给单细胞图谱加分,原来可以这么简单?
从单个细胞研究开始,单细胞研究因技术受限,直到2009年结合高通量测序,才完成单个细胞内基因的测序研究。
随着生命科学技术和工具的发展,2015-2018年,单细胞测序技术发展迅猛,进入高通量时代,可单次实现万位级别单细胞分选和细胞内基因测序,极大程度上让我们从“高清”视角发现和研究生命现象本质。
追求生命体全部细胞的信息地图,全面解码细胞的数字化特征,解析组织中单个细胞相关核酸及蛋白信息,获得细胞间差异、细胞群体差异,就能绘制出生命体各器官组织细胞图谱,这无疑是我们的终极研究目标。如同细胞地图一样,按图索骥,让我们能够放大到静态和动态方式研究和监测生命活动,这不仅可以解析生物细胞特有状态和生命活动形式,如细胞如何发育,细胞如何变化,细胞如何传递信息,如何集体发挥作用;还能够进一步了解细胞命运与疾病之间的某种关系,如为什么存在出生缺陷,为什么肿瘤会发生和转移,我们能不能找到更精准的潜在治疗和修复的位点……这是我们研究单细胞,并且将其规模化探究的意义所在。与此同时,寻求高通量、低成本的单细胞研究及图谱绘制工具及相应服务就显得尤为重要。
利用高通量单细胞研究技术,华大已发表了多篇高分文章,科技君精选两篇文章解读,供大家参考。
01
首个非人灵长类动物(猕猴)全身器官细胞图谱
发表期刊:Nature(影响因子69.504)
文章题目:Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis
2022年4月,由深圳华大生命科学研究院主导,多国科研团队合作的研究成果发表于Nature。基于华大自主单细胞DNBelab C系列平台和DNBSEQ™测序平台,研究人员对猕猴的45种组织约114万个细胞进行单细胞测序分析,获得了世界上首个非人灵长类动物全身器官细胞图谱。该图谱将被用于物种进化、人类疾病以及药物评价和筛选相关的研究,为生物医学的发展提供基础性的资源和工具,为疾病诊疗、靶向药物开发提供助力,为人类更好地探究生命的进化提供可能[1]。
02
首个家猪多器官的单细胞转录组图谱
发表期刊:Nature Communications(影响因子17.694)
文章题目:Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level
2022年6月,深圳华大生命科学研究院罗永伦教授,联合丹麦奥胡斯大学林琳教授等多家国内外科研团队的合作成果发表于Nature Communications。该研究基于华大自主单细胞DNBelab C系列平台,首次构建家猪多个组织和器官的单细胞转录组图谱,绘制了20种猪组织/器官,获得133,492个细胞和89,034个细胞核转录组数据,鉴定确定了234个细胞簇,对应于58个主要的细胞类型,相对全面描绘家猪器官中细胞组成的异质性和相互作用,为深入了解人和猪之间的生物医学相似性和差异,并推动猪在生物医学研究中的应用,提供有效的数据支持[2]。
以上两篇高分成果借助高通量测序技术与华大自主单细胞DNBelab C系列平台,绘制全身器官细胞图谱,再次佐证了一次性获得更多高质量单细胞信息的重要性。
华大基因在单细胞领域深耕多年,积累深厚的单细胞服务经验和方案设计能力,DNBelab C系列单细胞分选平台已助力发表文章23篇,平均影响因子多达17+。
华大科技提供单细胞服务一站式高性价比方案,从单细胞图谱方案设计,到样本取材选样及邮寄方式建议等,并可以提供组织解离以及流式细胞分选服务,采用华大自主DNBelab C系列平台单细胞分选,结合DNBSEQ™高保真测序,拓展多种分析思路,为细胞图谱研究及发文之路提供最优解决方案。
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参考文献:
[1] Han, Lei, et al. "Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis." Nature 604.7907 (2022): 723-731.
[2] Wang, Fei, et al. "Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level." Nature communications 13.1 (2022): 1-18.
撰稿:鹏程
编辑:市场部
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