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【有机】David Sarlah课题组Angew:首次Pyritide A2的仿生全合成

杉杉 CBG资讯 2023-03-16

导读:
近日,美国伊利诺伊大学与意大利帕维亚大学David Sarlah课题组首次报道了pyritide A2的全合成策略,该策略涉及氨基酸前体经aza Diels-Alder反应合成吡啶环的过程。以市售的精氨酸衍生物为底物,经两步反应可合成含有附加氨基酸残基的修饰吡啶环,并在十步中获得了pyritide A2。相关研究成果发表在Angew. Chem. Int. Ed.上(DOI: 10.1002/anie.202212299)。


(图片来源:Angew. Chem. Int. Ed.)


正文:
基因组学的快速发展彻底改变了生物分子科学的方方面面,包括天然产物领域。基因组信息的开发,也称为基因组挖掘,已经引起了向发现新代谢物和发现生物合成途径和过程的范式转变。与更传统的分离方法相比,基因组挖掘避免了对已知化合物的重新发现,并专注于在标准实验室生长条件下无法生成的新型代谢物。在这方面,最多产的发现与核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)有关,这是一个天然产物家族,包含数十种具有不同结构和生物活性的不同化合物类别。

最近,化学家们发现了含吡啶的大环肽,其中的代表是14元环pyritide A1(1)和17元环和A2(2)(Figure 1a)。Pyritides 12均通过挖掘小单孢菌基因组进行鉴定。然而,在来自本地生产者的分离株中并没有检测到它们。广泛的分离工作,包括用于化学酶合成的关键酶的重组表达,仅提供了毫克量的12Sarlah课题组通过建立pyritide A1(1)的独立化学合成来支持初步的pyritide发现研究,从而验证这种稀缺天然产物的结构分配。然而,1的合成是从2,3,6-三取代的吡啶开始,这阻止了这种合成方法扩展到该家族中含有苄基立体中心的成员。近日,Sarlah课题组首次报道了pyritide A2(2)的全合成。

吡啶类天然产物的类别定义、翻译后修饰是酶催化的形式[4+2]-环加成,可生成吡啶核心(Figure 1b)。吡啶合酶MroD介导两个脱氢丙氨酸残基的结合,这些残基与水和前导肽的消除同时发生,最终生成含2,3,6-三取代吡啶的大环化合物。尽管通过化学方法形成生物吡啶是不可行的,但作者设想了一种互补合成策略,其涉及环合成和直接利用α-氨基酸(Figure 1c)。因此,杂环核可以通过1,2,4-三嗪3经aza Diels–Alder反应转化为吡啶;三嗪3可由氨基酸衍生的α,β-二酮酯5和氨基腙4的缩合生成。


(图片来源:Angew. Chem. Int. Ed.)


三取代的吡啶衍生物的合成(Scheme 1)。首先,以适当保护的精氨酸衍生物6为底物,其可与鏻盐7进行偶联反应,生成二酰基-叶立德化合物8,收率为83%。通过进一步的优化,8在DMDO条件下进行氧化,可获得三羰基化合物9,收率为88%。9与硫代氨基草酸乙酯(10)反应,生成三嗪中间体11,其无需进一步的分离,可直接通过溶剂交换和添加降冰片二烯进行aza Diels–Alder反应,获得三取代的吡啶衍生物13,收率为86%(Scheme 1a)。为了进一步简化合成的过程,以14为底物,通过一锅串联氧化/aza Diels–Alder反应,可直接合成三取代的吡啶衍生物13,收率为73%。同时,这种流线型的一锅吡啶合成策略还可用于其它几种氨基酸,即甘氨酸(15)、苯丙氨酸(16)和天冬氨酸(17)衍生物(Scheme 1b)。值得注意的是,15是天然产物pyritide A1(1)的亚单元,而1617是容易获得的pyritide核心类似物。


(图片来源:Angew. Chem. Int. Ed.)


Pyritide A2(2)的全合成(Scheme 2)。三取代的吡啶衍生物13在TFA条件下进行去Boc保护后,再在EDC/HOAt介导下与四肽18进行偶联,获得线性肽19,两步收率为78%。19在TASF/TFA/T3P条件下进行大环化反应,获得17元大环化合物20,三步总收率为48%。通过进一步的优化,20中的酯基在Me3SnOH条件下进行水解后,可与21HCl进行偶联反应,获得受保护的pyritide A2(22),两步总收率为48%。22进行氢解后,可获得最终的pyritide A2(2),收率为87%。分离的pyritide A2的1H NMR光谱数据与2非常吻合。


(图片来源:Angew. Chem. Int. Ed.)


总结:美国伊利诺伊大学与意大利帕维亚大学David Sarlah课题组首次完成了pyritide A2的全合成,它是基因组挖掘发现的天然产物家族的成员,其特征在于独特的含吡啶大环化合物。作者以适当保护的精氨酸衍生物为底物,合成了邻位三羰基化合物,其经进一步的缩合和aza Diels–Alder反应,可获得吡啶衍生物。同时,该策略还可用于合成其它pyritide类似物的合成。

论文信息:
Bioinspired Total Synthesis of Pyritide A2 via Pyridine Ring Synthesis
Annie R. Hooper, Andraž Oštrek, Ana Milian-Lopez, and Prof. David Sarlah*
Angew. Chem. Int. Ed. DOI: 10.1002/anie.202212299


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