全球疫情进展 看这个就够了（截至20220322）
点击上方蓝字关注“尹哥聊基因”
——本周疫情概况——
据WHO报告，截至3月22日，全球累计确诊病例约4.69亿，累计死亡病例约607.7万。据Our World in Data网站数据显示，截至3月22日，全球累计接种疫苗约110亿剂。
图1：截至3月22日，全球疫情概况（来源：WHO）
图2：截至3月22日，全球各区域累计确诊病例
图3：截至3月22日，全球各区域累计死亡病例
图4：截至3月22日，全球累计确诊病例排名前10的国家详情
图5：截至3月22日，全球每日新增确诊病例概况（每百万人）
图6：截至3月22日，过去7天内，全球新增确诊病例排名前10的国家详情
——相关资讯——
暨南大学张其威/吴建国等发现，奥密克戎曾发生多次基因重组
近日，暨南大学病原微生物研究团队张其威教授和吴建国教授等在预印本bioRxiv在线发表了题为：Tracking SARS-CoV-2 Omicron diverse spike gene mutations identifies multiple inter-variant recombination events的研究论文。
该研究对全球出现的新冠病毒奥密克戎变异株的全基因组序列及其刺突蛋白（Spike）基因序列进行了精细分析，首次发现奥密克戎变异株刺突蛋白基因与阿尔法（Alpha）、贝塔（Beta）、德尔塔（Delta）等变异株之间发生了多次跨变种重组的可靠证据，并且推测奥密克戎毒株与德尔塔毒株的重组产生的“德尔塔克戎”样变异株 （“Deltacron”-like Variants）最早在2021年11月时已在南非和博茨瓦纳等地相继出现。
新冠病毒的刺突蛋白（Spike），主要负责受体识别和介导冠状病毒入侵宿主细胞。病毒S蛋白氨基酸序列突变能改变S蛋白与宿主细胞受体的结合效率、从而影响病毒感染和传染性。S蛋白具有免疫原性，带有许多T淋巴细胞和B淋巴细胞表位，抗原识别位点的突变会导致中和抗体与抗原结合效能的变化、影响抗体中和效价，甚至发生抗原漂移与免疫逃逸现象。
研究团队首先对2022年1月15日之前流行的新冠病毒奥密克戎变异株S蛋白的52,563条基因序列进行了全面和细致的比较，发现早期出现的奥密克戎变异株自身已携带多种既往VOC流行株具有的特征性氨基酸突变，提示奥密克戎变异株S蛋白基因经历了多发基因重组事件。进一步鉴定发现18个BA.1亚变种的核心突变（频率>99%）（8个在NTD，5个在S1/S2切割位点附近，5个在S2）。BA.2亚变种与Alpha变异株共享三个额外的氨基酸缺失。BA.1亚变种与VOC变异株在S蛋白总共有9个常见的氨基酸突变（比BA.2多三个），这表明奥密克戎变异株可能来自与这些VOC的重组。BA.1中包含的阿尔法（Alpha）相关突变（del69-70、del144）比BA.2多三个，因此BA.1在系统发育上可能更接近阿尔法变异株。
通过分析2020年11月至2021年1月全球发布的奥密克戎变异株的基因组序列，筛选奥密克戎变异株的S蛋白基因序列，研究团队发现奥密克戎变异株在流行期间，不断新增和整合多个非原生的来自其它既往的VOC/VOI毒株的典型氨基酸突变。其中最值得注意的是，部分奥密克戎变异株的S蛋白RBD区出现了L452R及R346K突变，可能是与德尔塔（Delta）及缪（B.1.621）变异株重组获得。L452R及R346K突变位于S蛋白受体结合区域，前期研究已经证明L452R及R346K可导致对应区域的中和抗体结合效能下降，导致病毒免疫逃逸能力增强。
对2021年11月至2022年1月全球公布的S蛋白序列建立系统发育网络，发现奥密克戎变异株在最初的2个月流行期间，S蛋白的单倍型存在多态性，序列类型主要为BA.1亚变种，还分别进化出在BA.1基础上整合了S蛋白A701V、R346K、L452R等突变的亚群，以及BA.2亚变种、返祖型（Reversion）等几个亚群。奥密克戎变异株在最初与其它变异株共流行期间，可能已经发生了多次重组事件，导致获得了来源于其它变异株的特征性突变的基因转移。奥密克戎变异株与较早流行的其它毒株之间进行序列交换，可能导致了奥密克戎变异株S蛋白基因部分原生突变的丢失，发生回复突变，氨基酸序列更接近于原始毒株。
L452R突变是德尔塔变异株携带的特征性突变。研究团队对携带德尔塔变异株L452R突变的疑似“德尔塔克戎样变异株”（“Deltacron”-like Variants）的奥密克戎重组株进行了溯源和全基因组分析，发现“Deltacron”-like变异株在全球多个国家均有检出。最早于2021年11月在南非和博茨瓦纳收集的新冠标本中即出现了L452R“Deltacron”-like的奥密克戎重组株，目前该重组株主要分布在北美洲、欧洲以及西亚地区，出现的频率达近千株。重组的奥密克戎变异株的在全基因组序列水平上也呈现出多态性，表现出来源的复杂多样化，提示奥密克戎变异株与其它毒株发生了共感染。
图7：新冠病毒基因重组图示
文章来源：
https://news.bioon.com/article/6796806.html
——欧洲——
据WHO报道，截至3月22日，欧洲累计确诊病例约1.94亿；累计死亡病例约191.9万。
图8：截至3月22日，欧洲每日新增确诊病例（每百万人）
图9：截至3月22日，欧洲每日新增死亡病例（每百万人）
图10：截至3月21日，欧洲因确诊新冠住院病例（每百万人）
——英国——
据WHO报道，截至3月22日，英国累计确诊病例约2,009.4万，累计死亡病例约16.4万。据Our World in Data网站数据显示，截至3月18日，英国累计接种疫苗约1.41亿剂。
图11：截至3月22日，英国新冠疫情概况
图12：截至3月18日，英国累计接种新冠疫苗情况
图13：截至3月22日，英国每日新增确诊病例（每百万人）
图14：截至3月22日，英国每日新增死亡病例（每百万人）
——美国——
据WHO报告，截至3月22日，美国累计确诊病例约7,899.9万，累计死亡病例约96.4万。据Our World in Data网站数据显示，截至3月20日，美国累计接种疫苗约5.59亿剂。
图15：截至3月22日，美国新冠疫情概况
图16：截至3月22日，美国累计接种新冠疫苗情况
图17：截至3月22日，美国每日新增确诊病例（每百万人）
图18：截至3月22日，美国每日新增死亡病例（每百万人）
图19：截至3月17日，美国因确诊新冠住院病例（每百万人）
——南非——
据WHO报告，截至3月22日，南非累计确诊病例约370.4万，其中累计死亡病例约10万。据Our World in Data网站数据显示，截至3月21日，南非累计接种疫苗约3,301万剂。
图20：截至3月22日，南非新冠疫情概况
图21：截至3月21日，南非累计接种新冠疫苗情况
图22：截至3月22日，南非每日新增确诊病例（每百万人）
图23：截至3月22日，南非每日新增死亡病例（每百万人）
图24：截至3月21日，南非单日新冠检测阳性率为5.55%（峰值35.12%，2021年12月19日）
——全球接种概况——
截至3月22日，全球累计接种疫苗110亿剂。其中，世界上有64%的人口至少接种了一剂新冠疫苗；在低收入国家，只有14.4%的人至少接种了一剂新冠疫苗。
图25：截至3月21日，全球至少接种一剂新冠疫苗的人口占比概况
图26：截至3月21日，各国总计接种新冠疫苗剂次
图27：截至3月21日，各国疫苗完全接种和部分接种人数比例（不含中国）
——中国接种情况——
截至2022年3月21日，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团累计报告接种新冠病毒疫苗32.3亿剂次。
图28：截至3月22日，全国疫苗接种情况（来源：凤凰新闻网）
图29：截至3月22日，疫情实时大数据报告（来源：百度）
——美国接种情况——
截至3月20日，美国已有2.55亿人接种疫苗，约占总人口的76.66%。其中，2.17亿人（65.38%）完全接种，另有0.38亿人（11.28%）至少已接种一剂。
图30：截至3月20日，美国接种新冠疫苗的人口占比
2022年世界经济展望：感染病例增加，复苏进程受阻，通货膨胀上升
2022年初，全球经济状况弱于预期。随着新的奥密克戎变异毒株持续扩散，各国重新采取措施限制人员流动。在能源价格上涨和供给扰动的影响下，通胀有所上升，其上升幅度和波及范围均超出预期，在美国以及许多新兴市场和发展中经济体尤其如此。中国的房地产市场目前正在收缩，私人消费的恢复慢于预期，这些因素也影响了经济增长的前景。
全球经济增速预计将从2021年的5.9%下降至2022年的4.4%。相比2021年10月的《世界经济展望》，我们将2022年的增速预测值下调了0.5个百分点，主要是因为最大两个经济体的增速预测有所下调。美国的增速预测下调了1.2个百分点，原因包括：我们对基线预测的假设进行了修订，从中剔除了“重建美好未来”法案的一揽子财政政策措施；当局更早退出宽松货币政策；以及供给短缺问题持续存在。在中国，由于“零容忍”抗疫政策给经济活动带来干扰，加之房地产开发商持续面临财务压力，我们将中国的增速预测下调了0.8个百分点。预计2023年全球增速将放缓至3.8%。尽管这比上一期预测高出0.2个百分点，但其主要原因是当前抑制增长的各种因素在2022年下半年消退之后，增速会自然回升。这一预测的前提条件是大多数国家的健康形势到2022年底显著好转，其假设各国疫苗接种率普遍提高，治疗方法也变得更为有效。
当前的供给链干扰和能源价格走高将延续至2022年，在这种环境下，高通胀预计将比2021年10月《世界经济展望》的预期持续更长时间。假设通胀预期继续得到较好锚定，随着2022年供需失衡得到缓解以及主要经济体货币政策作出响应，通胀应逐渐回落。
全球基线预测的风险偏向下行。新变异毒株的出现可能使疫情更加持久，再次给经济带来扰动。此外，供给链扰动、能源价格波动和局部工资压力意味着通胀走势和政策路径存在较大的不确定性。发达经济体加息可能引发金融稳定风险，且可能使新兴市场和发展中经济体的资本流动、货币和财政状况面临风险——在过去两年债务水平大幅上升的情况下尤其如此。地缘政治紧张依然存在，这使其他全球性风险可能显现出来。此外，当前的气候危机意味着发生重大自然灾害的可能性依然很高。
新冠疫情持续肆虐，实施有效的全球卫生战略比以往任何时候都更加重要。为了防止更多危险变异毒株的出现，必须在全球范围内确保人们能够获得新冠疫苗、检测工具和治疗手段。为此，需要扩大有关物资的生产，改善各国内部的交付系统，提高国际分配的公平性。货币政策方面，许多国家需要继续收紧银根，以控制通胀压力；财政政策方面，与疫情初期相比，目前各国的财政政策空间更为有限，因此需要重点安排医疗和社会支出，同时着重支持受影响最大的群体。在这样的背景下，各方必须开展国际合作，使有关国家能够持续获得流动性，并在必要时加快实施有序的债务重组。加大气候政策方面的投入，对降低发生灾难性气候变化的风险依然至关重要。
图31：国际货币基金组织对未来经济发展的预测
文章来源：
https://www.imf.org/zh/Publications/WEO/Issues/2022/01/25/world-economic-outlook-update-january-2022
供稿| 曹苏杰
编辑 | 覃福林
审核 | 马清滢
— THE END —
觉得不错点个"在看"呗
推荐阅读
【声明】生命科学与基因技术正在高速发展，针对同一研究课题，不同团队的研究结果存在差异甚至相悖的可能。另受本人知识结构及参阅资料准确性的局限，文章内容仅供参考。欢迎读者随时纠错并参与讨论。
点“阅读原文”收听基因电台。