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书籍翻译
好的书籍是人类进步的阶梯，但有些人却找不到优秀的阶梯，为此我们开设了书籍翻译这个栏目，作为你学习之路的指路明灯；分享国内外优秀书籍，弘扬分享精神，做一个知识的传播者。
希望大家能有所收获！
关于此课程
单细胞RNA-seq数据分析
在本课程中，我们将讨论使用scRNA-seq可以解决的一些问题，以及有效的计算和统计方法。该课程通过剑桥大学生物信息学培训组讲授，但这份材料旨在用于任何有兴趣学习scRNA-seq数据计算分析的人。该课程每年讲授两次，每次活动前的材料都会更新。
计算工具的数量正在迅速增加，我们正在尽最大努力跟上可用的数据。本课程的主要限制之一是我们希望使用在R中实现且运行速度相当快的工具。此外，我们还承认有些偏向于我们或我们的朋友和同事开发的方法。
正
文
1.1
视频
该视频于2017年11月录制，当时该课程包含的章节少于当前版本。
https://www.youtube.com/watch?list=PLEyKDyF1qdOYAhwU71qlrOXYsYHtyIu8n&v=56n77bpjiKo
1.2
注册课程
请点击此链接注册“单细胞RNA-seq数据分析”课程：http://training.csx.cam.ac.uk/bioinformatics/search
1.3
Github
https://github.com/hemberg-lab/scRNA.seq.course
1.4
安装RStudio
docker RStudio image已经包含所有必需软件包，可以在没有任何软件包安装的情况下复制该课程。
确保你的系统上安装了Docker。如果没有，请按照说明操作。要运行RStudio docker image课程：
docker run -d -p 8787:8787 quay.io/hemberg-group/scrna-seq-course-rstudio
这将下载docker镜像（可能需要一些时间）并在docker容器中启动一个新的Rstudio会话，其中安装了所有软件包并且所有数据文件都可用。
然后在浏览器中访问localhost：8787并使用username：password作为rstudio：rstudio登录。现在你准备好了！
有关如何使用不同选项运行RStudio docker的更多详细信息，请参见https://hub.docker.com/r/rocker/rstudio-stable/。
1.5
手动安装
如果你没有使用课程的docker镜像，那么为了能够运行课程的所有代码块，你需要克隆或下载课程GitHub存储库并在克隆文件夹中启动R会话。你还需要安装Docker文件中列出的所有软件包：Dockerfile1和 Dockerfile2。
或者，你可以只安装感兴趣的章节中列出的软件包。
1.6
前提条件
本课程面向那些基本熟悉Unix和R脚本语言的人。
我们还假设你熟悉大量RNA-seq数据的映射和分析以及常用的计算工具。
我们建议你在参加本课程之前参加RNA-seq和ChIP-seq数据分析简介或使用Bioconductor分析高通量测序数据。
2016年的单细胞转录组数据居然发oncotarget ！！！
如果你对单细胞转录组研究感兴趣，但又不知道如何入门，也许你可以关注一下下面的课程
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