2022年度国内、国际十大科技新闻发布，西南大学、华大基因等单位合作完成的家蚕超级泛基因组项目入选！

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今日，中央广播电视总台发布2022年度国内、国际十大科技新闻，由西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕桑产业技术体系首席科学家代方银教授团队联合华大基因等单位合作完成的家蚕超级泛基因组项目入选2022年度国内十大科技新闻。（来源：中央广播电视总台央视科教）

“立桑为业，多元发展”。家蚕是重要的经济昆虫和新兴模式生物，但之前仅有单一参考基因组及部分重测序，尚不足以支撑基因组变异和优良基因的深度挖掘，尤其对于分子育种具有显著局限。

研究团队对1,078份蚕种质资源进行了深度短读长测序，对其中545份代表性资源进行了长读长测序，产生55.57T基因组数据，组装了545个蚕的高质量基因组，对100个基因组进行了基因注释，鉴定到4,300余万个SNP、930余万个Indel、340余万个结构变异（SV）和7,308个新基因（家族），绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱。该超级泛基因组囊括了目前最全面的家蚕和野桑蚕基因组信息，是迄今全球动植物领域样本量最大的长读长泛基因组。

同时，该研究在世界上率先实现家蚕基因库数字化，创建“数字家蚕”，对于深化功能基因组研究和推进家蚕模式化，开启家蚕设计育种，赋能“改造家蚕、多元利用”等，将产生深远的影响。2022年9月24日，相关研究成果在线发表于国际名刊Nature Communications。

▶ 研究详情：率先实现家蚕基因库数字化！Nature Comm：西南大学、华大基因等团队合作绘就家蚕超级泛基因组

2022

中央广播电视总台发布

2022年度国内、国际十大科技新闻

科技君点睛

泛基因组

近年来，随着国内外动植物基因组研究的不断深入，越来越多物种的泛基因组相继被公布，如家蚕、大豆、油菜、大麦、小麦、水稻、高粱、棉花等。泛基因组现已在动植物基因组学研究中被广泛用于更为全面地评估物种内遗传多样性。

表1 近年部分高分泛基因组文章及研究策略汇总

依据现有文章及经验总结，利用长读长+短读长测序结合Hi-C技术构建泛基因组是目前主流的研究策略。

► 材料选取 

具有代表性的物种数量≥10个。

► 华大泛基因组推荐策略 

将多个样本进行基因组组装，建议选择其中一个样本进行T2T组装。

表2 华大泛基因组推荐策略

*新闻内容来源：中央广播电视总台央视科教

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