SCI热宠——RNA甲基化m6A入门必杀技

Original 科研小榴莲科研小榴莲 2023-08-18

沉舟侧畔千帆过

病树前头万木春

春天已来

正是斗志昂扬做科研的好时候

近来翻阅文献发现Nature近期发表了一篇TGFβ通路可以通过smad2/3复合体影响RNA甲基化修饰（m6A）的文章。

心中不禁想到，难道现在像TGFβ这样的明星通路都要沾沾RNA甲基化修饰的光啦？遂决定今天简单的聊一下RNA甲基化修饰-m6A。

一，近年m6A文章发表状况

什么是m6A？

已知RNA存在100余种修饰，其中最为常见的修饰之一：N6-腺苷酸甲基化修饰（m6A）

小榴莲首先调查了从2013年-2017年全年被NCBI收录的与m6A相关的文章发表状况（如下图），总体的感觉就是稳中有升。

可是分析到此还没结束，要挖掘有价值的数据，当然要更加详细的分类之后分别加以分析，接下来让我们仔细的来看一下这组数据。我们把文章发表状况详细的分为IF>30，30>IF>10，IF<10三档，仔细加以分析（IF: influence factor）。我们来看IF<10的一档，这组数据呈现稳步上升的趋势，看起来并不令人感到眼前一亮，至少并没有嗅出下一个风口的味道。

可是，当我们将10分以上的文章单独列出来加以分析时，这组数据就有点意思了。

对于m6A的相关研究而言，2017年可能是一个分水岭，有相当一部分实验室发表了高质量的研究，目测接下来将有一大批相关领域的文章出现。无疑的一点是，随着CNS等知名期刊对研究的指引，这方面的期刊可能在近期也会比较受欢迎。在刚刚过去的2017年，m6A相关领域的文章发在影响因子大于10的学术期刊上的数量为38篇，而2018年，到截稿前为止，在IF>10的学术期刊上已经出现了13篇有关m6A的研究性论文，可见对于RNA甲基化研究而言，今年又是一个丰收年。

二，m6A研究一览

问题一

“RNA”公主被“甲基化”了，

谁干的？

现在已经报道的主要参与m6A甲基化的甲基转移酶有METTL3和METTL14，当然WTAP也是甲基转移酶复合体重要的组成成员，除此之外RBM14、KIAA1429也会参与其中。一言以蔽之：团伙作案，鉴定完毕。

问题二

“RNA”公主被甲基化了，

有后悔药吗？

写到这里

连小榴莲自己都有点入戏了

我忍不住要说

你自从关注了科研小榴莲

你在这里可能学到的

就不仅仅是知识了

还能学到

。。。。。。

更多“知识”

问题三：要生一个怎样的孩子？

这口“锅”最后到底要有谁来背？

三，RNA研究相关书籍资料

1，RNA Worlds

from life' origins to diversity in gene regulation

这份资料为大家提供了详细的RNA方面的知识，想了解这方面知识的同学可以留意下这份资料，小榴莲会提供下载方式。

2，RNA Methodologies

RNA研究方法

我们肯定会想到提供一些RNA的研究方法。需要注意的是我们在此提供的《RNA研究方法》是第四版高清pdf。与此同时，我们提供第三版的中文影印版本，如下：

3，RNA Methylation

-methods and protocols

RNA 甲基化研究方法

我们在本文中也谈到了m6A最近风头正盛，所以给大家找了一部关于m6A研究方法的书籍资料，希望对小伙伴们有帮助。

4，RNA and Cancer

RNA和癌症研究

《RNA and Cancer》中详细的讲述了RNA剪接与肿瘤信号通路，细胞坏死，细胞凋亡等的关系，涵盖了RNA剪接，microRNA等影响肿瘤发生发展的各种分子模式，我们lab的入门资料之一，推荐学习！

5，Non-coding RNA and Cancer

长链非编码RNA和肿瘤研究

6，circular RNA

-methods and protocols

环状RNA研究方法

谈起RNA研究，不得不谈的就是近年来的新宠circular RNA，相比起long non-coding RNA，大有长江后浪推前浪之势。那么对于刚刚接触circular RNA研究的小伙伴来说，使用什么数据库进行查询？怎样构建circular RNA表达载体？如何检测circular RNA的表达？怎样对circular RNA进行示踪？这本书里都进行了详细的描述。古语有云：临渊羡鱼，不如退而织网。还等什么？摩拳擦掌行动起来吧！

7，MicroRNA and Cancer

8，RNA-seq Data Analysis

说到关于RNA的资料，有一个内容无法绕过，那就是RNA-seq，当然关于资料，小榴莲当然也为大家准备好啦。另外，RNA-seq数据的分析对大家来说未免有点生涩难懂，小榴莲还为大家准备了一份简明扼要的中文资料，包括如何分析RNA-seq数据，如何做热图等等，三天速成！

9，RNA silencing

methods and protocols

RNA沉默实验方法

无论大家从不从事RNA方面的研究工作，siRNA什么的大家也是都用得上的，所以这份资料作为今天分享的最后一份资料！资料免费领取方式见下文。

读书不觉已春深

一寸光阴一寸金

多读资料

不负韶光！

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