查看原文
其他

疫情来袭,宅家学习meta分析(2):一文学会Meta文献检索

陈老师 医学论文与统计分析 2022-10-07


Meta简明教程(2)

当找到一个临床问题,那么就要动起来,你要在浩瀚的数据库中找到能解决你这个问题的证据,第一步就是文献检索,找出与提出临床问题相关的文献。本篇对文献检索的过程和检索策略进行介绍,相信诸位学完之后,就能初步掌握Meta分析的文献检索过程。

我们将以研究主题“临床试验评价他汀类药物治疗房颤疗效”为例,按部就班、简明扼要地教大家如何进行文献的检索。

一、选择数据库


一般而言,要解决提出的临床问题,我们优先选最为相关的数据库进行文献检索,如果找不到足够的文献,那再找其它数据库进行二次检索。但meta的综旨是要把提出临床问题相关的研究都找到(不管阳性阴性),现在借助于计算机检索和noteexpress等文献管理软件,我们可以一次性对多个数据进行检索,所以现在的meta分析一般不去关注什么才是最相关的数据库,只要和我提出临床问题相关的数据库,只要有时间精力,一股脑儿全都进行检索,然后再依次进行重复剔除和筛选,这么做,找到的文献会更加全面。


Meta分析主流检索数据库如下:

中国知网:http://www.cnki.net/old/

万方:http://www.wanfangdata.com.cn/index.html

Pubmed: http://www.pubmed.com/

Embase:https://www.embase.com/login

Web of science: https://www.webofknowledge.com

cochrane library:https://www.cochranelibrary.com/

Scopus:https://www.scopus.com/


中文医学的meta论文: 建议大家选择 中国知网,万方,维普、中国生物医学、Pubmed, Embase, web of science,cochrane library,Scopus

英文医学的meta论文:建议大家选择 Pubmed, Embase, web of science, cochrane library、Scopus

一般这几个数据库就差不多了,如果还有需要,可以搜索Google Schoolar等。


要开展meta分析数据库,并非所有的数据库都需要涉及,毕竟部分数据库国内一些普通研究机构没有购买,所以得到相应文献的信息很难。我希望诸位朋友真要开展英文的SCI论文的话,也要排除万难,尽量获得多一些的数据库检索权。


二、确定检索词进行检索


1. 确定检索词的方法

选择恰当的检索词能提高检索临床问题证据的相关性。检索词获得有两种,一种是自由词,根据临床问题自己设定检索词。


比如我要了解他汀类药物治疗房颤的效果,检索词可以是(他汀房颤)。首先以自由词方法设定检索词“他汀”,“房颤”,“statins”,”atrial fibrillation”,可以通过过综述或关键词,找到意思相同但表达不同的词(他汀:3-羟基-3甲基戊二酰辅酶A(HMG-CoA)还原酶抑制药)。


这里推荐另外一种检索词确定方法:主题词(MeSH术语),一般可以通过pubmed上进行搜索获得。


2.以主题词进行检索

1)主题词检索

在主题词(MeSH)检索中,发现statins意思相同的表达形式(Hydroxymethylglutaryl CoA Reductase Inhibitors;Inhibitors, HMG-CoA Reductase;HMG-CoAReductase Inhibitors)。


Atrial Fibrillation 不同表达形式:AtrialFibrillations, Auricular Fibrillation

2)选择不同表达形式的检索词

通过Mesh找到不同表达词(可适当选择检索词)

Statins: Hydroxymethylglutaryl CoA Reductase Inhibitors,Inhibitors, HMG-CoA Reductase,HMG-CoAReductase Inhibitors


Atrial fibrillation: Atrial Fibrillations, Auricular Fibrillation,Fibrillation, Auricular

 

3)确定检索式

搜索的文献不足,可增加检索词表达词,用“OR”连接不同表达形式词

Stains检索式可以为Statins OR HydroxymethylglutarylCoA Reductase Inhibitors OR Inhibitors OR HMG-CoA Reductase OR 

HMG-CoAReductase Inhibitors


Atrial fibrillation检索式:Atrial fibrillation ORAtrial Fibrillations OR Auricular Fibrillation OR Fibrillation, Auricular


最终检索式可以为:

 ((Statins ORHydroxymethylglutaryl CoA Reductase Inhibitors OR Inhibitors OR HMG-CoAReductase OR HMG-CoA Reductase Inhibitors)) AND (Atrial fibrillation OR Atrial FibrillationsOR Auricular Fibrillation OR Fibrillation, Auricular)


4)数据库检索

Pubmed搜索: 可以看到能检索到5729篇文章,再对研究类型进行筛选“Clinical trial”,最后剩下562篇

 


Embase搜索, 可以查到4114篇文章, 然后筛选临床研究,最后剩下1486篇



值得注意的是:不同检索策略结果不一致,可能有些时候可能产生几千甚至上万的文献,有些时候产生寥寥无几不到上百篇文献,因此正式确定检索词之前,要尝试增加或检索词、调整检索区域、控制研究类型以获得适当文献量,最终形成正式的检索词,开展检索获得相应的文献。


三、文献导出


搜索到的文献可以把题录批量生成文件,导入到noteexpress(noteexpress软件可见本号之前的软件下载合集:重磅推荐:分类最全的统计分析相关软件,了解以下?请关注、收藏以备用


Pubmed:一次只能导出200篇,所以只能多导出多个文件,再到noteexpress融合。Send to>citationmanager>create file

 

Embase:可一次性导出所有文章; selected>export


四、重复文献的剔除


将导出文件导入到noteexpress,并完成重复文献的剔除(重复文献要多次筛选剔除)。


1)  查找重复题录,第一次查重可以严格限定条件,区配度调高,进行一次初筛,将重复题录删除

2)因为同一篇文章在不同数据库的表达方式不同,第一次查重不能完全删除。进行第二次查重,可减少查重字段的条件,调低匹配度。

3)如果第二次查重删除后,还有重复题录,可再减少查重字段,调低匹配度,直至没有重复题录。记住匹配度不能一次性调的太低,不然一些相似的题录会被当成重复题录删除。


五、小结


Meta分析文献检索并非难事,但也需要一定的技巧、不断地尝试。不同策略得到的结果可能会存在着一定的差别。虽说Meta分析希望能够得到全部所有的相关文献,但是过泛的检索策略将给后期有效文献的筛选带来巨大的工作量。因此,检索条件的适度宽泛还需要诸位自身凭专业进行把握。


Meta分析往期文章:

1.认识一下meta方法! | 系列文章meta分析

2.率的meta分析:神药PD-1、PD-L1抑制剂的不良反应研究


诸位,本公众号现在已经形成包括“样本量估算方法”“论文的统计表达方法”“统计视频”(R、医学统计学、妙趣统计学)、“科研工具合集”、“如何分析真实世界临床研究数据”、“Meta分析”等系列,有兴趣同仁们可以关注。


您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存