ISME | 研究揭示植物内生微生物组内的相互作用和生态位重叠网络！

持续的养分修正往往会导致多样性和群落稳定性的降低，但生产力的提高。这些反过来又会影响群落中土壤和根部微生物的组成和表型。养分供应率的增加与土壤微生物生长效率的降低和土壤微生物使用养分的广度相关，并被证明会影响叶子的营养成分和植物代谢物的生产。特别是，氮磷钾改良会增加植物叶片内的大量营养元素和微量营养元素水平，并改变植物的碳分配以及酶和防御性化合物的生产。在此背景下，氮磷钾改良剂对植物及其相关的土壤群落产生了广泛的直接和间接影响，最近的工作已经开始探索营养物质改良剂对叶面内生菌的影响。内生菌经常对其宿主植物产生巨大的影响（Nature | 年度重磅合集：植物微生物组！Nature Reviews Microbiology | 植物-微生物互作：从群落组装到植物健康）。表征这些群落成员之间的关系主要集中在确定单一微生物对其宿主的影响，但通常忽略了自然群落中无数微生物之间的相互作用以及潜在的高阶相互作用。

国际权威学术期刊The ISME Journal发表了美国明尼苏达大学Linda  Kinkel团队的最新相关研究成果，题为Network structure of resource use and niche overlap within the endophytic microbiome的研究论文。

网络分析提供了一个强大的手段来描述植物生物群的微生物成员之间的相互作用模式，这可能是调解其组装和功能的关键。科研人员对12个内生植物群落进行了采样，比较了共存的细菌和真菌之间的生态位重叠模式，以评估营养补充对当地和全球竞争网络结构的影响。科研人员发现，尽管程度分布有差异，但在持续的营养物质修正后，生态位重叠网络的全球网络结构几乎没有明显差异。同样，科研人员发现无论养分处理如何，高阶互动的特异性和弱化证据。这项工作首次提供了内生植物群落中生态位-重叠网络结构的特征，并作为更高分辨率分析微生物相互作用网络的框架，作为微生物组功能的生态变化的结果和原因。

图1：通过对每对共同出现的分离株之间的营养成分的平均化计算出的生态位重叠的分布情况

图2：测量95个碳基质的资源使用情况而产生的12个生态位-重叠网络

图3：根据分离株和宿主植物的处理，各分离株的入度和出度

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