前面我们分享的3天单细胞培训是有免费的配套教学视频的
上个星期我们在单细胞天地公众号推出了: 单细胞至少得培训3天及以上,如何鉴别好的培训班 非常受大家欢迎,实力避免大家踩坑,很多粉丝表示仍然是没有看出来Single cell RNA-seq data analysis with R课程全套资料在哪,其实得批评,我给了关键词 《Single cell RNA-seq data analysis with R》
课程详情
简单搜索就看到的:https://www.csc.fi/web/training/-/scrnaseq 然后我留意到了,居然是有配套视频课程,不仅仅是其教学PPT,如下:
教学视频和PPT获取方式
你在单细胞天地公众号后台回复任何关键词都拿不到这个课程的教学视频和PPT,因为我没有版权,而且我懒得去帮你下载,毕竟还得鼠标点击很多次,我不希望养成一堆懒粉丝来。
至于YouTube视频下载方式,如果你是真正的粉丝,应该是知道什么是搜索,简单搜索就能获得!如果确实因为网速等硬性条件问题,可以考虑加入我们的单细胞天地官方交流群,里面肯定是有人会下载过分享出来。
扫描下面的二维码大家可以加我们单细胞天地官方小助手微信获取各类学习资源以及最新资讯!(PS : 添加好友请务必备注工作或者学习单位+姓名)
当然了,并不是说国外的就一定最棒,从教程的角度来说,可能我们生信技能树,生信菜鸟团口语化的推文,让大家学的更快。单细胞下游分析本质上就是一些R包的认知,包括 scater,monocle,Seurat,scran,M3Drop 需要熟练掌握它们的对象,:一些单细胞转录组R包的对象 ,分析流程也大同小异:
step1: 创建对象
step2: 质量控制
step3: 表达量的标准化和归一化
step4: 去除干扰因素(多个样本整合)
step5: 判断重要的基因
step6: 多种降维算法
step7: 可视化降维结果
step8: 多种聚类算法
step9: 聚类后找每个细胞亚群的标志基因
step10: 继续分类
上游分析,如果是10X仪器的单细胞转录组数据,走的是cellranger流程,而且我们在单细胞天地多次分享过流程笔记,大家可以自行前往学习,如下:
如果是smart-seq2技术,走普通RNA-seq流程即可,我们在B站也有视频。https://space.bilibili.com/338686099/#/
重复一篇WGCNA分析的文章(解读版)(逆向收费读文献2019-19)
如果你对单细胞转录组研究感兴趣,但又不知道如何入门,也许你可以关注一下下面的课程
”