【生物选修1】5.2 多聚酶链式反应扩增DNA片段(PCR)
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一、 基础知识
(一)PCR原理
1、DNA复制
(1)条件:
参与的组分 | 在DNA复制中的作用 |
解旋酶 | 打开DNA双链 |
DNA母链 | 提供DNA复制的模板 |
____________ | 合成子链的原料 |
DNA聚合酶 | 催化合成DNA子链 |
引物 | 使DNA聚合酶能够从引物的3′端开始连接脱氧核苷酸 |
(2)3′端和5′端: DNA的两条链是反向平行的,通常将DNA的羟基末端称为3′端,而磷酸基团的末端称为5′端。
(3)DNA聚合酶只能从3′端延伸DNA,因此,DNA复制需要引物。DNA的合成方向总是从子链的5′端向3′端延伸。
【注意】引物是DNA或RNA,用于PCR的引物长度通常为20~30个核苷酸。
2、解旋:在DNA的复制过程中,双链的解开是DNA复制的前提。在体外可通过控制温度来实现。
3、PCR
(1)概念:PCR的全称为多聚酶链式反应,是一种体外迅速扩增DNA片段的技术。[来源:学#科#网Z#X#X#K]
(2)DNA的热变性原理:在80~100℃的温度范围内,DNA的双螺旋结构将解体,双链分开,这个过程称为变性;当温度缓慢下降后,两条被分离的DNA链又会重新结合成双链,这个过程称为复性。
(3)原理:DNA的复制原理。
(4)PCR反应条件:①缓冲溶液。②DNA模板。③分别与模板DNA两条模板链相结合的两种引物。④四种脱氧核苷酸。⑤耐热的DNA聚合酶(一般用Taq DNA聚合酶)。⑥能够自动调控温度的仪器:PCR仪。
(5)PCR的反应过程:PCR一般要经历三十多次循环,每次循环可以分为变性、复性和延伸三步。
变性:当温度上升到90℃以上时,双链DNA解聚为单链。
复性:当温度下降到50℃左右,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
延伸:当温度上升到72℃左右,溶液中的四种脱氧核苷酸在DNA聚合酶酶的作用下,根据碱基互补配对原则合成新的DNA链。
(6)PCR的反应结果:从第二轮循环开始,上一次循环的产物也作为模板参与反应,并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅱ结合,进行DNA的延伸,这样,DNA聚合酶只能特异地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的序列成2n扩增。
二、设计实验
(一)制备固定化酵母细胞
1、酵母细胞的活化:由休眠状态重新恢复为正常的生活状态。
2、配制物质的量浓度为0.05mol/L的CaCl2溶液。
3、配制海藻酸钠溶液:海藻酸钠在水中溶解的速度较慢,需要通过加热促使其溶解。加热时最好采用小火间断加热的方法。如果加热太快,海藻酸钠会发生焦糊。
4、海藻酸钠溶液与酵母细胞混合:将海藻酸钠溶液冷却至室温,加入已活化的海藻酸钠溶液,进行充分搅拌,使其混合均匀,搅拌后吸入到注射器中。
5、固定化酵母细胞:将注射器中的混合液滴加到CaCl2溶液中,形成凝胶珠状颗粒,在CaCl2溶液中浸泡30min左右。
(二)、用固定化酵母发酵
1、将固定好的酵母细胞(凝胶珠)用蒸馏水冲洗2~3次。
2、将10%葡萄糖溶液转移至锥形瓶中,加入固定好的酵母细胞,置于25 ℃下发酵24h。
(三)结果分析与评价
1、观察凝胶珠的颜色和形状
如果制作的凝胶珠颜色过浅、呈白色,说明海藻酸钠浓度浓度偏低,该种凝胶珠包埋的酵母细胞数目较少,影响实验效果;如果形成的凝胶珠不是圆形或椭圆形,则说明海藻酸钠浓度偏高,制作失败,需要再作尝试。
2、观察发酵的葡萄糖溶液:利用固定的酵母细胞发酵产生酒精,可以看到产生了很多气泡,同时会闻到酒味。[来源:学科网]
(四)、课题延伸:工业生产中,细胞的固定化技术是在严格无菌的条件下进行的。
(五)、归纳:
1、加热使海藻酸钠溶化是操作中最重要的一步。海藻酸钠的浓度涉及固定化细胞的质量:如果海藻酸钠浓度过高,将很难形成凝胶珠;如果浓度过低,形成的凝胶珠所包埋的酵母细胞的数目少影响实验效果。
2、观察凝胶珠的颜色和形状:如果制作的凝胶珠颜色过浅,呈白色,说明海藻酸钠的浓度偏低,固定的酵母细胞数目较少;如果形成的凝胶珠不是圆形或椭圆形,则说明海藻酸钠的浓度偏高,制作失败。
三、操作提示
1、为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的 微量离心管、枪头、缓冲液以及蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌。
2、PCR所用的缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。
3、在微量离心管中添加反应成分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
所有的成分都加入后,盖严离心管口的盖子,用手指轻轻弹击离心管的侧壁,使反应液混合均匀。
4、混匀后离心处理,使反应液集中在离心管底部。