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单细胞天地 单细胞天地 2022-06-07


分享是一种态度



2013年“单细胞测序技术”被nature杂志评为“年度技术,而2019年的年度技术则为“单细胞多组学”。近年来,基于高通量单细胞测序技术的课题研究可谓热火朝天。今天给大家分享的就是利用Illumina技术的单细胞研究文献综述报告《Single-Cell Research》。这篇综述着重于近期发表的文献,展示了如何将Illumina 技术用于单细胞测序应用和技术。



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Illumina




Illumina总部位于美国加州圣地哥。自2006年进入基因测序市场至今,已陆续发布了一系列各具特色的测序系统并在市场上广泛应用。根据测序通量差异,可分为台式测序系统和生产级测序系统,前者如iSeq 100、MiniSeq、MiSeq系列、NextSeq系列等,后者如HiSeq 4000、HiSeq X系列、NovaSeq 6000等。Illumina在NGS乃至整个测序市场中的霸主地位毋庸置疑。引用illumina官方说法:“世界上90%以上的测序数据都由Illumina仪器产生”,不较真的话,这句话确实在某种程度上反应了Illumina雄踞NGS市场的现状。尤其是HiSeq系列测序仪的问世,以通量高,产量大,生产规模著称,能够快速、经济的进行大规模平行测序,在大型全基因组测序,全转录组,全外显子组测序,靶向基因测序方面优势明显。


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Illumina®Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution




llumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution 于2017年1月17日在JP摩根健康大会上发布,基于Bio-Rad的液滴分离技术,微流控中分装单细胞,后续进行cDNA反转录获得大量单细胞的基因表达数据。可一次性检测8个样本,每个样本获得500~10000个细胞,缺点是只获得基因表达数据,不能获得转录本全长,捕获效率仅为3%,但是测序成本相对较低。



那么想要吗,老规矩,不需要分享朋友圈,公众号回复“Illumina” 即可获得此书的PDF版本的云盘链接。顺便提一下,这个是中文版,当然还有英文原版的,回一送四,再送Illumina公司其他方面研究的四本英文原版综述,包括《RNA SEQUENCING  METHODS COLLECTION》、《Cancer and the immune system》、《Genomic solutions for cell biology and complex disease research》




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