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7个小时的单细胞转录组视频课程(限时免费)

生信技能树 生信技能树 2022-06-06

终于做了这个决定,把我们的单细胞转录组视频课程限时免费!是真的免费,不玩虚的!

前天在生信技能树以及单细胞天地公众号及社区跟大家讨论了,开源一些视频,也为抗击SARS-CoV-2引起的急性呼吸疾病 COVID-19做贡献,毕竟 华清大学、京北大学联合发现:#学习R语言之数据挖掘可抑制新型冠状病毒#,宅家是目前有效的防范冠状病毒的手段之一。

讨论详见:我想让这个视频免费,需要你的同意 ,大家都提了很多建设性的意见,没办法做到一一采纳。折中一下,我们的决定是,把这个7个小时的单细胞转录组视频课程开源一个月!

首先呢,因为一个月后大概率上疫情也结束了,我们能为抗击疫情做贡献,就在这一个月啦!然后呢,一个月的时间限制,相当于给大家一个deadline,能显著提高大家的生产力!

  • B站学习地址:https://www.bilibili.com/video/av38741055

  • 足足7个小时,34集,涵盖了单细胞转录组背景知识以及数据处理的知识体系,希望能够帮助到你的课题哦!


课程内容介绍

就是讲解的R包及基础流程即可,分别是: scater,monocle,Seurat,scran,M3Drop 需要熟练掌握它们的对象,:一些单细胞转录组R包的对象  流程也大同小异:

  • step1: 创建对象

  • step2: 质量控制

  • step3: 表达量的标准化和归一化

  • step4: 去除干扰因素(多个样本整合)

  • step5: 判断重要的基因

  • step6: 多种降维算法

  • step7: 可视化降维结果

  • step8: 多种聚类算法

  • step9: 聚类后找每个细胞亚群的标志基因

  • step10: 继续分类

配套习题

详见:跟着全网第一个单细胞视频课程和配套习题学是最佳策略

文末友情宣传

强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI,多一点数据认知,让他们的科研上一个台阶:

点击下面的阅读原文,直达我们的单细胞学习视频哦!

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