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生信分析平台搭建(九):Aspera

2018-01-16 基因学院 基因学苑

编者按

随着测序数据的大量产出,数据传输成为行业发展瓶颈。不过“车到山前必有路”,Asprea是一种高效的数据传输解决方案,可以快速在网络间传输数据,怎么来形容呢,迅雷不及掩耳盗铃之势……

接前面:

一、准备工作:手把手教你生信分析平台搭建(一)

二、安装Linux系统:生信分析平台搭建(二):安装Linux系统

三、系统设置:生信分析平台搭建(三):系统设置

四、共享文件夹:生信分析平台搭建(四):共享文件夹

五、个性化设置:生信分析平台搭建(五):个性化设置

六、系统配置:生信分析平台搭建(六):系统配置

七:bioconda:生信分析平台搭建(七):bioconda

八:Synaptic:生信分析平台搭建(八):利用Synaptic安装生物软件


十三:Aspera

1、下载软件

wget   http://101.96.8.140/d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/connect/bin/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz

2、安装软件

tar -zxvf  aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz
sh aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh

3、软件默认安装到home目录下,在一个隐藏的点.aspera 目录下。这个是浏览器调用的目录,图形化界面下可以直接使用浏览器调用。

4、软件使用,asperaconnect为浏览器插件,可以直接在浏览器中使用。windows系统比较容易安装,Linux系统安装之后有可能还需要进行依赖配置。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/download/

5、命令行使用,

6、下载人第一号染色体

.aspera/connect/bin/ascp  -i .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --overwrite=diff -QTr -l6000m anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:genomes/H_sapiens/CHR_01/ . (注意后面的点,表示下载到当前目录)


Tips:Aspera不能使用root账户安装和使用,必须使用普通用户。


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