Nature 一周论文导读 | 2017 年 8 月 17 日

审校 访冬 咖喱 大头 金庄维

生物学

Biology

Integrative clinical genomics of metastatic cancer

【封面故事】关于转移癌的临床基因组学综合研究

Arul M. Chinnaiyan et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23306.html

（导读 卓思琪）和原位癌相比，临床上对转移癌的分子分析尚不深入。本文对 500 名成年病人的不同类型转移性实体瘤进行了全外显子组和全转录组测序。实验中 12.2％ 的病例存在生殖系可能致病突变，其中 75％ 与 DNA 修复缺陷有关。RNA 序列信息可以补足 DNA 序列信息，为基因融合、通路活性及免疫状况等提供信息，综合测序分析为复杂分子图景以及转移癌微环境的观测提供了一个多维的临床视图。

Abstract

Correction of aberrant growth preserves tissue homeostasis

异常生长修正维持组织内稳态

Slobodan Beronja, Valentina Greco et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23304.html

（导读 寒雨）组织在突变细胞的存在下如何保持正常表型仍不得而知。学者用活体成像技术研究带有活化 Wnt /β-连环蛋白干细胞的小鼠皮肤上皮组织，发现所有导致皮肤组织结构变形的生长都会消退。揭示了成熟皮肤上皮的可塑性和维持稳态的动态细胞行为。 

Abstract

New gliding mammaliaforms from the Jurassic

侏罗纪新型滑翔哺乳形类动物化石

Zhe-Xi Luo（罗哲西，芝加哥大学）et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23476.html

图片来源：sciencelife.uchospitals.edu

（导读 寒雨）中生代哺乳形类为哺乳动物的早期演化提供了关键的化石证据。研究者在中国侏罗纪髫髻山组新发现了一种树栖性祖翼兽（Maiopatagium furculiferum），其独特的滑翔能力得益于翼膜、融合的叉骨及特殊的肩带，成为了哺乳动物进化史中最早的滑翔者。

Abstract

New evidence for mammaliaform ear evolution and feeding adaptation in a Jurassic ecosystem

侏罗纪生态系统中哺乳形类动物耳部演化及摄食适应的新证据

Zhe-Xi Luo（罗哲西，芝加哥大学）, Qing-Jin Meng（孟庆金，北京自然博物馆）et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23483.html

图片来源：sciencelife.uchospitals.edu

（导读 寒雨）中生代哺乳形类为哺乳动物的早期演化提供了关键的化石证据。本研究描述了中国侏罗纪髫髻山组双钵翔齿兽（Vilevolodon diplomylos）化石的耳部和牙齿结构及牙齿替换模式，推测其为食草动物，为了解被子植物和滑翔类哺乳形动物之间的关系提供了新见解。

Abstract

m⁶A mRNA methylation controls T cell homeostasis by targeting the IL-7/STAT5/SOCS pathways

m⁶A mRNA 甲基化通过靶向 IL-7 / STAT5 / SOCS 途径调控 T 细胞体内平衡

Hua-Bing Li（李华兵，上海交通大学）, Zhinan Yin（尹芝南，暨南大学）, Richard A. Flavell et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23450.html

（导读 寒雨）m⁶A 在哺乳动物体内的生理功能尚不清楚。本研究发现，敲除小鼠 T 细胞中的 m⁶A 修饰酶 METTL3 可破坏其稳态和分化，且 m⁶A 的缺失可增加 SOCS 家族活性，从而抑制 IL-7 应答通路。首次揭示了 m⁶A 修饰在 T 细胞稳态维持及分化功能中的重要作用和调控 T 细胞稳态增殖的分子机制。

Abstract

Genome-scale activation screen identifies a lncRNA locus regulating a gene neighbourhood

基因组范围的激活筛选实验鉴定出调节附近基因的 lncRNA 位点

Eric S. Lander, Feng Zhang（张锋，MIT） et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23451.html

（导读 郭怿暄）哺乳动物基因组中存在数以千计的长非编码 RNAs（lncRNAs）位点，本研究利用 CRISPR-Cas9 系统开发出一种以 lncRNA 为靶向的基因组范围的激活筛选方法，在人类黑色素瘤细胞中发现介导 BRAF 抑制剂抵抗的 11 个 lncRNA 位点，其中 EMICERI 的激活可以调节附近 4 个编码蛋白质的基因表达。这一全新方法为系统地研究非编码区功能及调节机制奠定了基础。

Abstract

Rewiring the taste system

味觉系统“重连接”

Charles S. Zuker et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23299.html

图片来源：论文原文

（导读 谭坤）味觉受体细胞（TRC）每 5〜20 天就会更新一次，需要和相关的外周神经节重新建立正确的连接。本研究发现甜味和苦味 TRC 经由 SEMA3A 和 SEMA7A 分子来引导连接形成，并通过基因工程改变 TRC 产生的分子类型生成了错误的连接，从而揭示了味觉系统神经连接的奥秘。

Abstract

mRNA 3′ uridylation and poly(A) tail length sculpt the mammalian maternal transcriptome

mRNA 3′ 尿苷化和 Poly(A) 尾巴长度塑造了哺乳动物母源细胞转录组

Dónal O’Carroll et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23318.html

（导读 郭怿暄）卵细胞发生过程中建立起的母源转录组对胚胎发育至关重要。本研究发现由 TUT4 和 TUT7 可以对 mRNA 3′末端进行尿苷化修饰，从而在卵细胞生长过程中通过调控转录本的降解来塑造母源转录组。删除这两个蛋白后，拥有极短 poly(A) 尾巴的转录本在卵细胞中特异性增多并失去 3′端尿苷化修饰，严重影响了卵细胞的成熟和动物的生育能力。

Abstract

Cryo-EM structure of the protein-conducting ERAD channel Hrd1 in complex with Hrd3

内质网相关蛋白降解通道 Hrd1 与 Hrd3 复合物的冷冻电镜结构

Tom A. Rapoport, Maofu Liao et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23314.html

（导读 吴媛媛）内质网相关蛋白降解（ERAD）是内质网膜或腔体中错误折叠蛋白的降解途径，泛素连接酶 Hrd1 是酵母中该信号途径的重要组分，但 Hrd1 能否形成蛋白输出通道尚不清楚。本文报道了 Hrd1 结合内质网腔蛋白 Hrd3 形成的复合物的冷冻电镜结构，证实了 Hrd1 可形成内质网错误折叠蛋白的逆向转运通道。

Abstract

Structural insights into ligand recognition by the lysophosphatidic acid receptor LPA6

溶血磷脂酸受体 LPA6 配体识别的结构基础

Junken Aoki, Osamu Nureki et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23448.html

（导读 吴媛媛）溶血磷脂酸（LPA）可激活 G 蛋白偶联受体并引起多种细胞反应，是癌症和纤维化病变的理想药物靶点。目前 LPA 受体中非内皮细胞分化基因（non-EDG）家族的功能和药理学特性尚不清楚。本文报道了该家族中 LPA6 的蛋白结构，并综合结构分析和突变实验探讨了其与 LPA 的结合模式，分析发现该受体构象重排被后激活。

Abstract

物理天文

Physics & Astronomy

Ram-pressure feeding of supermassive black holes

冲撞压力为水母星系中心的超大质量黑洞提供养料

Bianca M. Poggianti et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23462.html

（导读 阿金）星系中心的超大质量黑洞吸积物质后会产生高能活动星系核（active galactic nucleus, AGN）。本研究对 7 个水母星系（具有气体“触手”）进行观测，发现其中 6 个具有 AGN。研究人员分析指出，使气体从这些星系中剥离的冲撞压力也可能导致气体流向中心，为黑洞提供养料，触发 AGN 活动。 

Abstract

Vigorous atmospheric motion in the red supergiant star Antares

红超巨星心宿二上剧烈的大气活动

K. Ohnaka et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23445.html

（导读 阿金）作为恒星演化最后阶段的红超巨星拥有复杂且多层的大气。本研究根据近红外光谱干涉成像数据，绘制了红超巨星心宿二 Antares 表面和周围大气的速度场分布图。该图显示出在延伸至 1.7 个恒星半径的 Antares 大气中，气团发生剧烈的运动，速度在 -20 km/s 到 20 km/s 的范围之间。该运动无法仅通过大气对流进行解释，具体机制尚不明确。

Abstract

Electronic in-plane symmetry breaking at field-tuned quantum criticality in CeRhIn5

CeRhIn5 材料量子相变点附近的电子对称性破缺

P. J. W. Moll et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23315.html

（导读 阿金）电子向列相出现在铜基和铁基的高温超导体中，但对超导的影响尚且未知。本研究揭示，在 50T 的反铁磁量子相变点附近，重费米子超导体材料 CeRhIn5 中出现电子向列相。在排除了对称性破缺的其他来源后，研究人员认为超导与电子向列相之间存在某种关联。

Abstract

其他

Other

【Material-材料】Chaotic dynamics in nanoscale NbO2 Mott memristors for analogue computing

纳米级别的二氧化铌 Mott 忆阻器中的混沌动力学

Suhas Kumar, R. Stanley Williams et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23307.html

（导读 阿金）机器学习系统使用的神经元模型在混沌边缘模式中运行时可提高计算的复杂度，是计算系统的重要组成。本研究将单个尺寸小于 100 纳米的 NbO2 Mott 忆阻器结合到弛豫振荡器中，展示非线性电流传输和纳米尺度的热波动耦合可产生混沌振荡。将这种忆阻器并入 Hopfield 计算网络可大幅度提高计算效率和准确性。

Abstract

【Archaeology-考古】An early modern human presence in Sumatra 73,000–63,000 years ago

早期现代人于 73000–63000 年前出现在苏门答腊

K. E. Westaway et al.

http://www.nature.com/nature/journal/v548/n7667/full/nature23452.html

（导读 阿金)遗传信息显示晚期智人（AMH）在 7.5 万年前离开非洲后约在 6 万年前抵达东南亚诸岛，但尚缺乏相应考古记录。本研究重新分析了苏门答腊岛上 Lida Ajer 岩洞内牙齿化石的釉质厚度和形态，并使用冷发光、耦合铀衰变和电子自旋震荡技术测得其年龄为 7.3 万至 6.3 万年，给出 6 万年前东南亚已有 AMH 生活的新证据。

Abstract

阅读更多

▽ 故事

▽ 论文推荐

▽ 论文导读

内容合作请联系

[e-mail]