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olex2如何绘制pipi堆积图(图文)

结构分析表征 结构分析表征 2022-05-18

olex2不仅可以用来解析单晶结构,还是很好的绘图工具,之前我们介绍了如何绘制氢键(请戳如何用olex2绘制氢键(图文)如何用olex2绘制氢键(视频)),这次我们介绍如何绘制pipi堆积:

1.首先打开olex2(公众号后台回复软件名获取安装包,有个优化版,响应很快且免安装)自带的数据Co110;

2,主要研究pipi,为了直观,我们ctrl+H可把不需要的氢原子隐藏,如果需要让H显示出来,继续点击ctrl+H;

3.在图中选中平面内一个原子,然后右键点击select ring,选中一个平面,左下角输入mpln生成平面;

4.在背景中生成了平面的信息,如果想保存此信息,输入text,弹出的界面保存即可,如果想清除,输入clear;

5.选中平面的某一面,右键点击gtaphics可以对平面、质心的颜色等属性进行修改

6.更改好合适的平面属性后,左下角输入pipi -g,即可生成pipi堆积图,每个pipi堆积的图均在背景显示,同样的,输入text查看并保存信息,输入clear清除界面;

7.pipi堆积的两个参数,一个是质心-质心的距离,一个是滑移距离,根据,直角三角形可以计算出theta;


8.如果需要标注出质心质心距离,选中两个面,输入line,双击出现的距离还可以根据需要修改合适的有效数字;

9.如果需要方差数据,可以输入esd;

10.根据需要调整合适的角度后,点击work-draw-bimap即可根据情况选择合适的参数出图。

视频教程:

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