AUC 0.94！全球首个胃癌片段组学大型早筛研究登陆Genome Med

导语

胃癌是全球范围内导致癌症相关死亡的第三大原因^[1]。根据国家癌症中心的统计，2022年我国胃癌新发病例35.87万例，死亡26.04万例^[2]。然而，目前胃镜筛查仅覆盖高风险人群，缺乏适用于一般风险人群的高可及性筛查手段。近年来，多项研究证实了cfDNA片段组学技术在早期癌症筛查中的可行性^[3-6]，但其在胃癌早筛中的临床证据仍有待进一步确认。

浙江省肿瘤医院程向东教授、苏丹教授、俞鹏飞教授团队联合宁波市第二医院陈平教授团队与世和基因合作，将世和MERCURY cfDNA片段组学技术的应用拓展至胃癌早筛（DECIPHER-GC），AUC达0.937。研究结果于近日发表在中科院JCR 1区期刊Genome Medicine（IF=12.3）。

研究亮点

01

全球首个：

基于cfDNA片段组学技术的大型胃癌早筛研究，为MERCURY技术应用于肿瘤早筛提供了新证据。

02

稳健性好：

湿试验流程均在浙江省肿瘤医院内部完成，模型性能优异，独立验证稳定，AUC超0.972，院内落地可行性高。

03

重复性高：

外部队列独立验证（宁波市第二医院），AUC接近0.937，可重复性高，稳定性强。

研究方法

该研究从浙江省肿瘤医院招募并筛选出416例参与者，其中包括183例I、II期胃癌，23例慢性胃炎和210例健康人，按照招募时间的先后分为训练集和独立验证集。外部验证集来源于宁波市第二医院，包括47例I、II期胃癌，5例慢性胃炎和44例健康人。三个数据集中，I期胃癌占比分别为77%、77%、74%。湿实验和特征生成工作均在浙江省肿瘤医院内部完成。收集参与者血浆cfDNA样本并进行低深度WGS测序，从中提取SNS、NCP、CNV和FSP四种cfDNA特征，用于构建和验证MERCURY cfDNA胃癌早筛模型。

图 1. 该研究设计流程概况

研究结果

训练集中，四种cfDNA片段特征的AUC在0.834到0.912之间，特征叠加后AUC提升至0.962。使用Youden指数确定cut-off值为0.715并锁定模型，此时MERCURY cfDNA胃癌早筛模型敏感性为88.2%，特异性92.1%。独立验证集中，模型的AUC为0.972，敏感性91.8%，特异性91.5%。外部验证集中，模型的AUC为0.937，敏感性87.2%，特异性89.8%。该模型可精准识别早期胃癌，对I期胃癌的敏感性在独立验证集和外部验证集中分别为91.1%和85.7%，对II期胃癌的敏感性在两个验证集中也均高于91%。此外，该模型在排除慢性胃炎方面也有较好的表现，独立验证集中，其特异性为78.6%，而在外部验证集中达到了100%。

图 2. cfDNA胃癌早筛模型在不同数据集中的性能

结 语

该研究首次报导了cfDNA片段组学模型用于胃癌筛查的性能，拓展了世和MERCURY技术的适用范围，为一般风险人群的胃癌筛查提供了高准确性、低侵入性、高可及性的筛查方法。

基于MERCURY cfDNA片段组学技术，世和基因开发了多癌种早筛产品世和鹰眼CanScan^®。该产品仅需一管外周血即可筛查包括肺癌、肝癌、肠癌、胃癌、食管癌、乳腺癌等多种高发癌种，模型在独立验证中的敏感性超87%，特异性达98%，溯源准确性为92%，相关研究已在2024年AACR会议上进行口头报告。世和鹰眼CanScan^®目前已取得欧盟CE认证，美国FDA突破医疗器械认定，检测性能达国际领先水平。

专家简介

程向东 教授

浙江省肿瘤医院党委书记

• 浙江省癌症中心 主任
  

• 浙江省上消化道肿瘤诊治技术研发中心 主任

• 国家重点研发计划（973）项目 首席专家

• 中国抗癌协会副理事长

• 中国抗癌协会胃癌专业委员会 副主任委员

• 中国医师协会肿瘤外科医师委员会副主任委员

• 中华医学会外科学分会胃肠外科学组常务委员

• 中国研究型医院学会消化道肿瘤专业委员会常务委员

• 浙江省医师协会肿瘤外科医师分会 主任委员

• 浙江省抗癌协会胃肿瘤专业委员会 主任委员

• 浙江省肿瘤微创外科联盟 主席

• 浙江省医学会外科学分会  副主任委员

• 浙江省抗癌协会副理事长

• 浙江省癌症基金会理事长

苏丹 教授

浙江省肿瘤医院病理科主任

• 医学博士，博士生导师，浙江省科技创新领军人才

• 中科院杭州医学所双聘研究员

• 国家临床（病理科）重点专科建设项目带头人

• 浙江省智能诊断及分子技术研发中心副主任

• 国家卫健委能力建设中心病理专项能力提升项目组委员

• 国家卫健委临床病理质控分子病理质控专家

• 中国合格评定国家认可委员会(CNAS)医学实验室认可评审员

• 中国抗癌协会肿瘤病理专委会常委

• 中国抗癌协会基因检测专委会常委

• 中华医学会病理学专委会分子病理组委员

• 中国抗癌协会肿瘤精准治疗专业委员会委员

俞鹏飞 教授

浙江省肿瘤医院胃外科副主任

• 主任医师，医学博士，硕士生导师

• 日本癌研有明医院访问学者

• 国际胃癌协会（IGCA）会员

• 中国抗癌协会胃部肿瘤整合康复专委会常委兼秘书长

• 中国抗癌协会胃肠间质瘤整合康复专委会委员

• 浙江省抗癌协会肿瘤微创诊治专委会青委副主委

• 浙江省医师协会肿瘤外科医师分会常委兼总干事

• 浙江省医师协会肿瘤MDT专委会常委

• 浙江省医学会外科学分会青年委员

• 擅长胃恶性肿瘤的外科治疗及综合治疗，如腹腔镜胃癌根治术，保留功能的胃癌手术等，对晚期胃癌的转化治疗也有深入的研究。World J Gastrointest Surg 编委会委员；发表论文30余篇，其中SCI论文20余篇；参与或主持国家自然科学基金，浙江省自然科学基金多项。

陈平 教授

宁波市第二医院胃肠外科中心主任

减重代谢外科中心主任

• 主任医师（二级）、硕士生导师
  

• 浙江省医师协会肿瘤外科医师分会副会长

• 浙江省医师协会肿瘤MDT专委会副主委

• 浙江省抗癌协会胃癌外科学分会副主委

• 浙江省数理学会减重与代谢综合治疗专委会副主委

• 浙江省医学会肿瘤学分会常委

• 浙江省医学会肿瘤营养和治疗学分会委员

• 浙江省抗癌协会肿瘤营养与支持治疗专业委员会常委

• 宁波市医学会肿瘤学分会主委

参考文献

[1.] Sung H, et al. CA Cancer J Clin. 2021;71(3):209-249. doi:10.3322/caac.21660.

[2.] Han BF, et al. Journal of the National Cancer Center 2024;4(1):47-53. doi:10.1016/j.jncc.2024.01.006.

[3.] Cristiano S, et al. Nature. 2019;570(7761):385-389. doi:10.1038/s41586-019-1272-6.

[4.] Bao H, et al. Mol Cancer. 2022;21(1):129. doi:10.1186/s12943-022-01594-w

[5.] Wang S, et al. Am J Respir Crit Care Med. 2023;207(9):1203-1213. doi:10.1164/rccm.202109-2019OC

[6.] Zhang X, et al. Hepatology. 2022;76(2):317-329. doi:10.1002/hep.32308

[7.] Yu P, et al. Genome Med. 2024;16(1):79. doi:10.1186/s13073-024-01352-1

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