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单细胞天地 单细胞天地 2022-06-07


分享是一种态度



如今,可以使用高通量测序(scRNA-seq)从单个细胞获得全基因组转录组数据。scRNA-seq的主要优点是细胞分辨率和全基因组范围覆盖,使得解决使用其他方法难以解决的问题成为可能。但是,要分析scRNA-seq数据,需要新颖的方法,而且针对大量RNA-seq实验开发的方法的一些基本假设已经不再有效。

今天我们给大家推荐一本《Analysis of single cell RNA-seq data》 在这本书中讨论了使用scRNA-seq可以解决的一些问题以及可用的计算和统计方法。

主要包括以下几个部分:

•前言部分•单细胞RNA-seq简介•原始数据的处理•表达矩阵的构建•R/Bioconductor简介•实例数据练习•表达矩阵处理•生物学意义分析•Seurat•理想的scRNAseq分析流程(截止到2017年)•高级练习•Resources

这其实也是一门课程,感兴趣的可以回顾一下: 

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