精彩回顾 | 四位领域专家揭秘高分研究案例,共探动植物领域前沿
基因组学(DNA Omics)、细胞组学(Cell Omics)、时空组学(Spatial Omics)、质谱(Mass Spectrometry),DCSM多组学技术的结合,为动植物科学研究提供了强大工具,推动解决遗传性疾病、改良农作物、保护濒危物种及生物多样性保护等研究方向的创新与发展。
精华总结,一文回顾
为更好地助力科研工作者们的动植物领域相关研究,2024年7月17-18日,华大科技举办的线上“大咖视野:动植物系列讲座”圆满结束,4位动植物领域专家分别就其研究方向进行了思路分享,内容涵盖非人灵长类细胞图谱构建、单细胞及时空组学在植物发育研究中的实施和进展、深渊鱼类成因与适应性演化、动植物基因组研究进展与未来趋势等热点领域,揭秘高分研究案例,助力动植物研究。
报告一
《空间转录组学在复杂疾病中的应用与案例》
韩磊
杭州华大生命科学研究院脑科学方向主任科学家
副研究员
嘉宾简介
杭州华大生命科学研究院脑科学方向主任科学家,副研究员,人脑疾病项目组负责人。研究方向为通过细胞多组学数据研究神经疾病的细胞和分子层面的病理机制。曾利用华大自主研发的单细胞测序技术构建了世界上首个非人灵长类全身器官细胞图谱,该研究成果发表在Nature,被评为“2022年中国医药生物技术十大进展”以及“2022年中国十大医学科技新闻”。目前研究结果已在Nature、Science、Cell、Nature Communications、Journal of Physiology、Neuropharmacology等杂志发表论文。研究获得国家自然科学基金,科技部脑科学与类脑研究重大项目等资助。
报告总结
韩磊老师首先分享了基于华大的DNBelab C系列高通量单细胞RNA文库制备试剂盒(DNBelab C4)和DNBSEQ测序平台对猕猴的45个组织约114万个细胞进行单细胞测序分析,获得世界上首个非人灵长类动物全身器官细胞图谱的图谱构建,多组学图谱整合,多组学数据挖掘的成果思路。然后为我们介绍了非人灵长类动物百万单细胞交互式资源网站——非人灵长类动物全细胞图谱数据库(NHPCA),用户可以通过数据库导航栏项目直接获取不同组织中的细胞聚类、基因表达/共表达情况、跨物种比较和细胞间配体受体相互作用信息。充分阐述了大规模细胞图谱的绘制工作,对于我们理解器官结构组成、胚胎发育和衰老、人类疾病及生命演化等具有的重要意义。
报告二
《单细胞时空组学在植物发育研究中的实施和进展》
李博生
博士
北京大学现代农业研究院研究员
嘉宾简介
博士,北京大学现代农业研究院研究员。山东省青年泰山学者,潍坊市鸢都学者, 潍坊市政协委员,深圳市孔雀计划人才。曾先后在美国耶鲁大学、美国加州大学戴维斯和南方科技大学任职,在包括Nature、Nature Communications、Molecular Plant、PNAS、Plant Cell等国际一流学术期刊上发表多篇高质量的学术论文。主持或承担国家自然科学基金,科技部国家重点研发计划等科研项目。
报告总结
李博生研究员首先介绍了单细胞转录组技术,以及空间转录组技术的技术原理及其应用进展,强调了时空组学在解决空间单细胞异质性问题的关键作用。并以“scStereo-seq揭示拟南芥叶片表征区域特异性细胞和空间转录组变化”、“空间分辨率下的C4+CAM整合光合代谢途径”、“大豆根瘤和根的空间分辨单细胞核转录组图谱揭示大豆根瘤成熟过程中的动态特征”等多篇前沿学术成果案例阐述时空组学在作物发育研究的进展。最后,以“空间转录组揭示绿色细胞在番茄愈伤芽再生中的关键作用”为案例,表明空间转录组在植物生物学研究中具有的巨大潜力。
报告三
《探索鱼类多样性的新边界:深渊鱼类的成因与适应性演化》
何舜平
博士,博士生导师
中国科学院水生生物研究所二级研究员
嘉宾简介
博士生导师,中国科学院水生生物研究所二级研究员,法国国家自然历史博物馆理学博士。从事鱼类系统发育、生物地理学、比较基因组学和适应性进化等方面的研究。获得2002国家杰出青年科学基金、中科院百人计划等,获2020年度湖北省自然科学奖一等奖、2021年度中国生命科学十大进展等荣誉,先后主持和承担了欧盟项目、国家自然科学重点基金、国家863项目和973专题等重要课题,主导提出“万种鱼基因组计划(Fish 10K)”。累计发表论文300余篇,发表杂志包括Cell、Nature、Nature Ecology & Evolution、Molecular Biology and Evolution、Molecular Ecology、Molecular Phylogenetics and Evolution等国际著名期刊。
报告总结
何舜平研究员首先为我们讲述了他及其团队搭乘“探索一号”科考船,乘坐载人潜水器“深海勇士”号下潜到马里亚纳海沟,海下作业采集大量珍贵的鱼类标本,探索深渊奥秘的科研经历。并且,何舜平老师分享了其利用多组学大数据分析的方法,对生活在马里亚纳海沟7,000米以下最深基因组的狮子鱼开展的多方面研究成果,通过比较基因组学和转录组学方法,从形态和基因功能层面解析深渊狮子鱼极端环境的独特适应性遗传机制。研究发现狮子鱼为适应高压环境,其骨骼变得非常薄且具有弯曲能力,头骨不完全,肌肉组织也具有很强的柔韧性,其中一个与骨骼钙化的关键基因也发生了假基因化。进一步研究发现,狮子鱼发生外界感知依赖听觉、节律丢失、饥饿耐受、氧化应激耐受力增强的独特表型变化的基因组水平遗传基础。
报告四
《动植物基因组研究进展及未来趋势》
简建波
华大科技科研合作部总监
副研究员
嘉宾简介
14年多组学科研经验,主导完成数十个大型科研项目,研究方向为基于多组学技术的进化和农业育种应用;在SCI期刊发表论文58篇,其中作为第一或通讯作者(含共同)在Nature、Nature Communications、Plant Biotechnology Journal、The Plant Journal、Molecular Ecology Resources和Science of The Total Environment等发表文章29篇,BMC genomics杂志编委,众多SCI杂志审稿人。
报告总结
简建波博士首先介绍了测序技术以及基因组组装发展过程,动物、植物基因组研究进展以及基因组学在“时空法则”多组学研究、演化研究、生物多样性保护等方向的应用。此外,简建波博士进一步介绍了T2T基因组组装、泛基因组群体重测序及其经典案例。最后,本次分享为我们带来了以动植物基因组及新技术为核心,在AI智慧分子育种、群体多组学交叉学科融合等应用领域拓展的未来趋势展望。
此次线上讲座得到了众多科研工作者的广泛关注,我们非常欣喜地看到有很多老师们加入到了多组学技术及动植物研究队伍中。相信在各位同道们的共同努力下,多组学技术在各领域会有更多的革新、发展和创新。
华大科技不断优化产品和技术服务,为广大科研工作者提供基于基因组学、细胞组学、时空组学和质谱等多组学整体解决方案。
基因组学
自主DNBSEQ平台低重复率,低Index hopping,高SNP/InDel检测敏感度和准确性;
长读长WGS解决方案填补常规WGS检测盲区,如高同源基因、大结构变异等;
提供从低深度到高深度,短读长到长读长的人全基因组重测序整体解决方案;
大人群大队列项目经验丰富,包括天坛万例、瑞金ChinaMap万例、华西十万例等。
单细胞组学
研究单个细胞的细胞组学、功能和表达特征的方法;
一站式服务体验:从组织解离、流式分选、建库、测序,到数据深度挖掘分析,提供一站式服务;
多组学&多平台服务:集成多种平台,实现高&低通量单细胞水平多组学服务;
Dr. Tom多组学数据挖掘系统:无需生信分析基础,玩转单细胞转录组交互式深度数据挖掘。
时空组学
具有纳米级分辨率、厘米级全景视场的原位捕获;
可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空间转录组分析。
空间蛋白组学
可以精细获得组织内不同细胞和功能区域的蛋白表达谱,从而深入了解组织空间微环境并发现更精准的生物标志物和新的功能机制。
空间代谢组学
质谱成像结合代谢组学技术,一次性获得代谢物定性、定量和定位信息。
多组学关联分析
将基因组学数据与其他组学数据(如代谢组、蛋白质组学、转录组学等)相结合,从而更全面地了解生物体内的发生机制,发现潜在的生物标志物。
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热线电话:400-706-6615
邮箱:info@genomics.cn
供稿:程宇尧
编辑:市场部
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