
DNBelab C系列平台捕获细胞(核)悬液样本效能如何?
2.2
测评方案
选取人、大鼠、小鼠、模式动物、植物等多种物种组织类型,经组织解离获得合格的单细胞(核)悬液后,进行DNBelab C系列平台高通量单细胞分选及转录组建库,采用DNBSEQ™测序平台进行测序,进一步采用DNBelab C软件进行基本分析。
2.3
测评结果
单个样本捕获细胞数大于7,000个细胞,单个细胞基因中位数大于1,000。
注:以上测评结果仅供参考,单细胞数据分析结果与单细胞(核)悬液质量高度相关。
2.4
测评结论
DNBelab C系列平台可实现单细胞及基因有效捕获及鉴定。
测评三
3.1
测评目的
DNBelab C系列平台捕获细胞(核)悬液结果细胞类群鉴定是否准确?
3.2
测评方案
采用合格的人外周血PBMC悬液样本,进行DNBelab C系列平台高通量单细胞分选及转录组建库,采用DNBSEQ™平台进行测序,进一步采用DNBelab C软件及其他分类方法进行分群分析,并与已发表文献不同单细胞平台分选细胞分类及注释结果进行同比。
3.3
测评结果
所得单细胞数据UMAP降维分群后,与2020年Nature Biotechnology已发表文章中人PBMC细胞分类及注释结果均一致[1]。
图2 DNBelab C4平台的细胞分群对比
3.4
测评结论
细胞分群鉴定结果准确度高,与相同类型样本在其他平台已发表分群结果重合度高。
DNBelab C系列高通量单细胞分选平台代表文章
单细胞测序技术极大地推进了细胞异质性研究,是近年的高分热点攻关领域。
2022年3、4月,两篇DNBelab C系列平台文章于Nature(影响因子69.504)发表,前者确定了8CLC与人8细胞期胚胎的高度相似性,解析了转化过程的关键分子事件和基因调控网络(查看解析),将助力实现未来人体器官的体外再生,对解决器官短缺,异体和异种移植排斥反应等问题有着重大意义;后者绘制首个非人灵长类动物(猕猴)全身器官细胞图谱(查看解析),为疾病诊疗、靶向药物开发提供助力,为人类更好地探究生命的进化提供可能。
2022年6月,一篇DNBelab C系列平台文章于Nature Communications(影响因子17.694)发表,绘制基于单细胞转录组测序首次构建家猪多个组织和器官的单细胞转录组图谱。(查看解析)
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科技君划重点:DNBelab C系列单细胞分选平台已助力发表文章23篇,平均影响因子多达17+。
文章列表如下:
参考文献:
[1] Ding Jiarui,Adiconis Xian,Simmons Sean K et al. Systematic comparison of single-cell and single-nucleus RNA-sequencing methods.[J] .Nat Biotechnol, 2020, 38: 737-746.
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