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核酸和蛋白定量方法,还可以怎么选?

赛默飞生命科学 医麦客 2021-12-03

进入21世纪,生物学研究领域越来越宽,但核酸和蛋白定量仍然是其他研究的基础。光吸收法(UV-Vis)荧光检测法是最常用的两种核酸和蛋白定量技术。根据不同的实验需求,通量要求选择合适的测量方法,可节省大量时间和人力成本。


本文为您梳理了实验原理,方法,所需仪器、试剂和耗材,帮您快速get到实用信息。


光吸收法(UV-Vis)




检测原理:测量入射光穿过样品后到达检测器的衰减程度,并表示为溶液中样品的吸光度值。



核酸和蛋白光吸收法法测量是基于核酸(DNA 和 RNA)和蛋白质的固有吸收特性。当测量吸收光谱时,核酸在 260 nm 蛋白质在280nm处吸收具有特征峰。


根据 Beer-Lambert 方程,使用在 260 nm 或280nm处测得的吸光值直接计算核酸或蛋白浓度:


其中:

● C=核酸摩尔浓度(M)
● A=UV 吸光度(AU)
● ε=与波长有关的摩尔吸光系数(或消光系数)(M-1cm-1
● L=光程(cm)


➤ 基于光吸收法的RNA/DNA核酸和蛋白质定量仪器


 1.  超高灵活通量Multiskan SkyHigh或Varioskan LUX



1.1. 紫外直接定量法


Thermo Scientific™ μDrop™ 或 μDrop™ Duo 板,配合Multiskan SkyHigh或Varioskan LUX可实现单次16个或32个样本的超微量测定。

 

紫外透明塑料板和石英板板材本底信号光谱扫描图

Thermo Scientific™ 紫外透明(UV trans)塑料板(货号8404),配合Multiskan SkyHigh或Varioskan LUX可实现单次96个样本的高通量测定,相较于石英板使用成本更低。

 Multiskan SkyHigh或Varioskan LUX直接紫外测量特点:

● 采用μDrop™ 板,16个样品测量时间小于1分钟

● 采用μDrop™ 或 μDrop™ Duo 板样品体积低至2μl;

96孔板样品低至50 μl(建议70μl以上,样品检测后可以直接封膜保存,无任何浪费)

● Multiskan SkyHigh带比色杯基座款,还可实现不同规格比色杯测量

● Multiskan SkyHigh带屏幕款还可快速实现单机检测

● 药研版软件符合美国21 CFR Part 11 要求

 

1.2. 可见光检测蛋白浓度


使用Multiskan SkyHigh或Varioskan LUX配合不同的蛋白定量试剂可进行至多384孔板的蛋白浓度定量检测。



荧光检测法



检测原理:基于所使用的选择性结合 DNA / RNA 或蛋白的荧光染料,这些荧光染料仅在与靶标结合时才发出信号。比传统基于紫外吸收光度法的定量更灵敏,是珍贵样品的理想选择。


样品被过滤光激发(在激发波长处)并由检测器记录发射光(在发射波长处)。

➤ 选择基于荧光检测法的仪器进行 RNA/DNA核酸或蛋白质定量


1. 经典单通道Qubit 4或八通道Qubit Flex荧光计



● 所需样品体积低至1μl
● Qubit 4/Qubit Flex测量时间≤3 秒


▲ Qubit 4/Qubit Flex测量实验操作流程


即使在样品中有同等量的RNA时,QubitTM 1X dsDNA HS Assay Kit(货号Q33231)只选择性的结合dsDNA,并具有0.2–100 ng线性定量范围。

对于蛋白质定量,Qubit 宽范围蛋白定量试剂(A50668,A50669)可在Qubit 4荧光计上对蛋白样品进行快速、灵敏、准确的浓度分析,线性范围宽达0.1–20 mg/mL,所以大多数未稀释的样本可直接定量,并且蛋白间差异很低。定量结果可在Qubit 4上一键获取,无需手工计算。



如上图,对于不同细胞裂解物的蛋白定量,Qubit Protein BR Assay 较常规 Bradford法具有更低的CV值。


2. 超高通量Fluoroskan 系列或Varioskan LUX




● 所需样品体积低至1μl

● 96个样品测量时间不超过25秒

● 可以进行384孔的高通量检测

● 药研版软件符合美国21 CFR Part 11 要求


▲ Fluoroskan 系列或Varioskan LUX测量实验操作流程



即使在样品中有同等量的RNA时,Quant-iT 1X dsDNA HS Assay(货号Q33232,最佳激发502nm最佳发射523nm)只选择性的结合dsDNA,并具有0.2–100 ng线性定量范围。



Quant-iT™蛋白测定试剂盒(货号Q33210,最佳激发470nm最佳发射570nm测定的蛋白样品体积为1–20 μl,检测范围为0.25–5 µg。上图显示了在规定的检测范围内9种不同蛋白质产生的荧光信号。对于所有测定的9种蛋白质,在3 µg浓度的蛋白质间差异为12%,去除碱性组蛋白后差异则为9%。

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