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这些图表你一定见过:26篇液态活检×高通量测序领域经典文献大汇总

2016-08-12 海普洛斯HaploX 海普洛斯HaploX


▲每一张图,如此眼熟。


我们是海普洛斯。作为国内领先的液态活检企业,我们除了拥有自主研发的单分子编码技术及信息分析软件外,更深知共享知识、共同进步的重要性。


很早的时候,我们就已经把信息分析的部分软件放到github上分享给大家了▼


上个月我们给大家整理过一份堪称靶向药终结者的列表,73个药物×12项信息,现在仍在不断完善更新中。excel表是免费提供给大家的▼


最近,我们又为大家整理解读了Nature Cancer Genomics的40篇重量级文章。同样,文献原文也是免费提供给大家的▼


这次,我们整理了26篇液态活检×高通量测序领域的经典文献,并且保持一贯的开源风格,免费分享给大家▼



这次分享的文献究竟有多经典?

为什么是这26篇?

看了这些图,您就知道了。


01


▼这张图您一定见过


▲这张图非常经典,来源于Luis A. Diaz等人于2014年发表在JCO上的Liquid Biopsies Genotyping Circulating Tumor DNA。本图被用来描述肿瘤细胞释放游离DNA入血的多种机制。


同在这篇文章中的还有另外一张图▼


▲本图被用来描述在靶向治疗的患者血液中检测肿瘤特异的DNA突变,是液态活检应用的一个重要组成部分。


02


▼这张图直观地展示了液态活检的各个应用方向。

▲这张图来源于Chetan Bettegowda等人于2014年发表在Science Tanslational Medicine上的Detection of Circulating Tumor DNA inEarly- and Late-Stage Human Malignancies。


▼这绝对是一篇堪称经典的文章。下面这几张同在这篇文章中的图表,一直在行业内的各种PPT里刷屏。


▲只要您了解过ctDNA,一定是见过这张图的。该图被用来描述不同癌种的患者中,检测到ctDNA的比例。



▲紧随其后的就是这张图,它展现了不同癌种中突变片段的数量。



▲这张图更是被引用得我们都要看腻了。好了,好了,我知道分期越晚ctDNA检出率越高了。


03



如果这张图您看着陌生,先看看这个:【前沿】ctDNA比组织活检好在哪儿?Guardant Health用大数据告诉你

是的,它就是Guardant Health的朋友们在今年的ASCO上发布超大样本量液态活检结果时用的那张图。15,191名癌症晚期患者,17,628份样本,您一定对这个“有史以来最大规模的液态活检研究”有所耳闻。

这张图来自Richard B.Lanman等人于2015年发表在PLoS ONE上的Analytical and Clinical Validation of a Digital Sequencing Panel for Quantitative, Highly Accurate Evaluation of Cell-Free Circulating Tumor DNA。


谈到液态活检,不可能不谈到NGS。我们也收集了一些高通量测序领域的经典文献。


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▲一文打尽多种高通量测序平台,Elaine R. Mardis的这篇Next-Generation DNA Sequencing Methods值得你拥有。高通量测序入门必读!


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▼Duplex Sequencing您还没了解过?不是吧?这可是从血液中检测出万分之一突变的方法。快来看看Michael W. Schmitt的这篇Detection of ultra-rare mutations by next-generation sequencing


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▼讲到Duplex,自然会想到与它不同的另一种method——环化测序

▼除了文章,我们把详细的protocol也搞来了





您是否初入液态活检这行,需要快速学习基础知识?

您是否入行已有一段时间,想要更全面地了解行业?

您是否练就业务熟练之余,希望突破瓶颈更上一层?

您是否已是资深业内人士,在为培训新人准备材料?


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