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向“粪便”要“黄金”!看这家公司如何“淘出”创新微生物组疗法

药明康德 药明康德 2021-10-28

▎药明康德/报道


引子


“得了这个病以后,腹泻与我如影随形:没有任何预兆,不管是躺在床上,还是吃饭、散步,甚至是开车,便意突然袭来;身上、衣服上、床单上沾染的那些臭烘烘的秽物,让我屡屡无地自容……”


一位罹患艰难梭菌感染(CDI)的患者,在信中这样描述患病时痛苦的经历。艰难梭菌(Clostridium difficile)是一种革兰氏阳性、专性厌氧的梭状芽孢杆菌,感染症状从轻度腹泻直至危及生命的伪膜性结肠炎。CDI是最常见的医院获得性感染之一,仅在美国,每年就有约50万人成为CDI的受害者,并导致近3万人死亡。美国疾病控制和预防中心(CDC)将CDI列为对公共卫生的“紧急威胁”。

 

▲艰难梭菌(图片来源:美国CDC)


目前,CDI的常规治疗手段是使用抗生素,如万古霉素,糟糕的是,由于艰难梭菌往往表现出较强的抗药性,抗生素不但难以根除,反而常促使其反复发作。很多研究均显示,有相当比例的患者在首次感染治愈后仍会复发,而传统药物此时的表现大多乏善可陈,使得复发性艰难梭菌感染(rCDI)成为诊治过程中的一大难点。


迎击rCDI,人类屡屡受挫,如何走出困境?总部位于美国马萨诸塞州的生物科技新锐Finch Therapeutics公司探索出了一条新路:该公司以粪便微生物群移植(FMT)为基础,开发出一种新型微生物组疗法——CP101。2019年,CP101获得美国FDA的突破性疗法认定,向着满足rCDI患者巨大的未竟医疗需求迈出了坚实的一步。在今天的这篇文章里,药明康德内容团队邀请到了Finch Therapeutics首席执行官Mark Smith博士,请他为我们讲述这场与“粪便”有着不解之缘、对抗rCDI的精彩战役。

 

▲Finch Therapeutics首席执行官Mark Smith博士


FMT小传


尽管听起来有点恶心,但用粪便治病,其历史可谓源远流长。在中国,早在1000多年前的东晋时期,名医葛洪就曾在《肘后备急方》中记载了用粪便治疗食物中毒和腹泻者,“绞粪汁,饮数合至一二升,谓之黄龙汤,陈久者佳”;此外,宋朝人陈文中的《小儿痘疹方论》、明朝医药学家李时珍所著《本草纲目》中,均列有以粪便入药的方子。而在西方,公元17世纪,意大利解剖学家法布里齐乌斯亦利用粪便给动物治病。不过需要指出的是,过去那些形形色色的粪便疗法主要是经验的总结,且多用于急救,对其中的作用机理并不清楚。随着人们认知水平的不断提升,到了现代,医学上已从平衡胃肠道微生物的角度来考虑粪便的药用价值,rCDI便是其重要目标之一。


所谓FMT,是指将健康人粪便中的功能微生物群,以某种方式移植到患者肠道内,调节肠道微生物群失衡,重建具有正常功能的肠道微生态系统,为治疗疾病提供帮助。“在应对艰难梭菌时,用抗生素治疗往往会破坏肠道微生物群的平衡,造成复发。为了解决这一问题,许多临床医生现在使用FMT来治疗抗生素治疗失败的rCDI患者。” Mark Smith博士表示。事实上,自1958年首次报道利用FMT治疗CDI病例以来,其后数十年间开展的多项研究均表明,利用FMT治疗rCDI可以取得不错的疗效。


不过,尽管表现不俗,FMT并不完美,它的短板也很明显。“一个非常大的问题是,FMT治疗多采用侵入性手段,如鼻肠管、灌肠,以及我们经常见到的,通过结肠镜检查——这意味着事先要进行肠道准备,这个过程往往令患者痛苦不堪。” Mark Smith博士称。此外,粪便来源可控性存疑也带来了隐患,“在美国,尽管有不少取自OpenBiome(一个严格筛选捐赠者的非营利性粪便库),但也有一部分来自其他组织——它们的捐赠者筛选协议和流程大相径庭。” 


如何消除传统FMT疗法的“痛点”?CP101给出了自己的答案。

新一代疗法——CP101


CP101是谁?它其实是一款全谱微生物(Full-Spectrum Microbiota™)产品。以专有平台为依托,Finch Therapeutics采用创新机器学习算法,基于高通量微生物分子数据,反向分析推导构建成功这一微生物组疗法。Mark Smith博士认为,它克服了传统FMT疗法固有的某些弊端,“CP101是基于微生物群的新一代疗法,突破了现有选择的局限性。有别于传统FMT疗法,CP101是一种口服胶囊,包含来自经过严格筛选及测试的人类捐赠者的多种冻干微生物群,并且严格按照GMP标准生产。口服给药法能够显著改善患者体验。而且,因为对微生物群进行了冻干处理(传统FMT疗法需要进行冷冻操作),简化了供应链,使医院更容易储藏。” 


CP101旨在防止CDI复发。“CDI初发患者经抗生素治疗后,有20%会复发;而在复发患者中,又有40%-65%会再度发作。” Mark Smith博士表示。面对如此顽固的对手,CP101仍然交出了一份漂亮的成绩单:2017年,明尼苏达大学(University of Minnesota)开展的一项有49名患者参与的临床研究中,两个月内,有88%的患者未出现CDI复发——与经抗生素治疗公布的复发率相比,在临床上复发率大幅下降。相比现有疗法,CP101在部分具有临床意义的重要终点上显示出可能有实质性改善,FDA也因此在2019年授予其突破性疗法认定。
 

▲在一项临床研究中,88%的患者在接受CP101治疗后未出现CDI复发(图片来源:参考资料[3])


在Mark Smith博士看来,想要开发有效的治疗方法,FDA所扮演的角色非常重要,它制定的突破性疗法认定等举措能够促进开发者设计更好的试验、更顺利地通过必要的监管程序。Mark Smith博士表示,CP101获得突破性疗法认定,使公司从FDA得到更多支持,也保证了融资的顺利开展,更重要的是,它加速了通往rCDI患者的步伐。Finch Therapeutics不久前还收到了一个好消息:FDA发出信号,如果该公司进行中的PRISM3(目前处于2期临床试验阶段)的统计结果符合FDA的最高标准,它有望被视为一项关键性试验,让CP101在无须进行3期临床试验情况下获得批准。

新的战场


除了rCDI,Finch Therapeutics正在开辟新的战场——开发与肠道微生物群紊乱相关的一系列疾病和症状的新疗法。“人体内的微生物对健康的影响比之前认为的要大得多,” Mark Smith博士说,“癌症、自身免疫疾病(如类风湿性关节炎、多发性硬化症,以及帕金森病等中枢神经系统疾病)以及食物过敏和肥胖症,均与之有着千丝万缕的联系。”


值得一提的是,Finch Therapeutics并未遵循传统的药物发现过程,而是从干预性研究的概念验证数据入手,识别有意义的微生物特征。Mark Smith博士表示,手握全谱微生物群(FSM®)平台(可开发包含来自健康人类供体的多种微生物群的疗法),以及理性选择的微生物群(RSM™)平台(可开发在纯培养基中培育的精选微生物的疗法)这两大利器,公司有信心在多条战线取得突破。


事实上,Finch Therapeutics正在开展的一个儿童自闭症谱系障碍(ASD)项目,新近获得了FDA的快速通道资格,它还在与武田(Takeda Pharmaceutical Company)公司合作开发一种治疗溃疡性结肠炎的新疗法。此外,为了进一步了解微生物群的治疗潜力,该公司亦在支持一些研究者发起的临床研究,这些研究涉猎广泛,包括神经疾病、肝病、传染病和胃肠道疾病等领域。

结语


《诗经·小雅·鹤鸣》有云:“他山之石,可以攻玉。” CP101的研发过程带给广大药物开发者怎样的启示?Mark Smith博士给出了一个深刻洞见:尽早将临床数据引入开发过程,对规避风险和制定产品战略至关重要。“我们的微生物组疗法具有良好的安全性,促使我们快速生成概念验证性临床数据(proof-of-principle clinical data)。利用这种方法,我们得以迅速进入CP101的临床试验并获取相应数据,最终拿下突破性疗法认定,并启动潜在的关键性试验。尽管其他公司未必具备我们公司这些独特的发现平台,但在开发早期将决策与临床数据联系在一起,是一个非常重要的原则。” 


“路漫漫其修远兮,吾将上下而求索。”人类与疾病的战争永远不会停止,我们期待Finch Therapeutics的创新微生物组疗法能够打赢一场又一场歼灭战,为全球病患带来希望的曙光。


参考资料:

[1] Finch Therapeutics Taps into the Human Microbiome to Find Disease Causes and Cures. Retrieved September 19, 2019, from https://wxpress.wuxiapptec.com/finch-therapeutics-taps-into-the-human-microbiome-to-find-disease-causes-and-cures/

[2] Fecal Transplants Bring Hope to Patients, Challenge the FDA. Retrieved December 15, 2014, from https://www.medscape.com/viewarticle/836225_2

[3] Staley C,et al.,(2019). Successful Resolution of Recurrent Clostridium difficile Infection using Freeze-Dried, Encapsulated Fecal Microbiota; Pragmatic Cohort Study. Am J Gastroenterol, doi: 10.1038/ajg.2017.6


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