【ASCO 2024】世和基因12项研究助力肿瘤早筛及生物标志物探索
2024年美国临床肿瘤学会年会（ASCO）于当地时间5月31日至6月4日在芝加哥盛大召开。世和基因与临床专家合作的12项研究成果在年会上亮相。这12项研究涵盖肿瘤早筛早诊、MRD临床应用、临床治疗生物标志物探索以及HRD技术创新与应用等。在此，小编将为大家重点解读其中的5篇壁报（Poster）。
肿瘤早筛研究
研究一：Poster，3613
A multi-center study for colorectal cancer early detection among high-risk disease patients using cell-free fragmentomics assay
合作单位：广东省人民医院顾兵教授团队
研究亮点：
基于世和基因MERCURY多组学技术分析来自5家医院的167例结直肠癌和217例良性肠道疾病（BCD）患者的血浆cfDNA片段组学特征，构建了结直肠癌和良性疾病鉴定模型。该方法结合了低通量WGS和机器学习算法，可准确区分结直肠癌和良性结直肠疾病患者。
研究结果：
1. 基于片段组学特征构建结直肠癌和良性肠道疾病鉴别模型，训练集和独立验证集的AUC分别达0.930和0.926；
2. 模型的性能显著优于传统的结直肠癌筛查方法：粪便免疫化学试验(FIT)、CEA和CA19-9的AUC分别为0.742、0.720和0.543；
3. 该模型区分高级别大肠腺瘤（advCRA）和BCD的AUC达0.846，灵敏度为66.7%，显示了良好的预测性能。
研究二：Poster，4054
Leveraging cfDNA fragmentomic features in a stacked ensemble model for early detection of esophageal squamous cell carcinoma.
合作单位：南京鼓楼医院王涛教授团队
研究亮点：
入组243例食管鳞状细胞癌和256例健康人（包括来源于南昌大学附属第二医院的外部队列44例食管癌和47例健康人），基于世和基因MERCURY多组学技术分析受试者的cfDNA片段组学特征，基于4种片段组学特征建立食管鳞状细胞癌早期筛查模型，并在独立外部队列中验证模型的普适性，在低覆盖度和重复测量样本中评估模型的稳健性和可重复性。
研究结果：
1. 在训练集中以特异性98%选定cutoff值为0.69时，模型在内部独立验证队列中的灵敏度为91.8%，特异性为98.1%，AUC为0.986。在外部队列中的灵敏度为86.4%，特异性为95.7%；
2. 在低至0.5×的测序覆盖深度下，模型依然保持稳定的预测性能，AUC为0.978，具有较高的临床落地可行性；
3. 该模型在识别早期病变方面具有高度的灵敏性，对于I期病变的灵敏度为94.1%，对于直径小于3cm的肿瘤，灵敏度为91.4%。
研究三：Poster，6110
A non-invasive cfDNA fragmentomics assay for differentiating malignant and benign thyroid nodules
合作单位：中山大学附属第一医院吕伟明教授团队
研究亮点：
基于世和基因自主研发的MERCURY多组学技术，分析161例早期甲状腺癌（154例Ⅰ期，7例Ⅱ期）和161例良性甲状腺结节患者（68例Ti—Rads4-5，93例Ti—Rads2-3）的血浆cfDNA片段组学特征，开发甲状腺癌和良性甲状腺结节鉴别诊断模型。该模型可有效识别直径小于1cm的结节，从而减少与手术活检相关的不适和风险。
研究结果：
1. 基于片段组学构建的甲状腺癌和良性甲状腺结节鉴别诊断模型，训练集和独立验证集的AUC分别为0.973和0.965。并且该模型表现出非常高的敏感性，训练队列中灵敏度94.7%，特异性89.8%，验证队列中灵敏度95.5%，特异性77.8%；
2. 该模型可以有效识别传统方法难以检测到的直径小于1cm的恶性结节，在训练队列和验证队列中的灵敏度分别为92.4%和91.6%；对于直径大于1cm的结节，模型在两个队列中都实现了100%的灵敏度。
MRD研究
研究四：Poster，6524
Molecular characterization and biomarker identification in pediatric B-cell acute lymphoblastic leukemia
合作单位：武汉儿童医院熊昊教授团队
研究亮点：
前瞻性入组146例初诊的儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者，收集基线骨髓（BM）和血浆样本，以及治疗第19天的骨髓样本。所有样本采用世和基因血默胜™进行检测，基线骨髓样本额外进行全转录组测序，以全面揭示儿童B-ALL的分子特征，并评估基线血浆ctDNA和骨髓MRD作为B-ALL治疗疗效生物标志物的临床应用价值。
研究结果：
1. 基于骨髓样本转录组分析，86.3%（126 / 146）的患者被分类为13种不同的分子亚型，其中多倍体型是占主导地位的亚型。基线骨髓NGS发现了61%的患者存在基因融合，包括37种之前未在B-ALL中报道过的新型融合；
2. 骨髓样本中突变数量的增加以及基线骨髓样本的最大变异等位基因频率（maxVAF）与化疗反应较差显著相关。MRD阴性患者表现出免疫相关途径的上调表达（p<0.01）和CD8+ T细胞浸润的增加（p=0.047），表明对治疗反应较好的肿瘤具有更活跃的免疫微环境；
3. 基线血浆ctDNA与配对的骨髓样本中的突变高度一致，且与化疗疗效显著相关。
靶向治疗研究
研究五：Poster，8596
Genomic profiling of non-small cell lung cancer with rare aberrations in EGFR codon L858 and improved survival under real-world first-line EGFR tyrosine kinase inhibitor treatment compared to classic EGFR L858R
合作单位：浙江大学医学院第二附属医院林鹏教授团队
研究亮点：
回顾性纳入489例在未经治疗的肿瘤组织或血浆中检出EGFR L858突变的NSCLC，包括少见EGFR L858R (N=124)、EGFR L858Q/M (N=17)以及典型EGFR L858R突变(N=348)。使用世和一号®大Panel分析少见EGFR L858患者的分子特征，并探究其接受EGFR TKI一线治疗的生存获益以及耐药机制，为这些携带罕见突变的患者临床应用EGFR TKI提供了科学依据。
研究结果：
1. 与携带典型EGFR L858R的患者相比，少见EGFR L858R的患者TP53突变频率较低（59% vs. 72%），且染色体不稳定性（CIN）评分较低（0.29 vs. 0.23）。EGFR L858Q/M可与EGFR L861Q共存，尤其是在携带EGFR L858M的患者中；
2. 与典型EGFR L858R的患者相比，携带少见EGFR L858R及EGFR L858Q/M的患者接受一线EGFR TKI治疗有更优的无进展生存期（PFS）。另外，同时携带EGFR L858M和EGFR L861Q突变的患者，一线治疗使用阿法替尼比吉非替尼/埃克替尼的进展风险更低；
3. 基于基线与进展时的配对样本，研究揭示了携带少见EGFR L858突变的患者与典型EGFR L858R的患者之间存在类似的耐药机制。
结语
世和基因秉承“患者至上、学术为先”的宗旨，加大研发创新与临床转化，与国内众多顶尖临床专家开展科研合作，连续10年参与ASCO、AACR、WCLC、ESMO、ASTRO、ASH等国际大型会议，迄今已中稿240余项研究成果。核心技术人员参与发表SCI论文超650篇，累计影响因子超4800分，在肿瘤伴随诊断、围术期复发管理、肿瘤早筛领域取得多项突破性成果。我们希望携手更多临床专家，通过一项项扎实的学术研究，给肿瘤患者带来更多的治疗选择和希望。
作者：燕子 审核：简爱 排版：Moro
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世和基因致力于高通量测序技术的临床转化应用，为肿瘤精准医疗提供分子诊断服务和产品，并为医院提供一站式NGS解决方案
NGS及液体活检实验室获CAP / CLIA / ISO15189三重国际认证，256次通过国家卫健委临检中心室间质评
公司核心技术团队参与发表SCI论文超650篇，总影响因子(IF)超4800分；2020年度江苏省科学技术二等奖：“肺癌精准医学高通量测序检测技术的创新与产业化”项目；拥有发明专利58项（其中境内55项）
2018年，公司研发的益胜康™“EGFR / ALK / ROS1 / BRAF / KRAS / HER2基因突变检测试剂盒（可逆末端终止测序法）”获得国家药监局注册审批，系国内同期首批获准上市的肿瘤伴随诊断高通量基因检测产品之一
2023年，公司研发的世和一号®NGS大Panel TMB试剂盒获得国家药监局创新审批上市，是国内肿瘤基因检测行业的首个NGS大Panel体外诊断产品
基于ATG-Seq等液体活检技术的CALIBRATE系列多癌种围术期大型临床研究成果相继发表。2021年5月，前瞻性多中心早中期肠癌术后ctDNA MRD大型临床研究（CALIBRATE-CRC）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2021年9月，液体活检预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究（CALIBRATE-RC-nCRT）成果发表于PLoS Med（IF=15.8）；2021年11月，前瞻性早中期肺癌术后ctDNA MRD大型临床研究（CALIBRATE-NSCLC）成果发表于Nature Comms（IF=16.6）；2022年5月，ctDNA预测局晚期NSCLC精准放化疗疗效大型临床研究（CALIBRATE-LC/EC-CRT）成果发表于Mol Cancer（IF=37.3）；2022年10月，前瞻性早中期肺癌术后MRD ctDNA克隆分析大型研究（CALIBRATE-LuCaTH）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2023年10月，前瞻性早中期胃癌MRD队列研究（CALIBRATE-GC）成果发表于Cancer Commun（IF=16.2）。此外，世和正将MERCURY技术应用于多项MRD研究。2022年10月，基于MERCURY多组学技术预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究（M-CALIBRATE-RC-nCRT）成果发表于Clin Chem（IF=9.2）；2023年5月，基于MERCURY多组学技术预测NSCLC术后复发风险的前瞻性大型临床研究（M-CALIBRATE-LuCaTH）成果发表于Cancer Res Comms
基于MERCURY多组学液体活检技术的DECIPHER系列多癌种早筛研究成果相继发表。2021年10月，大型肠癌早筛临床研究（DECIPHER-Colon）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2021年12月，大型肝癌早筛临床研究（DECIPHER-Liver）成果发表于Hepatology（IF=13.5）；2022年6月，国内首个大型泛癌种早筛研究（DECIPHER-Multi）成果发表于Mol Cancer（IF=37.3）；2022年6月，国内首个基于cfDNA Motif特征的肺癌早筛大型临床研究（DECIPHER-Lung）成果发表于eBioMedicine（IF=11.1）；2022年11月，大型肺癌早筛临床研究（DECIPHER-Lung 2）成果发表于Am J Respir Crit Care Med（IF=24.7）