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Bioinformatics:生物信息学,揭示生物学奥秘

科学私享 科学私享 2022-10-07


生物信息学英文书籍大全

编者按:

生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学,计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。

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2019.03.13

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ID:SWXXX-001

标题:软计算与医学生物信息学

作者:Naresh Babu Muppalaneni,Maode Ma,Sasikumar Gurumoorthy

出版商:Springer

年份:2019

本书重点介绍了软计算技术在医学生物信息学中的应用。它反映了软计算和生物信息学方面的最新研究,包括理论,算法,数值模拟以及误差和不确定性分析。它还涉及计算机科学中新处理技术的新应用。本书对计算机科学和工程领域的学生和研究人员都很有用。

  1. 一种新的进化自动聚类技术,通过将初始种子选择算法统一到基于教学的优化

  2. 使用多种数据集来构建基于乳腺癌的蛋白质 - 蛋白质相互作用网络

  3. 设计和实施智能系统检测恶意Facebook帖子使用支持向量机(SVM)

  4. 使用神经网络分类糖尿病视网膜病变异常血管

  5. 将光谱聚类与阴影聚类杂交

  6. 分布式和大数据集群环境的降维和存储优化技术

  7. 概念漂移数据流的集合分类器的比较分析

  8. 机器学习算法与ROC曲线预测和诊断心脏病

  9. 帕金森病深部脑刺激器的丘脑底核神经信号微电极记录的潜在变量因子主成分分析

  10. CNN数据挖掘算法检测信用卡欺诈

  11. 智能交通系统中的计算智能方法和大数据分析研究

  12. 数据分析中有效数据重复数据删除的调查

  13. 使用FTD树分类阿尔茨海默病(

  14. 瑜伽冥想对身心健康参数认知影响的实验研究使用Electro Encephalogram

ID:SWXXX-002

标题:计算生物学和生物信息学的实际应用

作者:Florentino Fdez-Riverola,Mohd Saberi Mohamad,Miguel Rocha,Juan F. De Paz,PascualGonzález

出版商:施普林格国际出版社

年份:2019

本书介绍了生物信息学和计算生物学领域的最新国际研究。它包括生物信息学,系统生物学,组学数据分析和挖掘,生物医学应用和序列中的机器学习领域的各种研究,这些研究由国际委员会选出,并在第12届计算生物学和生物信息学实际应用国际会议上发表。

ID:SWXXX-003

标题:认知科学与健康生物信息学:进展与应用

作者:Raghu B. Korrapati,Ch.Divakar,G.Lavanya Devi

出版商:Springer

年份:2018

本书从信息处理的角度强调了对认知,思维和行为的跨学科研究,并描述了与健康信息学相关的应用。各章涉及健康问题解决和教育,决策支持系统,以用户为中心的界面,以及受控医学术语的设计和使用。反映了计算方法的前沿研究 - 包括理论,算法,数值模拟,误差和不确定性分析及其应用 - 本书为计算机科学与工程领域的博士生和研究人员提供了宝贵的资源。

  1. 基因分型微阵列数据分析中图像分析算法的设计

  2. 感伤分析关于使用R的认知数据

  3. 使用计算生物学研究与MODY相关的蛋白质

  4. 编码,解码和糖尿病

  5. 自动区域分割和基于方差的多模医学图像融合

  6. 参与糖尿病的阿尔法葡萄糖苷酶的模拟和对接研究

  7. 预测大肠杆菌蛋白质的NTP酶活性

  8. 白藜芦醇的结合研究使用谷氨酸受体3B作为靶标模型对神经变性的保护作用

  9. 基于粗糙集理论的缺失价值估算

  10. 计算预测参与II型糖尿病的多蛋白靶标配体

  11. 使用中心性测量识别自闭症中的关键基因

ID:SWXXX-004

标题:生物信息学软件:一种基于Wolfam语言的组学

作者:George Mias

出版社:Springer

年份:2018

ID:SWXXX-005

标题:应用生物信息学:简介

作者:Paul M. Selzer,RichardJ.Marhöfer,Oliver Koch

出版商:施普林格

年份:2018

ID:SWXXX-006

标题:生物信息学研究与应用

作者:Fa Zhang,Zhipeng Cai,Pavel Skums,Shihua Zhang

出版商:施普林格国际出版社

年份:2018

本书构成了2018年6月在中国北京举行的第14届国际生物信息学研究与应用大会ISBRA 2018的会议记录。

本卷中的24篇全文和10篇短文均经过仔细审查,共选出138篇。意见书。他们的组织主题是:网络分析和建模; 基因组数据分析; 癌症数据分析; 结构与互动; HPC和CryoEM; 机器和深度学习; 数据分析和方法; 分析和可视化工具; 和RNA-Seq数据分析。

ID:SWXXX-007

标题:生物信息学的当前趋势

作者:Gulshan Wadhwa,P。Shanmughavel,Atul Kumar Singh,Jayesh R. Bellare

出版商:施普林格新加坡

年份:2018

本书重点介绍了生物信息学的最新突破性进展。它提供了一系列及时,深入的评论,药物临床试验研究,生物多样性信息学和主题问题。此外,它还包括对计算分子/结构生物学进展的深刻见解,这些研究涉及生物医学和基因组学计算,计算蛋白质组学和系统生物学以及代谢途径工程等领域。这些领域的创新直接影响与医疗保健,医药,遗传疾病,农产品开发,可再生能源和环境保护相关的关键问题。

该书由该领域的知名领导者撰写,涵盖了涉及生物学与计算机和信息科学相结合的广泛主题,为本科和研究生水平的教学提供了理想的基础。它还可以用于有兴趣应用基于生物信息学的分析方法的研究人员和与学术和工业实验室合作的信息技术人员的自我指导。

  1. 生物信息学中使用的生物数据库的见解

  2. 下一代基因组测序中的生物信息学

  3. 生物信息学在表观遗传学中的作用

  4. 碳水化合物和糖信息学的三维结构:概述

  5. 表观基因组:基因组表达指南

  6. 分子模型和药物设计:霍乱弧菌的当代分析

  7. 建模聚酮化合物合成酶和类似的大分子复合物

  8. 关于结肠癌的Silico研究

  9. 免疫信息学的工具,数据库和应用

  10. 采用生物信息学软件的代谢途径分析

  11. RNA诱导的沉默复合体的交互作用

  12. 计算工具:真菌治疗中的RNA干扰

  13. 病原体中的全基因组必需基因鉴定

  14. 疾病信息学

  15. 疟疾和贫血症的发展筛查:医学影像信息学方法

  16. 生物信息学在艾滋病毒/艾滋病耐药性预测中的作用

  17. 动物育种和遗传学的生物信息学方法

  18. α-淀粉酶抑制剂在控制糖尿病中的表现:计算生物学的应用

ID:SWXXX-008

标题:用于蛋白质生物信息学的可扩展大数据分析:蛋白质结构的高效计算解决方案

作者:Dariusz Mrozek

出版商:施普林格

年份:2018

本书重点介绍蛋白质及其结构。该文本描述了用于蛋白质结构相似性搜索的各种可扩展解决方案,其在主要表示水平上进行并且用于预测蛋白质的3D结构。重点放在可用于加速相似性搜索和蛋白质结构建模过程的技术上。本书内容分为四个部分。第1部分提供了蛋白质及其表达水平的背景信息,包括计算过程中使用的3D蛋白质结构的正式模型,以及书中提出的解决方案中使用的技术的简要概述。本书的第2部分讨论了用于开发可扩展和可靠的云应用程序的云服务,用于3D蛋白质结构相似性搜索和蛋白质结构预测。本书的第3部分展示了可扩展的大数据计算框架(如Hadoop和Spark)在大规模3D蛋白质结构比对中的应用以及蛋白质结构中固有无序区域的识别。本书的第4部分着重于寻找3D蛋白质结构的相似性,本书介绍了先进技术和计算架构,这些技术和计算架构受益于计算和并行领域的最新成就。计算机科学的最新发展使得以前认为过于耗时的算法现在可以有效地用于生物信息学和生命科学中的应用。鉴于其深度覆盖,本书将对结构生物信息学和生物医学数据库领域的研究人员和软件开发人员感兴趣。

ID:SWXXX-009

标题:生物信息学算法:Python中的设计和实现

作者:Miguel Rocha,Pedro G. Ferreira

出版商:学术出版社

年份:2018

生物信息学算法:Python中的设计和实现提供了一本关于许多最重要的生物信息学问题的综合性书籍,提出了最佳算法并展示了如何实现它们。本书重点介绍Python编程语言及其算法的使用,这种语言很快成为生物信息学领域最流行的语言。读者将找到他们所需的工具,以提高他们在算法开发和实现方面的知识和技能,并且还将发现生物信息学应用程序的原型,这些应用程序展示了真实世界应用程序的主要原理。•为生物信息学专业学生提供理想的文本,对计算机编程知之甚少•基于作者在自己教室中使用的超过12年的教学材料•具有可下载代码和可运行示例(如使用Jupyter笔记本)的相关网站以及与本书相关的练习

ID:SWXXX-010

标题:微生物学生物信息学概论

作者:Henrik Christensen

出版商:施普林格国际出版社

年份:2018

本教材介绍了生物信息学的基本概念,并提高了学生使用与微生物学研究相关的软件和工具的技能。显示了最相关的数据分析方法,并介绍了如何根据获得的结果得出有效结论的读者。提供可在互联网上免费使用的软件和服务器,并建议使用更高级的独立程序作为第二选项。每章末尾都提供练习和训练测验,以方便学习。本书针对博士生和微生物学,生物技术和(兽医)医学方面的本科生,他们对生物信息学知之甚少。

  1. 介绍

  2. DNA序列组装和基因注释

  3. 数据库和蛋白质结构

  4. 成对对齐,多重对齐和BLAST

  5. 引子设计

  6. 分子序列数据的系统发育分析简介

  7. 基于序列的原核生物分类和鉴定

  8. 用于宏基因组学的16S rRNA扩增子测序

  9. 全鸟枪法DNA宏基因组学 

  10. 转录组学

  11. 基于序列的原核生物分型

ID:SWXXX-011

标题:生物统计学和生物信息学的新前沿

作者:Yichuan Zhao, Ding-Geng Chen

出版商:施普林格国际出版社

年份:2018

本书由2017年5月5日至7日在亚特兰大举行的第5届生物统计学和生物信息学研讨会上发表的演讲组成。本书展出了22篇来自研讨会的论文,展示了该领域的最新进展,展示了新的方法。生物统计学,生物信息学和跨学科领域的边界,理论和案例应用。近年来,生物统计学和生物信息学在统计学和其他科学研究领域发挥着关键作用。第五届生物统计学和生物信息学研讨会的目标是促进研究,促进现场研究人员之间的互动,并为大数据时代的学习和促进研究合作提供机会。由此产生的卷为研究人员,学生和行业从业者提供及时的见解。

ID:SWXXX-012

标题:Python的生物信息学计算方法3.4

作者:Jason Kinser

出版商:

年份:2017

ID:SWXXX-013

标题:生物信息学:第1卷:数据,序列分析和进化

作者:Jonathan M. Keith

出版商:Humana Press

年份:2017

第2版提供了更新和扩展的章节,涵盖了快速发展和扩展的生物信息学领域中广泛的有用和现有方法。生物信息学,第1卷:数据,序列分析和进化,第2版由3部分组成:数据和数据库,序列分析,以及系统发育和进化。第1部分详细介绍了序列和结构数据生成中的生物信息学方法及其在概念类别中的组织,以及便于进一步分析的数据库。序列分析部分描述了处理生物分子序列的基本方法:几乎在每个生物信息学分析管道中使用的技术,特别是在这些管道的初级阶段。最后但并非最不重要的,系统发育和进化部分涉及比较生物序列的方法,以便了解它们是如何进化的。作为非常成功的“分子生物学方法”系列的一本书,章节介绍了详细信息和专家实施建议,以确保取得积极成果。全面而实用的生物信息学,第2卷:数据,序列分析和进化,第2版是研究生,早期职业研究人员和其他正在将新的生物信息学方法整合到他们研究中的人的重要资源。

ID:SWXXX-014

标题:生物信息学:第2卷:结构,功能和应用

作者:Jonathan M. Keith

出版商:Humana Press

年份:2017

ID:SWXXX-015

标题:蛋白质组生物信息学

作者:Shivakumar Keerthikumar,Suresh Mathivanan

出版商:Humana Press

年份:2017

这本全面的书涵盖了最新的蛋白质组学技术,数据库,生物信息学工具和计算方法,用于蛋白质及其结构的鉴定和功能注释。讨论了生物医学科学界广泛用于存储和传播数据的最新蛋白质组学资源。此外,还详细描述了特定的MS / MS谱相似性评分函数及其在蛋白质组学领域中的应用,使用置换测试的标记比较蛋白质组学的统计评估,以及使用MS数据的系统发育分析方法。本书是为非常成功的分子生物学方法系列而编写的,其中包含了确保成功结果的详细信息和关键实施建议。权威和前沿的蛋白质组生物信息学为蛋白质组学领域的初学者和高级研究人员提供了有用的资源。

ID:SWXXX-016

标题:蛋白质生物信息学:从蛋白质修饰和网络到蛋白质组学

作者:Cathy H. Wu,Cecilia N. Arighi,Karen E. Ross

出版商:Humana Press

年份:2017

本卷介绍了蛋白质的生物信息学研究方法,特别关注蛋白质翻译后修饰(PTM)和网络。本书分为四个部分,涵盖了蛋白质序列,结构和功能分析的基本框架和主要资源; 用于分析蛋白质PTM,蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)和蛋白质网络的方法和资源,包括用于PPI预测的工具和用于构建PPI和PTM网络的方法; 和蛋白质组学中的生物信息学方法,包括基于质谱的蛋白质组学的计算方法和用于功能发现的替代剪接异构体的综合分析。写在非常成功的分子生物学方法系列格式中,章节包括对各自主题的介绍,前沿和彻底的蛋白质生物信息学:从蛋白质修饰和网络到蛋白质组学,对于希望了解最先进的生物信息学数据库和工具,新的计算方法以及蛋白质和蛋白质组学的未来趋势的读者来说是一种宝贵的资源。系统生物学中的数据分析。本书对于从事生物技术和制药行业以及各种学术部门(如生物和医学科学,计算机科学和工程)的研究人员非常有用。

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