封面故事 · JACS设计作品解析 No.17
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本文撰稿:Perry
封面设计师:Hunter 学术支持:Summers
项目编号:SD20180309f-16
在现代科学中,我们如何去发现那些隐藏至深的“宝藏”,当我们研究出识破他们的方法,我们又如何把“挖掘”过程形象的展现出来?我想没有比图像更直观的了。
本期封面图像出自武汉大学周翔教授与翁小成副教授今年5月份在著名期刊《JACS》发表关于检测mRNA碱基修饰体m6A确切点位分布的研究方法。
图1. JACS.杂志封面
文章向我们展示的检测方法,不同于以往的测试手段只能得到m6A的大致位置,这个方法可以让m6A的点位得到精确的呈现。通过我们制作的图像,让我们一起来理解这种方法。
“宝藏”—— m6A的点位分布
蛋白质是组成人体一切细胞,组织的重要成分,蛋白质合成的过程中有一种物质叫mRNA,它是基因表达中至关重要的角色。在mRNA中,有一种碱基是在碱基A的基础上多了一个甲基修饰,称为m6A,它隐藏颇深,我们想要知道它在mRNA上精确的位置分布,这样可以加深我们对生物功能的理解,甚至可以知道m6A对生命体的调控, 将其作为疾病诊断的标志物,对现代生物学、医学有着重要意义。
“挖掘过程”—— 图像的设计原理
在我们设计的图像中,我们把mRNA的逆转录过程具象化成了一条充满现代感的流水线,传送带上是含有m6A的mRNA,机械手臂抓的原料是dNTP,这里把dTTP上的4位O取代成一个更大的Se原子,传送带上的m6A一碰到Se-dTTP就会产生干扰,点位亮起红灯,流水线发生故障,逆转录停止。
图2. 通过两组mRNA的对照试验得到测试结果
(本图由原作者提供)
按照思路,如上图所示我们取一份有m6A修饰的mRNA样品,m6A的位置未知,将样品分成两份,一份(上)不处理,用Se-dTTP去做cDNA合成,会在m6A的位置发生终止,得到短的cDNA片段。另一部分,用FTO酶处理,这个酶可以把mRNA上的m6A变成普通A,所以cDNA合成的时候就没有逆转录终止的现象发生。对比上下两个实验结果,就可以得到m6A在mRNA上的确切位置。
值得一提的是这个方法是纯化学进行识别,摆脱了抗体测试的一些缺陷,还能实现单碱基分辨率的鉴定,这是之前所不能做到的。我们认为科学的本质就是如此,不断的推陈出新,如果科学的目的是那堆“宝藏”,那达到目的的途径就是一把把金钥匙,它们为学者开拓新的思维方式,让人类在科学的路上越走越远。
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别人的图挺好看,我想画应该用什么软件好?
我的图分辨率很大啊,为什么还是不清楚?
图像有那么多格式,有什么区别?
矢量图和位图是什么鬼,投错了出版社还拒收?
我的修改意见回来了,可是我居然看不懂?
图像采集出了问题,我不想重新做实验啊,怎么办?
为什么我的eps插入到word里就变了?
我的图在我电脑上看还好好的,一到别人电脑怎么就出问题了?
怎么在压缩图像的同时质量还能不损失呢?
我明明存成矢量格式了,为什么不能无限放大?……
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