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沈玥:我们正在颠覆进化论,再造伊甸园 | 造就

2016-11-18 造就 造就

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华大基因x造就 联合呈现


沈玥

华大基因 深圳国家基因库合成与编辑平台负责人


有三个问题困扰了人类几千年——我是谁,我从哪来,我要去哪里?


究竟我们的生命的本质是什么,我们从怎么样的一个形式,演化而来,我们未来可能会变成什么样子?


从上帝决定论到基因决定论


在文明初期,关于这个问题,西方主要是以上帝创世纪的故事呈现,而东方则是盘古开天辟地,女娲造人的传说。


冥冥之中,大家都觉得有一个超越生命之上的存在,在掌控着生命,这好像已经成为一个共识,但是科学的发展使得我们摒弃了这样陈旧的观念。



从孟德尔用三万多株豌豆发现遗传的规律,到后来格里菲斯和艾弗里证明了DNA才是遗传物质的基础,再到富兰克林通过晶体衍射给DNA拍了照片,在这个基础之上,沃森和克里克又通过解析DNA,发现它原来是双螺旋结构……这样一步一步,我们慢慢对生命的本质有了一个清晰的概念。


那么下一步就是研究这些信息是怎么样构成生命的,这样简单的四个碱基,A、T、C、G,它是以怎么样的一个形式,使得我们人成为人,动物成为动物?

 

在20世纪的最后十年,“人类基因组计划”使这个问题有了决定性进展。



参与“人类基因组计划”的六个国家,用了13年的时间,花了30亿美金,完成了第一个个人的基因组的测定和描绘,这之后,我们才大概知道了原来生命是这个样子。


在这之后有成千上万的基因组得到解析,我们慢慢地知道了我们头发的颜色,五官的样子,我们的高矮胖瘦,为什么会这么不同。

 

除了人类之外,我们对其它的物种也有了遍地开花的研究,我们越来越了解到生命是怎么样演化过来的;我们也知道物种之间的相似处和差别是什么。


所有的这些秘密都藏在基因和基因组里面。


人类和老鼠有80%的基因相似却样子如此不同,因为基因一直在变化


比如说我们和植物只有17%的相似性,我们和小白鼠却有80%的相似性,我们和猴子、大猩猩的相似性已经超过90%,我们人和人之间这么不同,但是在我们的基因组上,也只有0.5%的差异。


基因这个生命密码,就像是一个启动生命的程序,但它并不是一成不变的,相反,它一直在变化的。



大家看到西兰花、卷心菜、花菜,这几种我们餐桌上非常常见的食物,它们长相不同,味道不同,但它们却是甘蓝这个2500年以前出现的植物,因为基因随机突变,长期自然选择之后演化出来的一些新的生物。

 

我们逐渐颠覆达尔文之后,有没有可能开始扮演上帝?


随着技术的发展,我们已经进入可以人为加速生命密码改变的阶段。


比如说线粒体缺陷的问题。


线粒体是细胞里面的一个细胞器,当这个很小的细胞器产生缺陷之后,会导致非常严重的结果,比如说先天性心脏病,失明或者是肝衰竭,并且线粒体缺陷是随着母亲向下遗传的,这也就意味着如果一个母亲是线粒体缺陷疾病的患者,那她的孩子无一例外一定都是患者。

 


而人为的干预可以改变这个情况。


我们把患病母亲的DNA通过核移植的方式,转运到另外一个健康女性的卵子里面,然后用这个卵子,来做受孕的载体,这样一来就可以使得她的孩子不再成为线粒体缺陷类疾病的患者。


他的基因,即他的生命密码,也由此发生了改变,这个改变逆转了他一定会得病的命运。

 

所以,四十亿年前,生命主要是依靠随机突变和自然选择的一个方式去生存的,而我们现在正在通过一种并行式的思路,把进化的过程加速,使它成为一种可以是非自然选择、定向变异的过程。




在某种程度上,我们已经在逐渐地颠覆达尔文的进化论。


紧接着下一个问题是,我们有没有可能扮演上帝,创造生命?


这里的人造生命不是指AI,不是指Alpha Go,而是指我们在DNA、RNA,以及一系列必需的物质基础上,创造出来的一个活生生的生命。


这个问题在2010年的时候就已经有了一个非常肯定的答案。


第一个人造生命是以计算机为母体


这是一个叫做支原体的基因组的一个序列,科学家通过计算机以及四种不同化学试剂的配合,可以从无到有地创造一个完整的基因组,然后把基因组转移到一个受体的细胞里面,这个生命的密码得以启动,使得这个细胞摇身一变,变成另外一个物种,我们把这个物种叫做“辛西娅”。

 

“辛西娅”是第一个以计算机为母体的一个生命,它的出现意味着什么呢?意味着我们可以以计算机为起点,创造一个生命。

 

大多数的细菌都是原核生物,相比较而言是比较低等的生物,而生命的高级形式是真核生物,比如说我们人就是真核生物。


能否创造一个人造的真核生物,这是造物的一个新的高度。



这个微生物叫做酿酒酵母,我们平时用它来做面包、馒头,用来酿酒。最近,我们的团队做了一个酵母2.0版本,这个2.0版本就是世界上第一个真核的人造生物。

 

跟“辛西娅”和酵母1.0相比较,它的区别是什么?

 

简单来说,我们不仅是重现了一个真核生命,我们同时使得它变成了一种工具。



举个例子,大家都知道胡萝卜素,它主要是从胡萝卜里面提取出来的,这个胡萝卜素在你摄取之后,可以转化成维生素a,它能够改善你的眼睛和皮肤的问题,那么这个酵母2.0作为工具,只要简单地通过外源基因的导入,就能生产胡萝卜素。


甚至我们可以控制它的产量。所以这意味着未来我们不需要有胡萝卜,就可以获得大量的胡萝卜素。



再举另外一个例子,屠呦呦因为成功地从这种叫做黄蒿的植物中提取出青蒿素,获得了去年的诺贝尔医学或生理学奖。


青蒿素是目前用来治疗疟疾的唯一有效的药物,但是在黄蒿里面提取率非常低,只有1%~5%左右,而如刚才所说,通过酵母外源基因的导入,就可以使得我们的酵母变成青蒿素的一个细胞工厂,利用这样的技术,一个简单的一个生产线,青蒿素年产量即可超过全球需求量的三分之一,这是一个非常可观的数字。

 

未来5年,合成生物成本降到目前的1%?


在回顾我们创造2.0版本的酵母人造生命的历程里面,我们发现它在基因组的解读上,也是有同样的趋势,就是从小到大,从简单到复杂。

 

而能够使得我们有这样的发展是因为技术的更新换代。

 


从我们测第一个基因组需要13年到今天我们只要一天的时间就能完成一个个体基因组的测序;同样,过去合成技术一开始一天只能有百级的产量,到现在每天有万级的通量,使得成本上有了一个非常大的变化。


我们把测序与合成的成本做了一个对比,取了一个log值,你可以看到在2003年,两者的成本还差不多是一致的,但是后来,尤其是过去的五年里面,测序成本急剧降低使得两者之间的成本有了百万级的差距。



在过去的几年里面,我们的团队一直专注于如何提升技术从而降低成本,现在我们可以非常自信地说,在未来的5~10年,我们可以把这个成本降到现在的百分之一。


那么这个技术的突破会带来什么呢?


有可能在不久的将来,它能使得我们这个世界再次进入“寒武纪”时代,有大量的新物种,可以通过数字化的设计而产生。


合成生物学将解决90亿人口在地球生存的问题


大家可能会问,为什么我们要做这样的事情?


我们现在整个世界的人口是60亿,但是在不到40年的时间,这个60亿马上会变成90亿。


我们现在所有的食物、清洁能源以及我们的医药,都是围绕这60亿来准备,满足60亿人口就已经非常困难,更不用提90亿人口会是怎么样的一个挑战。

 

而合成生物学的知识和技术有可能改变这种现状。

 

“人造生命”、“新物种”这样的概念,已经不再是离我们很远的事情,好像科幻片里面才有的,它现在就在发生,这一刻就在发生。



在不久的将来,我们也许可以通过生物合成新物种的方式让更高效、更清洁的能源,全面取代传统能源;


青蒿素的产量不再由种植面积和天气来决定,可以完全在实验室通过生物发酵的形式,通过合成生物学的方式,大量地产生,惠及大众;


甚至说有器官移植需求的患者,他也不需要再经过漫长的等待,而是通过生物合成,让人工器官立等可取;


甚至未来我们的海量的数据,都不需要通过硬盘的方式来存储,一管DNA就可以代表整个文明史。

 

当那一天到来的时候,合成生物学就已经完全的改变了我们的世界。

 

谢谢!





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