查看原文
其他

一篇不花钱就能白嫖的文章

Biomamba Biomamba 生信基地 2023-06-15
最近有同学发问,有一颗做NGS的心,却没有测NGS的经费,怎么破?恰好读到了这篇文章,我想这就是终极答案
这篇文章不仅没有花费经济成本,花费的时间成本也十分有限,在这篇文章中并没有做到所谓的大数据分析,用到的样本不过三组GEO数据(GSE131882、GSE30122、GSE30529),共63例DKD肾脏样本与73例健康肾脏样本(来源均为人体),不考虑学习的时间成本,这篇文章两个月内应该足够定稿,但IF=3.69。下图为该文中提到过的所有R包与在线工具及其用途,其中DAVID(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)是一个对非代码生信者十分友好的在线工具。

这篇文章最后的分析结果主要为sTNE、单细胞marker heatmap、相关性热图、差异基因火山图与热图、PPI、基因与临床指征的线性回归分析,这些结果如下图所示。
sTNE

单细胞marker heatmap

热图

差异基因火山图与热图

PPI

基因与临床指征的线性回归分析


其实数据挖掘的套路大都是:选取研究疾病模型→搜集文献资料→下载数据→处理数据、完成可视化→撰文投稿。
最后,有数据挖掘想法的朋友可以后台私聊我合作,带着您的idea与疾病模型,代码与分析的事情,就交给我好啦。

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存