世和学术 | NGS助力构建多灶性肺腺癌鉴别诊断新模型
✦ +
+
导语
多灶性肺腺癌(MLA)分为多原发肺腺癌(MPLAs)和肺内转移癌(IPMs)两种,准确区分两种不同类型的疾病,在临床病理分期和后续治疗中具有重要意义。临床工作中,多灶性肺腺癌的鉴别诊断,无论是对病理学家还是临床医生都非常具有挑战性。
中国医科大学附属第一院胸外科许顺教授团队与世和基因合作,采用世和一号®大Panel检测,分析pN0M0多灶性肺腺癌分子突变特征,同时结合组织学特征,开发了一种基于NGS,可准确鉴别多原发肺腺癌和肺内转移癌的新模型。相关研究成果已发表Journal of Pathology Clinical Research(IF=4.373)。
专家简介
许顺 教授
中国医科大学附属第一医院
胸外科主任、博士生导师、主任医师
国务院特殊津贴专家、国家二级教授
中国医科大学肿瘤研究所肺癌研究室主任
中华医学会胸心血管外科分会委员会委员
中华医学会胸心血管外科学分会肺癌学组委员、胸腔镜微创外科学组委员
中国医师协会胸外科医师分会纵隔与胸壁外科专家委员会委员
辽宁省医学会胸外科分会主任委员
吴阶平医学基金会李厚文肺癌医学教育发展基金会秘书长
辽宁省肺癌防治协会会长兼法人
辽宁省医师协会外科医师分会副会长
辽宁省抗癌协会副主任委员
沈阳市医学会胸外科分会主任委员
中国医疗保健国际交流促进会胸部肿瘤分会常务委员
中国医疗保健国际交流促进会胸外科分会副主任委员
中国医药教育协会肺癌医学教育委员会副主任委员
中国医疗保健国际交流促进会加速康复外科分会胸外科学组副组长
✦ +
+
研究亮点
1、基于NGS检测结果,初步建立基因相似性评分模型,尝试区分多原发肺腺癌和肺内转移癌。
2、NGS评估标准进一步结合组织学评估,可更加准确地鉴别多原发肺腺癌和肺内转移癌。
✦ +
+
研究方法
研究纳入了45例经组织学评估(Comprehensive Histologic Assessment,CHA)为pN0M0的多原发肺腺癌(101对病变样本)和5例肺内转移癌(14对病变样本),进行世和一号®大Panel检测。同时选取197例单病灶肺腺癌(随机病变样本)NGS测序数据进行外部验证。
✦ +
+
研究结果
多灶性肺腺癌患者临床病理特征
在45例MLA患者中,女性32例,男性13例,根据影像学分型,可分为三组:31例(68.9%)为多发磨玻璃结节(multiple-GGN),即病灶表现为纯GGN或混合GGN;9例为实性GGN;5例为多发实性病变。
表1. 多灶性肺腺癌患者临床病理特征
pN0M0多原发肺腺癌和肺内转移癌具有相同的遗传特征
研究者对45例多原发肺腺癌组织和15例肺内转移癌组织进行NGS检测,发现多原发组织中突变频率最高的基因为EGFR(63.3%)、TP53(26.6%)、BRAF(18.0%)、KRAS(14.8%)、TERT(8.6%)、PIK3CA(7%)和ERBB2(6.2%)(图1A)。肺内转移癌组织显示出相似的基因谱,EGFR(73.3%)、TP53(66.7%)、NFE2L2(33.3%)和TERT(26.7%)突变频率最高(图1B)。45例多原发肺腺癌基因改变以非同义突变为主,50%以上患者具有共同的非同义突变,其余患者无共同的非同义突变(图1C)。
图1. pN0M0多原发肺腺癌基因突变特征(A);肺内转移癌基因突变特征(B);45例患者113个病变的体细胞突变分布(C)
初步NGS模型,尝试区分多原发肺腺癌和肺内转移癌
基于NGS检测结果,使用基因相似度评分和非同义共突变数量构建初步NGS模型:基因相似度评分≥0.4可有效区分多原发肺腺癌和肺内转移癌(表2)。使用基因相似度评分模型,对197例单病灶肺腺癌配对样本进行分析,有效鉴别96.9%配对肿瘤患者为多原发肺腺癌。进一步使用该模型对45例pN0M0多原发肺腺癌配对样本进行鉴别,14对样本被归类为肺内转移癌,其中7例存在误诊。
表2. 肺内转移癌基因相似度评分
优化NGS模型,成功鉴别多原发肺腺癌和肺内转移癌
使用非同义共突变数量和基因相似性评分的同时,结合组织学评估结果(图2A),优化NGS模型,对单病灶肺腺癌配对样本均完成正确分类(图2B)。
图2. 优化后的NGS模型示意图(A);使用优化后的NGS模型鉴别已知MPLAs(B)
使用优化后NGS模型鉴别诊断,PFS分离更为明显
45例组织学评估为pN0M0的多原发肺腺癌,中位随访时间为20个月。使用初步NGS模型,10例患者被归类为IPM,其无进展生存期(PFS)明显低于其余35例患者(p=0.0026;图3A)。使用优化后的NGS模型,5例患者被诊断为IPM,MPLA和IPM之间PFS分离更为明显(p<0.0001;图3B)。
图3. 初步NGS模型PFS图(A);优化后NGS模型PFS图(B)
✦ +
+
结语
多灶性肺腺癌的临床治疗难点是对多原发肺腺癌或肺内转移癌进行鉴别,目前尚无明确的指南或方法,容易造成误诊和误治。本研究开发了一种基于NGS检测结果的新模型,可准确区分多原发肺腺癌和肺内转移癌,其结果与临床预期一致,证实了NGS可作为传统CHA诊断的补充。通过提高多灶性肺腺癌的鉴别诊断率,更好地指导治疗方案,提升预后预测的准确性。
参考文献
Zhang X, Fan X, Sun C, Wang L, Miao Y, Wang L, Yang P, Xu Y, Ren X, Wu X, Xu S. A novel NGS-based diagnostic algorithm for classifying multifocal lung adenocarcinomas in pN0M0 patients. J Pathol Clin Res. 2022 Dec 29. doi: 10.1002/cjp2.306. Epub ahead of print. PMID: 36579550.
作者:YW 审核:胖胖的鹏 排版:Moro
相关阅读
柳叶刀子刊发表肺肠型腺癌DNA甲基化辅助诊断模型,诊断准确率超95%!
世和基因致力于肿瘤精准医疗、伴随诊断及临床转化研究,为医院提供一站式NGS解决方案;中国独角兽企业
NGS及液体活检实验室获CAP / CLIA / ISO15189三重国际认证,213次通过国家卫健委临检中心室间质评
公司核心技术人员参与发表以及公司参与临床研究项目发表SCI论文近500篇,总影响因子(IF)超4000分;2020年度江苏省科学技术二等奖:“肺癌精准医学高通量测序检测技术的创新与产业化”项目;拥有发明专利33项(其中境内31项)
2018年,公司研发的“EGFR / ALK / ROS1 / BRAF / KRAS / HER2基因突变检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”获得国家药监局注册审批,系国内同期首批获准上市的肿瘤伴随诊断高通量基因检测产品之一
基于ATG-Seq等液体活检技术的CALIBRATE系列多癌种围术期大型临床研究成果相继发表。2021年5月,前瞻性多中心早中期肠癌术后ctDNA MRD大型临床研究(CALIBRATE-CRC)成果发表于J Hematol Oncol(IF=23.2);2021年9月,液体活检预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究(CALIBRATE-RC-nCRT)成果发表于PLoS Med(IF=11.6);2021年11月,前瞻性早中期肺癌术后ctDNA MRD大型临床研究(CALIBRATE-NSCLC)成果发表于Nature Comms(IF=17.7);2022年5月,ctDNA预测局晚期NSCLC精准放化疗疗效大型临床研究(CALIBRATE-LC/EC-CRT)成果发表于Mol Cancer(IF=41.4);2022年10月,前瞻性早中期肺癌术后MRD ctDNA克隆分析大型研究(CALIBRATE-LuCaTH)成果发表于J Hematol Oncol(IF=23.2)。此外,世和正将MERCURY技术应用于多项MRD研究。2022年10月,基于MERCURY多组学技术预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究(M-CALIBRATE-RC-nCRT)成果发表于Clinical Chemistry(IF=12.2)
基于MERCURY多组学液体活检技术的DECIPHER系列多癌种早筛研究成果相继发表。2021年10月,大型肠癌早筛临床研究(DECIPHER-Colon)成果发表于J Hematol Oncol(IF=23.2);2021年12月,大型肝癌早筛临床研究(DECIPHER-Liver)成果发表于Hepatology(IF=17.3);2022年6月,国内首个大型泛癌种早筛研究(DECIPHER-Multi)成果发表于Mol Cancer(IF=41.4);2022年6月,国内首个基于cfDNA Motif特征的肺癌早筛大型临床研究(DECIPHER-Lung)成果发表于eBioMedicine(IF=11.2);2022年11月,大型肺癌早筛临床研究(DECIPHER-Lung 2)成果发表于Am J Respir Crit Care Med(IF=30.5)
公众号关注我们
世和基因官网
看到这里都是真爱,动动手指点个赞吧