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国内年度十大科技新闻!西南大学编写家蚕基因组“字典”

重庆发布 2023-01-06

日前,中央广播电视总台发布

2022年度国内十大科技新闻

其中

西南大学科研团队绘制出

全球首张家蚕超级泛基因组图谱成功入选


家蚕生命周期各阶段丰富的表型多样性 西南大学供图


西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室绘制出全球首张家蚕超级泛基因组图谱,并率先创建“数字家蚕”基因库,将我国的家蚕基因研究推向设计育种阶段。相关研究论文日前在国际期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表。


该实验室公布545个长读长测序的样本,是迄今为止动植物中规模最大的长读长泛基因组。不仅如此,实验室完成了家蚕大规模种质资源基因组解析(“千蚕基因组”计划),在世界上率先实现家蚕基因库数字化,创建“数字家蚕”。


蚕茧 西南大学供图


“西南大学拥有世界规模最大的家蚕基因库,覆盖全球90%以上的家蚕遗传变异资源,是我们开展超级泛基因组研究的优势。”西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕桑产业技术体系首席科学家代方银教授介绍,对于家蚕基因的研究,此前仅有单一参考基因组及部分重测序数据,尚不足以支撑基因组变异和优良基因的深度挖掘,尤其对于分子育种具有显著局限。


此次实验室发布的超级泛基因组图谱,是一个物种所有基因组信息的总和,这对深化功能基因组研究、种质创新等意义重大。


实验室内的蚕 西南大学供图


作为世界家蚕基因组研究的新里程碑,这一成果将开启家蚕设计育种和多元创新利用新时代。这也意味着,今后相关领域的科学家拥有了一本详尽的“字典”,可按需要,有针对性地对家蚕进行设计育种。


比如可以高效率、高通量对接基因型和表型,精细解析控制性状的遗传基础;可以针对基因组全区域进行研究,不只局限于基因组不到3%的基因编码区;可以对基因组里大片段结构变异进行研究,包括基因重复,大片段插入、缺失、倒位和染色体断裂、融合等。


代方银表示,下一步,家蚕基因组生物学国家重点实验室还将搭建泛基因组数据库,促进家蚕基础研究;深度剖析基因组内涵,助力遗传进化研究;同时,系统挖掘家蚕的优异基因,促进家蚕品种选育和多元化利用,拓展其他新功能、新型材料的开发。


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来源:重庆发布

文字:周小平

编辑:高阳

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