点点鼠标就能发文章?急需文章的同学参考一下！

自从国家倡导科研创新强国以来，不管是专业型还是学术型生物医学生都要积极做科研，发文章。发表论文的重要性相信在座的各位同行们都懂（虽然我有时候也无法理解临床医生为何要花更大精力在基础科研上），因为它关系到我们是否能按期毕业、申请基金、晋升职位甚至是走上人生巅峰。

虽然明白科研论文的重要性，但是作为日理万机，既缺少科研经费又没有时间的青年医生，我们的科研之路该何去何从？要是以前，我肯定推荐大家去写meta分析，但是随着高校、科研院所以及医院对meta分析的排斥，这条路已经行不通了。如何才能既不花钱又不花时间做实验就能快速发文章呢？

今天笔者就给大家分享一个纯生信的数据挖掘文章套路，急需文章的同学可以参考一下，好好研读！

这篇文章的题目是“Investigation of miR-136-5p key target genes and pathways in lung squamous cell cancer based on TCGA database and bioinformatics analysis"，通讯作者是广西医科大学第一附属医院的胡晓桦教授。

研究背景

根据神刊CA杂志发布的2018年全球癌症统计报告，肺癌已经成为病发率和死亡率最高的癌症类型。肺癌可以分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌，后者又可以分为肺鳞状细胞癌(LUSC)，肺腺癌(LUAD)和大细胞肺癌(LCLC)。每年约有40万人死于肺鳞状细胞癌，但是目前针对肺鳞状细胞癌还没有特异的治疗方法，主要原因是LUSC的发病机制和生物标志物还不是特别清楚。本文通过各种肿瘤数据库进行数据挖掘分析发现miR-136-5p可以作为LUSC的关键靶基因，为LUSC的治疗和诊断提供新的策略。

研究思路

1. miR-136-5p在LUSC中表达水平

为了探究miR-136-5p对LUSC发生发展的影响，作者从TCGA数据库收集了44对LUSC肿瘤样本和癌旁组织样本。通过分析作者发现miR-136-5p在肿瘤组织中的表达量显著下调，这暗示miR-136-5p与LUSC的发生发展密切相关。

2. miR-136-5p靶基因预测及功能富集分析

接着探究miR-136-5p如何调控肿瘤的发生。通过microRNA靶基因预测网站，作者预测了miR-136-5p的靶基因。随后对这些靶基因进行重叠分析，总共获得538个候选靶基因。接着使用在线工具DAVID进行GO和KEGG分析，作者发现miR-136-5p主要的调控通路是抗坏血酸和醛酸代谢，葡萄糖醛酸代谢和视黄醇代谢。

3. PPI网络分析及关键靶基因挑选

接下来作者探究miR-136-5p调控肿瘤发生的关键靶基因。通过对538个重叠靶基因进行PPI网络分析，作者发现有12个靶基因在其中起着至关重要的作用，它们分别是UGT1A7, UGT1A9, UGT1A8, UGT1A6, UGT1A3, UGT1A4, UGT1A1, CYP2B6, ADH7, SRD5A1, CYP19A1和UGT1A10。

4. 验证关键靶基因表达水平

接下来作者对这12个靶基因进行更深层分析。由于在LUSC中miR-136-5p表达量下调，那其靶基因在LUSC中表达量应该是上调。通过使用GEPIA网站进行分析，作者发现UGT1A1, UGT1A3, UGT1A6, UGT1A7, UGT1A10, SRD5A1和ADH7这7个靶基因在LUSC中高表达，这就表明miR-136-5p通过调控这7个靶基因来影响肿瘤发生。

5. miR-136-5p与靶基因的相关性分析

为了进一步确定miR-136-5p和这7个靶基因的关系，作者分析了它们之间在LUSC中的相关性。发现UGT1A1, UGT1A3, UGT1A6, UGT1A7和ADH7与miR-136-5p呈负相关关系，而UGT1A10和SRD5A1与miR-136-5p无明显相关性，这表明UGT1A1, UGT1A3, UGT1A6, UGT1A7和ADH7这5个靶基因是miR-136-5p调控LUSC发生的关键基因。 

6. 靶基因的生存预后分析

从上述获得的着5个靶基因是否都影响LUSC的发生发展呢？为此，作者对这几个靶基因分别进行生存分析，发现只有UGT1A7和ADH7的表达与LUSC病人生存率有显著性关系。miR-136-5p很有可能通过UGT1A7和ADH7这两个靶基因来调控LUSC的发生。

总结

总结这篇文章，作者首先通过TCGA数据库分析发现miR-136-5p在LUSC病人样本中表达量下调，随后运用miRWalk2.0数据库预测它的靶基因。通过重叠分析获得538个重要靶基因，随后对这些靶基因进行GO和KEGG分析，获得miR-136-5p参与的主要信号通路。与此同时，通过构建PPI网络，发现这538个靶基因中有7个比较重要。随后分析这7个靶基因的表达量和LUSC发生以及miR-136-5p的关系，作者获得5个关键基因。最后，通过生存分析，最终确定miR-136-5p通过UGT1A7和ADH7这两个关键基因调控LUSC发生。

可以看到，整篇文章没有做任何实验，都是通过在线网站进行在线分析来获得结果。着急要文章毕业和晋升的科研同行们可以试试用这种方法快速发文章。

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9	组蛋白修饰	19	RNA甲基化修饰
10	蛋白激酶和磷酸酶	20	肿瘤微环境

而这些研究方向参与疾病发生发展过程的分子机制，可以归纳总结为一下几类研究：

①分子（DNA、RNA、蛋白质、小分子）的表观遗传修饰；

②分子拷贝数的表达变化差异；

③RNA分子的剪接加工、出核、细胞组织水平的时空变化研究；

④特殊的一群细胞类型研究、细胞通讯微环境研究；

⑤具有临床应用潜力的新技术（CRIPSR）或者载体（膜结构、细胞等）；

⑥关注细胞生理学现象：自噬、凋亡、线粒体失功等；

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