生物信息神奇网站系列（十四）：基因组大小统计

编者按

基因组大小是生物一个明显的特征，一般来说越复杂的生物基因组大小越大，例如哺乳类大于鸟类，鸟类大于真菌，原核生物大于病毒。因为越复杂的生物需要越多的基因完成功能，不过也有很多特例，例如植物由于是多倍体，基因组大小可能非常大。知道一个物种，就可以对基因组复杂程度以及测序数据大小有个预估，这个指标还是很有意义的。目前已经测序出很多物种，当然可以通过基因组序列得到，也有一些网站收集已知物种基因组大小，方便查询。

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专栏二：

十四：基因组大小统计网站

1、http://www.genomesize.com/ 网站主要收集动物基因组大小，可以直接根据物种名进行搜索。

2、说到基因组大小，必须要提到C-value，在每一种生物中其单倍体基因组的DNA总量是特异的，被称为C值（C-Value）。物种的C值和它进化的复杂性之间没有严格的对应关系，这种现象称为C值悖论。

3、 http://data.kew.org/cvalues/ 网站用来搜集植物C-values大小，通过换算可以推算出植物基因组大小。

4、 48 30844 48 15047 0 0 963 0 0:00:32 0:00:15 0:00:17 3599www.zbi.ee/fungal-genomesize/ 这个网站收集了真菌的基因组大小，不过需要进行查询，需要输入门纲目科属种等比较麻烦。

5、http://www.sci.sdsu.edu/~smaloy/MicrobialGenetics/topics/chroms-genes-prots/genomes.html  这个网站搜集了一些原核生物的基因组大小，分为古细菌和真细菌，原核生物基因组大小比较小，一般小于10M 。

Tips：

1、如果没有查询不到对应物种基因组大小，可以查找近源参考序列。

2、测序完成之后，可以利用生物信息的方法推测基因组大小。

3、利用实验的方法是使用流式细胞仪估计基因组大小。

4、当测序物种越来越多，原核生物，真菌，植物，动物等基因组还是具有一定的规律性的。

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