​硕博生必学 | 手把手教你PubMed的正确打开方式

PubMed是生物医学研究领域应用最广泛也是最重要的数据库，由美国国立卫生研究院（NIH）下属的美国国立医学图书馆（National Library of Medicine，NLM）的国家生物技术信息中心（NCBI）开发、维护。面向全世界免费提供最新的生物医学信息。PubMed可检索自1950年以来MEDLINE数据库的期刊文献以及其他生命科学期刊文献。PubMed的信息资源主要包括Medline数据库、PreMedline数据库以及部分由出版商提供的数目信息。

PubMed整合在NCBI的统一检索平台Enterz上，与该平台其他数据库建立无缝链接，可实现跨库检索。可以说PubMed是生物领域科研人员必不可少的文献数据库，本期内容利刃君就为大家分享PubMed数据库的基本用法。

01

基本检索

使用PubMed最基本的检索方式就是直接在检索框中输入关键词进行检索。单纯的模糊检索一般会让检索结果很多，找到适合的文献往往很费时间。此时，我们可以在基本检索时，对关键词进行组合检索、添加截词符号、特殊符号进行检索，最常用的有以下几种。

①布尔运算

也叫逻辑运算，即“与”、“或”及“非”，对应“AND”、“OR”及“NOT”，注意必须为大写字母，分别对应交集、联集和差集。

如我们需要检索“人参皂苷在治疗冠心病的应用”，这时可提取两个关键词“人参皂苷”和“冠心病”，就可以使用[ginsenosides AND “coronary heart disease”]进行检索。

需要注意的是，逻辑算符具有优先顺序，优先级为：NOT>AND>OR。

②括号（）

使用逻辑算符进行检索时，如果需要改变优先顺序，就可以添加括号，类似于数学中的逻辑，括号内的先运算。如使用[Ginsenosides AND （"Cervical cancer" OR "coronary heart disease"）]和[Ginsenosides AND "Cervical cancer" OR "coronary heart disease"]进行检索的结果数量有明显的差距。

③星号*

截词符号，指在检索词的适当位置截断。使用截词检索可对关键词的一个局部进行检索，检索结果为凡满足这个词局部中的所有字符（串）的文献，使用截词检索可有效提高查全率。如[chemotherap*] 可查到[chemotherapy]、[chemotherapautic]、[chemotherapeutical]等不同的词性拼法。

④引号“”

如果关键词包含多个词，不想分开，可以使用引号包覆词组进行检索。如我们直接使用“coronary heart disease”进行检索，检索结果会将三个单词分开，检索结果可能并不是我们想要的。

添加引号进行检索，检索结果就精准了许多。

02

限定检索

使用更细节的检索方法可以更精准地获取文献，如引入作者、期刊名、文章发表时间等。要实现这样的功能，可在检索时引入字段标记。比如我们要查询“MarchantI”这个作者的文章，可以使用“Marchant I[au]”进行检索，其中“au”表示“author”，即作者，这样检索结果均为该作者发表的文章了。

再比如我们使用“STAT3[ti]”进行检索，表示检索结果中文献的标题必须有关键词“STAT3”，其中“ti”表示“title”，即标题。

03

高级检索

在检索框下方点击“Advanced”可进入高级检索界面，在高级搜索条件下，我们可以通过添加具体条件和运用逻辑符号更加精确地检索想要的文献。

高级检索界面主要包含三个部分，很容易理解。

✅第一个部分“Add terms to the query box”可下拉式选择检索方式，可以很容易的实现组合检索；

✅第二部分“Query box”为自主书写检索式进行检索，我们在第一部分设置检索时，这里会自动生成检索式，当然也可自己直接书写检索式；

✅第三部分“History and Search Details”记录了检索历史和检索式，我们也可将自己的检索式保存，下次可直接使用。

比如我们需要检索发表在J Enzyme Inhib Med Chem期刊上且标题含有“STAT3”的文献，可以如下设置：

04

Mesh主题词检索

主题词检索也是PubMed常用的检索方式，比基本检索更具优势。主题词检索一般包括主题词和副主题词两部分，主题词是将文献研究的主要论点概括成（标引）一个或多个规范化的语词。副主题词是对主题词的某一特定方面的限定，具有专指性。

在PubMed首页可以找到“MeSH Database”的入口，点击该链接可进入主题词检索界面。

比如以糖尿病“Diabetes Mellitus”进行检索，在检索结果界面找到自己要检索的主题词；

这里我们点击第一条结果“Diabetes Mellitus”，在该界面可以查看副主题词和主题词的其他信息。副主题词可以添加多个，也可以不添加。我们这里勾选“diagnosis（诊断）”和“therapy（治疗）”；

然后在页面右侧的“PubMed Search Builder”工具块点击“Add to search builder”生成检索式，之后点击“Search PubMed”进行检索即可。

如果还需要加入其它检索条件，可以利用历史检索模块，进行逻辑组配再检索。

本期内容就到这里，如果您有什么问题，欢迎留言告诉我们~

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