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体系课2课表出炉|易操作,易出图,学好这些分析工具,一招鲜

TBM学院 肿瘤标志物学术前沿 2022-07-02
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关于肿瘤标志物挖掘技术与应用体系课

由肿瘤测序及大数据分析专家委员会倾力打造,已搭建9大课程体系及主体课程内容,涵盖从基础的公共数据库使用分析,到高阶的组学测序数据挖掘。既有基础理论、实操讲解,还有研究设计与实例解析,更有独创分析方法/数据库讲解。学员可根据自身研究方向及实际科研需求选择多种课程。


体系课学术指导委员会(按姓氏拼音排序)


关于体系课2-“常用高通量数据分析工具介绍(数据实例应用)”

您将学到什么

在本课程中,您将认识并操作19个常用高通量数据分析工具。归纳为5个方向包括数据挖掘、功能分析、网络作图分析、统计分析和生存分析工具。您将系统学习并操作这些分析工具,结合分析实例了解如何运用在科研中。尤其您将学会如何通过综合运用这些分析工具筛选相关肿瘤标志物,助力课题设计或科研成果发表。


关于体系课2-“常用高通量数据分析工具介绍(数据实例应用)”

讲师团队

(按讲课顺序排名)




    郭向前

河南大学教授、博士生导师、黄河学者、特聘教授,基础医学院副院长、医学生物信息学研究所所长、河南省肿瘤分子诊断与精准治疗工程技术研究中心副主任,河南省学术技术带头人,河南省高层次人才,河南省高校科技创新人才,河南省高等学校青年骨干教师,开封市优秀教师。担任中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会肿瘤测序及大数据分析专家委员会常务委员、中国微循环学会转化医学专业委员会常务委员、青年工作委员会主任委员等社会职务。已发表SCI论文63篇(含接收),论文期刊影响因子之和为403.45,论文被引用1900多次,个人H index为18,其中数十篇论文发表在领域顶尖和权威期刊,包括New England Journal of Medicine,Lancet Oncology, Clinical Cancer Research等。近年来,主要从事肿瘤基因标志物筛选、肿瘤分子分型、肿瘤基因靶向治疗、医学生物信息学等研究,先后和团队成员定义了平滑肌肉瘤、食管腺癌、食管鳞癌、默克尔细胞癌、早期结肠癌等多种肿瘤分子亚型,提出了针对不同分子亚型的精准诊疗方案;研发了针对27种肿瘤的在线预后分析工具,且两年内工具被访问6万3千多次。




   安 杨

博士,硕士研究生导师。中国微循环学会转化医学专业委员会青年委员,河南省抗癌协会肿瘤临床精准诊断与治疗专业委员会委员。研究方向为肿瘤分子生物学,主要从事肿瘤分子分型相关分析及肿瘤预后标记物分析、促癌基因功能及其分子调控机制研究。先后在学术杂志上发表多篇SCI论文,参与国家级和省级课题5项,承担本科生和研究生教学工作,指导4项河南大学大学生创新创业训练计划项目(2项已推荐申报省级以上项目)。




    李会敏

医学博士,河南大学基础医学院副教授,中国微循环学会转化医学专业委员会青年委员,河南省抗癌协会肿瘤临床精准诊断与治疗专业委员会委员,主持、参与河南省科技厅项目两项,在Ebiomedicine, Aging,RSC advance, Journal of Cellular and Molecular Medicine等SCI杂志上发表论文10余篇,主要从事甲基化肿瘤(泛癌)预后标志物研发及其功能机制研究,肿瘤(泛癌)复发转移数据筛选及在线工具研发,卵巢癌诊断预后标志物的开发及功能机制研究。承担本科生部分基础医学课程。




  黄 艳

生物信息专业博士研究生。研究方向主要为预测转录因子时空特异结合事件以及利用单细胞数据揭示结直肠癌中部分甲基化结构域的异质性。黄艳博士利用多组学数据(包括DNA甲基化、组蛋白修饰、基因表达)对组织处于不同状态下转录因子结合事件的预测研究(Epigenomics)。




  顾 悦

博士后。哈尔滨工业大学生物工程专业博士后流动站,中国抗癌协会肿瘤标志物专委会委员,2015年获得哈尔滨医科大学生物信息学专业学士学位,2020年获得哈尔滨医科大学生物医学工程博士学位。自2013年以来师从哈尔滨工业大学张岩教授。主要的从事计算表观遗传学以及高通量数据的生物信息学分析的研究,包括了疾病进展过程中关键DNA甲基化预后标志物的识别,肿瘤标志物的筛选及功能分析等。科研成果在《Nucleic Acids Research》,《Front Bioeng Biotechnol》、《Epigenomics》等有国际影响的杂志上发表了sci文章7篇,包含DNA甲基化、环状RNA,肿瘤标志物,生物信息学数据库等多个研究方向。




  郑 红

医学博士,河南大学基础医学院教授,硕士研究生导师,中国微循环学会转化医学专业委员会委员。近年来,主要从事肿瘤基因标记物筛选及基因靶向治疗研究,主持、参与国家级和省级课题5项,发表论文20余篇,主编、参编著作和教材4部。教学经验丰富,讲课深入浅出,条理清楚。




  张 璐

医学博士,河南大学基础医学院副教授,中国微循环学会转化医学专业委员会青年委员,河南省抗癌协会肿瘤临床精准诊断与治疗专业委员会委员。参与国家自然基金1项,在Int J Cardiol,J Diabetes,Cancer Cell Int.等杂志发表SCI论文10余篇。近年来,主要从事慢性病现场流行病学、肿瘤转录组和蛋白组预后标志物数据库开发、肿瘤预后标志物筛选及分子机制研究。



关于体系课2-“常用高通量数据分析工具介绍(数据实例应用)”

课程内容


第一部分  综述:常用工具助力肿瘤标志物的筛选

(理论课:1h)

第二部分  ONCOMINE数据库介绍及应用

(理论+实操课:1h)

授课老师:

郭向前 教授

本节概要:

系统阐述课程涉及的常用工具以及oncomine数据库


第三部分  功能分析工具

(理论+实操课:5h)

授课老师:

安   杨 副教授

李会敏 副教授

本节概要:

GSEA、DAVID、GREAT三大常用工具详解及应用(示例图如下)

GSEA分析

David分析

GREAT分析


第四部分  网络分析工具

(理论+实操课:4h)

授课老师:

黄 艳 博士

顾 悦 博后

本节概要:

String、Cytoscape、WGCNAT三大常用工具详解及应用 (示例图如下)

GSEA分析

WGCNA分析

Cytoscape分析


第五部分  生存分析工具

(理论+实操课:3.5h)

授课老师:

郑 红 教授

本节概要:

九种生存工具详解及应用(示例图如下)

LOGpc、kaplan-Meier plotter、UALCAN

GEPIA、OncoLnc、cBioPortal

GSCALite、MethSurv、SurvMicro

生存分析a

生存分析b


第六部分  统计分析工具

(理论+实操课:3.5h)

授课老师:

张 璐 副教授

本节概要:

SPSS、Metascape介绍及应用

SPSS统计分析

Metascape作图分析


上课时间

采纳学员建议,本期课程内容分散在一周内的周四至周日,便于知识消化吸收

9月10日19:00-21:00,11日19:00-21:00,12日全天、13日全天


结业证书

将由肿瘤标志专委会和肿瘤测序及大数据分析专家委员会共同颁发、专家签名认证,是对您学习成果的权威认可。


优享福利

■ 独特授课

小班线上授课,直播+操作演示+1对1远程实操指导+听课群长期答疑

■ 专享回看

课程结束一周内听课群内获取回看地址,可限时回看授课视频一个月

■ 短期培养

可介绍推荐短期实习

■ 人才计划

得到肿瘤标志专委会“青年人才扶持计划”的机会

■ 培训优惠

可享受特别优惠参加体系课的其他课程


课程收费标准

■ 单价

2400¥/人

■ 团购价(3人以上)

1800¥/人

■ 必修课(3门课)

4800¥/人(98%的学员选择,点击查看完整必修课


报名方式

1.扫描填写报名表

2.扫码添加工作人员微信咨询

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