从100天缩短至4小时，助力新冠病毒相关蛋白预测

随着云端高性能计算的发展，越来越多的用户选择将业务迁移、部署至云端。国内某985高校长期以来一直依靠其内部高性能计算集群来支持多个科学、工程和医学领域的研究活动。然而，随着研究计算需求的不断增长，当前系统的计算资源和容量开始满足不了用户需求了。考虑到成本及时效等因素，高校最终选择了北鲲云一站式云超算平台，为师生提供一个高效便捷的云端高性能计算环境。

该方法证明既有成本效益又非常灵活。课题组高教授介绍说：“借助于北鲲云超算平台，我们可以拥有满足工作所需的计算能力，并且只要工作需要，我们就可以随时随地使用这些计算资源。这是一种满足运行计算工作需求非常有效的方式。”

课题组团队目前正在使用北鲲云超算平台进行新冠病毒相关蛋白预测。他解释说：“具体来说，Covid19主要是通过S蛋白与宿主细胞表面ACE2受体结合感染宿主细胞，因此S蛋白是绝大多数新冠疫苗发挥作用的主要靶标。德尔塔和奥密克戎毒株也是刺突蛋白的氨基酸突变所导致的变异，导致其传播能力更强。”

他补充道：“启动一台服务器计算500条.fasta文件，需要计算2000小时，差不多100天！通过北鲲云超算平台使用alphafold2对刺突蛋白进行建模，可启动500台Nvidia V100，4小时即可完成工作，所需的费用一样，但效率呈几何倍提高。”

大学使用的高性能计算云也能够适应不断变化的需求。该校高性能计算中心主任指出：“我们的用户涉及不同学科，这意味着我们还需要使用一系列不同的软件包。”北鲲云超算平台预装了300+行业软件，支持各种类型的研究人员轻松快速地在软件工具之间切换，而不会在获取、部署或者配置问题上浪费时间。

未来，北鲲云会不断深化与全国各院校合作机制，从质量、体验、生态等各方，为教师和学生提供具有创新性的云端高性能计算解决方案。

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