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大榕树下·成长记 | 陈太阳:从南科大到哈佛,脚踏实地是“捷径”

【编者按】


怀揣梦想而来的南科学子,满载收获开启人生新的征程。“明德求是,日新自强”的校训,“敢闯敢试、求真务实、改革创新、追求卓越”的创校精神,滋养着南科大学子们在求学的道路上努力生长,通向更宽广的未来。


在这个毕业季,让我们走进这些优秀学子的世界,分享他们大学生涯里的精彩故事,去体会青春的流金岁月,也希望借此激励更多的南科学子坚守梦想、无畏前行。


如果可以回到过去,我希望能够回到我和同学们在全国大学生生命科学竞赛获奖的那一天,因为那意味着我参与的第一个科研项目受到了专业的认可!


陈太阳是一个非常喜欢数学和计算机的生命科学学院学生,很享受利用编程和算法,解决生物学难题、创造新事物的过程。今天,我们一起来了解来自致仁书院的陈太阳,从南科大到哈佛的成长故事。



“生物信息学集合了我所有热爱的学科”


从选择进入生物信息学专业学习,到决心未来投身于这个领域,是陈太阳结合自己的兴趣和特长,在不断的学习和探索之后的结果。


在从事医学工作的家人的影响下,陈太阳从小就很喜欢看相关的纪录片和书籍,了解了很多大自然和人类的奥秘。大一刚入校,她就希望进入生物相关专业学习,但当时这只是一个相对模糊的目标。


大一下学期,家人参与疫情防控工作,陈太阳从他们的讲述中,深切地感受到生物科学的重要作用:核酸检测技术从一开始的速度缓慢成本昂贵发展成后来的快捷方便;人们对病毒认识的深入促进了疾病的治疗和预防,极大地造福了医护人员和患者。从那个时候开始,她对病毒的致病机理以及被检测的原理产生了强烈的好奇。


于是她主动学习了解了一些新冠病毒方面的研究成果,例如病毒的RNA序列和蛋白结构、检测试剂和疫苗的研发方向等,这些与测序、蛋白质结构解析、微生物学、免疫学方面的技术息息相关,这让她意识到生物相关的新科技离自己的生活并不遥远。


当时,她选择的计算机程序设计课得到了几乎满分的分数,在高等数学课程中也取得了不错的成绩,“因此我对自己的数理基础有了信心,最后决定选择与数学、计算机相关的生物信息学专业。”


陈太阳在南科大校园内


除了入校后自主选择专业的机会,在南科大,几乎所有学生都有进入实验室接触真实科研环境的机会。很多学生都会做一些自己感兴趣的科研项目,学校有充分的资源让大家树立自己的兴趣、探索喜欢的领域。陈太阳充分利用院系组织的实验室参观、师生交流等活动了解各个实验室的情况。


在几次交流过后,生科院副教授靳文菲成为了她的学术导师。陈太阳对测序技术和数据分析方法非常好奇,尤其是单细胞测序这种新技术:“靳文菲老师对单细胞测序技术以及相关的组学研究有着非常深刻的认识,对癌症等疾病也有深入的研究。”陈太阳也希望通过学习生物、数学、计算机等交叉学科知识在人类健康中的应用,来增进人们对疾病本质的认识、促进精准医疗。



在参与科研和竞赛中不断成长


陈太阳所在的课题组包含本科生、硕士生和博士生,研究方向非常广泛,有人擅长做实验,有人从事数据分析,还有人致力于算法开发。“因此师兄师姐总能从很多不同的角度给我们建议,们让我认识到了交叉学科和不同方向的合作对科研的重要性,促进了我遇到问题时多角度思考的能力,也在一定程度上启发我选择研究生项目时关注课题方向和成员的多样性。”


课题组负责人靳文菲老师总是鼓励本科生挑战自己,在参与科研和竞赛中提升自己。


竞赛小组在实验室沟通


太阳参加过全国大学生生命科学竞赛,也申请过攀登项目和大创项目。竞赛要求参赛者完成从设计实验、分析结果到报告撰写的整个研究过程。刚进组的陈太阳并没有什么科研经历,不仅需要提升自己的实验和数据分析能力,还要熟悉分析和解决科学问题的过程:“初入实验室,我感觉自己在课堂上学到的知识与实际应用之间还存在着很大的差距。”


生信分析的数据通常规模庞大,每个分析步骤背后都有着数学原理需要理解,还要运用生物方面的知识把结果转化为大家可以理解的内容表达出来。陈太阳跟着师姐学习单细胞RNA测序数据的分析方法,阅读师兄推荐的相关书籍和文献,克服对服务器系统操作的不熟悉......靳文菲老师在知识理论、实验设计等方面提供了很多建议和帮助。最终他们小组获得了全国大学生生命科学竞赛广东赛区的三等奖,这个奖励也意味着陈太阳参与的第一个科研项目受到了认可,让她印象深刻:“我那时就深切感受到想要分析数据、得出富有生物学意义的结论并不容易。”


陈太阳在实验室


谈及自己大学四年最大的变化,陈太阳给出的答案是,在参与这些科研项目的过程中,学会了领导团队、与人合作和相互学习。


在中学阶段和刚进入大学的时候,很多人认为学习是为了考试,她也停留在“学习好就是分数比别人高”这种片面的认识上。在参与大学生生命科学竞赛、大创和攀登项目的过程中,她的思想观念有了新的变化。


陈太阳介绍,在完成大创项目时,她们需要开发一个适合单细胞RNA测序数据降维和可视化的工具。最初,她和队友经常遇到不懂的地方,进度十分缓慢,于是他们决定定期组织讨论会一起阅读文献交流感想,结合大家不同的专业背景知识,集思广益,互相解答对方的难题。而在攀登计划中,陈太阳比较擅长RNA测序数据分析,但对于DNA、ATAC测序数据分析和湿实验的基础比较薄弱,而她的队友们刚好擅长这些方面。于是大家取长补短,互相学习,一部分人做实验,一部分人负责数据分析,做到合理分工提升效率。


竞赛小组在会议室讨论


在生科院学习的这些时间,陈太阳逐渐认识到学习和科研都不是自己一个人的事情,每个人的精力有限而且各有侧重。学科之间存在很大差异,就连同在生科院的同学也会因为研究方向不同而擅长不同的东西。因此要想把一个任务做好,就要充分发挥每个人的长处:“我也逐渐学会遇到困难积极向老师和其他同学请教,自己担任负责人时,也尽力发掘每个人的优势。”



专业课堂之外的多彩大学生活



上图是陈太阳创作的一幅环保主题的画作,刊登在全球环境艺术展上。


陈太阳在致仁书院的生活导师是环境科学与工程学院讲席教授郑焰,不仅科研经历丰富、学术知识渊博,还非常关注科研人员的社会责任。郑焰老师曾在联合国工作过,一直致力于解决环境和社会问题,也用自己水资源方面的研究成果促进了环境卫生的进步。陈太阳受到了郑焰老师的影响,她认为作为南科大的学子,应该主动认识和解决当今社会存在的问题,积极贡献自己的力量:“是书院导师启发了我科研工作与社会责任密不可分,要将自己的科研与社会的需求结合起来。”这也是陈太阳创作这幅画的原因和契机。


“创作时这幅画时,我想通过对比树木在人类保护和污染环境两种状态下的不同境遇,来呼吁大家认识到大自然的脆弱,提升环保意识。”


除了制作一些画作投稿,陈太阳的兴趣爱好也都和文化艺术相关。她很喜欢历史、艺术、科幻和音乐,不仅选修了学校相关人文社科课程,还自己搜索论文和原著进行阅读,比如希伯来文学故事等。她也喜欢电子音乐,爱玩音乐游戏:“我把这些爱好作为自己释放工作学习压力的方式,有时间和灵感便会投身其中。”在致仁书院,辅导员老师经常给她推荐具有特色的书院活动,“他们在生活中很关心我们学生的身心健康,举办的书院活动也丰富了我的课外生活。”


今年九月,陈太阳将前往哈佛大学攻读生物医学信息学硕士学位,同时进一步进行系统的数理统计和计算机知识技能训练,以便提升在科研中学科交叉应用的能力。“在喜欢的领域里不断探索,用所学知识为促进人类健康作出贡献。”是陈太阳对未来的自己最美好的期望。




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来源:生命科学学院

通讯员:付文卿

图片:徐源榕、受访者提供

编辑:杨奂彦


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