科研助力计划 | 单细胞疾病大队列研究支持方案，正式发布！

高通量单细胞技术在应用范围日益扩大的今天，超高性价比更利于获得更高单细胞相关信息，尤其是针对不同人群个体异质性研究，适用于普适性疾病诊疗和药物开发等需求，规模化单细胞研究有利于深入剖析常见异质性疾病的遗传分子机理，目前在研究方案设计中选择大量单细胞样本将成为趋势。

以下3篇单细胞疾病大队列精选文章解读，供大家参考。

01

2022年4月，来自澳大利亚加文医学研究所、美国加州大学旧金山分校和美国加州大学洛杉矶分校等多个机构分别在Science（IF=56.9）杂志上背靠背发表了两篇研究长文，题目分别是“Single-cell eQTL mapping identifies cell type–specific genetic control of autoimmune disease”和“Single-cell RNA-seq reveals cell type–specific molecular and genetic associations to lupus”。

第一项研究中，科学家们收集了982名供体的127万个外周血单核细胞（PBMC），将单细胞RNA测序数据与基因型数据相结合，构建了14种免疫细胞类型中基因表达的遗传效应图谱。

第二项研究中，科学家们采用多重单细胞RNA测序（mux-seq）技术对162例系统性红斑狼疮（SLE）患者和99名健康对照者共计120多万个PBMC进行了深入分析，揭示了不同细胞类型间特异性分子及其与红斑狼疮之间的遗传关系。

这两项工作融合了群体遗传学和单细胞性RNA测序数据，是揭示遗传学如何在细胞水平上导致自身免疫性疾病风险的一个重要里程碑^[1,2]。

02

2022年11月，北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁团队，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）张泽民团队以及北京大学人民医院肝胆外科朱继业团队紧密合作，于Nature（IF=69.504）发表名为“Liver tumor immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity”的文章。

研究人员对124例未接受治疗的肝癌患者的160个样本进行了单细胞转录组测序分析，构建了一套全新的肝癌免疫微环境分型体系（TIMELASER）。深入分析该分型体系有助于我们理解肿瘤与微环境以及微环境之间相互作用，并辅助发现新的生物标志物和免疫治疗靶点。此外，文章还揭示了肝癌中性粒细胞的异质性，并明确指出大部分与肿瘤相关的中性粒细胞具有促进癌变作用。这些成果为肝癌的基础研究和临床诊疗提供了关键信息^[3]。

03

2023年8月，复旦大学附属肿瘤医院徐烨、胡欣和加利福尼亚大学Liying Zhang团队合作，于Gastroenterology（IF=29.4）发表名为“Molecular profiling provides clinical insights into targeted and immunotherapies as well as colorectal cancer prognosis”的文章。

研究对869名中国结直肠癌患者的肿瘤进行了大规模前瞻性测序。通过免疫评分、多重免疫染色、全外显子组测序、转录组和单细胞测序的综合分析，系统地评估了不同基因组背景下肿瘤免疫微环境的异质性。该项研究成功绘制出迄今国内最大规模的结直肠癌基因组变异图谱，揭示了中国人群结直肠癌基因组变异特征，并鉴定出其中可精准预测结直肠癌靶向治疗和免疫治疗效果的基因标志物，为结直肠癌的临床应用提供了新思路^[4]。

华大科技在单细胞领域深耕多年，积累深厚的单细胞服务经验和方案设计能力，DNBelab C系列高通量单细胞转录组全新服务，一站式解决方案，实现多领域、高性价比服务支持。截止2024年4月，累计发表85篇SCI文章，包含2篇Nature，2篇Cell，平均影响因子15+，其中IF>10文章数有35篇。

华大科技提供单细胞服务一站式高性价比方案，从单细胞图谱方案设计，到样本取材选样及邮寄方式建议等，并可以提供组织解离以及流式细胞分选服务，采用华大自主DNBelab C系列平台单细胞分选，结合DNBSEQ高保真测序，拓展多种分析思路，为细胞图谱研究及发文之路提供最优解决方案。

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参考文献：

[1] Seyhan Yazar et al. "Single-cell eQTL mapping identifies cell type–specific genetic control of autoimmune disease." Science. (2022).

[2] Richard K. Perez et al.  “Single-cell RNA-seq reveals cell type–specific molecular and genetic associations to lupus.” Science. (2022).

[3] Xue, Ruidong et al. “Liver tumour immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity." Nature. (2022)：141–147 .

[4] Guo, Linwei, et al. “Molecular Profiling Provides Clinical Insights Into Targeted and Immunotherapies as Well as Colorectal Cancer Prognosis." Gastroenterology. (2023)：414-428.

供稿：姜莹、潘亚婕

编辑：市场部

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