（文章篇）S5E04：从lncRNA文章设计出国自然基金

好久没有写有关lncRNA的文章了，在第三季我们介绍了很多lncRNA有关的内容，应要求介绍一篇文章自噬和lncRNA有关的文章：LncRNA NBR2 engages a metabolic checkpoint by regulating AMPK under energy stress.Nat Cell Biol（IF 19.6）. 2016 Apr;18(4):431-42. 下载链接：http://pan.baidu.com/s/1jIKvViY 密码：5f8i。 因为从文章出发设计基金是大家最常用的一种方式，所以今天我们换种方式看如何从一篇文章中提取基金标书的要素。

这篇文章的主角是lncRNA NBR2 (neighbourof BRCA1 gene 2)，是根据与周围基因的位置来命名的（关于lncRNA命名的五种方式，可点击查看），如果按照文章的思路来设计基金的话，基金名字是：LncRNA NBR2-AMPK信号通路正反馈回路促进细胞自噬抑制肿瘤的功能和机制研究。

题目已经有了，我们看研究内容：

1. 临床水平：TCGA数据库显示关键新分子lncRNA NBR2在乳腺癌和肾癌样本中低表达，且低表达预示病人良好预后；

 2. 细胞功能：通过RNAi技术研究lncRNA NBR2乳腺癌、肾癌细胞株增殖、周期、克隆形成、凋亡和自噬的影响。

3. 动物功能：裸鼠成瘤实验研究lncRNA NBR2沉默表达后对瘤块大小的影响，并取瘤块通过WB检测AMPK等蛋白表达。

4. 分子机制：这部分又包括五部分：

首先证明AMPK信号通路与lncRNA NBR2的互相激活，分为两部分

• AMPK信号通路对lncRNA NBR2的表达上调；

• lncRNA NBR2对AMPK信号通路的激活以及对下游自噬相关通路的调控；

Compound C: AMPK抑制剂   A769662 :AMPK激活剂

即通过AMPK抑制剂和激活剂来调控AMPK信号通路，来检测对lncRNA NBR2表达的影响。

• lncRNA NBR2与AMPK的直接作用，明确两者结合的具体序列（NBR2）和结构域（AMPK），一般以RNA-Pulldown和RIP技术为主，这里还加上了对NBR2分子不同剪接异构体的检测。

• 通过体外激酶活性实验进一步探索lncRNA NBR2激活AMPK的方式

体内外功能回复实验证明lncRNA NBR2发挥功能依赖AMPK

实验内容部分可以设计为以上四个层面的内容，最后我们根据文章内容绘制假说图：

研究方法可以参考文章中的方法部分，关键技术可以写RIP、RNA Pulldown等。

更多lncRNA有关文章和研究策略，请看：

关于自噬：

关于反馈回路：

关于lncRNA与不同分子作用模式的文章：

关于lncRNA作用机制：

That’s all. Thank you!

---

请关注“小张聊科研”：搜索微信号“xzlky2015”，或长按二维码识别关注。

↓↓↓