使用 ggbreak 包进行 Y 轴多次截断

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简介

最近在科研中需要比较不同模型的预测性能，我们使用相对偏差，均方根误差等来比较结果。此时，可能会得到以下结果：

上图出现以下问题：

• 问题一：由于经典模型（Normal）在复杂数据中的预测效果不好，会出现预测非常差的情况，从而导致图形Y轴刻度被拉长，可视化效果不佳。

• 问题二：相似方法预测结果相同，无法清晰看出之间的差异性。

• 问题三：柱状图准确数字未知，只能通过主观方式估计最终结果。

基于以上问题，小编分别做了以下润色工作：

1. 问题一二可以通过使用 ggbreak 包^[1] 进行多次 Y 轴截断。

2. 添加每个柱状图的准确数值结果来解决问题三。

3. 简单修改图形颜色，删除图例，使其变得更加美观。

最后得到以下图形：

接下来给出可复现的代码供大家参考，读者可以根据自己数据进行调整。

使用教程

数据产生

为了方便读者复现，小编手动产生一些样例数据：

com_cost = c(17.64,4.89,5.13,8.43,5.32)
com_cost_re = data.frame("Method" = c("Normal","TS","Linear","Power","Exp"),"Value"= round(com_cost,3))
com_cost_re$Method <- factor(com_cost_re$Method, levels = c("Normal","Power","Exp","Linear","TS"))

可视化

首先，对该数据进行可视化，并做了些细节调整。例如：修改配色、添加文本、删除图例等。

gg1 = ggplot(com_cost_re, aes(x = Method, y = Value)) +
  geom_bar(stat = "identity", aes(fill = Method),alpha = 0.8) +
  scale_fill_viridis(discrete = T)+ # 修改配色
  geom_text(aes(label = Value), position = position_dodge(width = 0.8), 
            vjust = 2, size = 4,color = "white") +  # 添加文本
  coord_cartesian(ylim = c(4,18)) +  
  theme_bw() +  # 设置主题
  theme(panel.grid = element_blank(),legend.position = "none") + # 删除图例
  labs(title = "", x = "Method", y = "Criteria")
gg1

此时，图形美观度基本完成，接下来使用 ggbreak 包进行多次 Y 轴截断。主要使用 scale_y_break() 函数。

注意：关于  scale_y_break() 的其他参数设置可参考：ggbreak官网教程^[2]，这里不做过多重复介绍。

gg2 = gg1 + scale_y_break(c(5.35, 8.34)) + 
  scale_y_break(c(0, 4.7)) + 
  scale_y_break(c(8.5, 17.5)) 

此时得到的结果为：

小编有话说

本文主要是小编在科研中存在的一个问题，最终通过一些简单搜索和调包解决问题。供大家参考～

参考资料

[1]

ggbreak 包: https://github.com/YuLab-SMU/ggbreak

[2]

ggbreak官网教程: https://cran.r-project.org/web/packages/ggbreak/vignettes/ggbreak.html

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