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PRL速递:重整化群方法解码生命无序系统结构

集智编辑部 集智俱乐部
2024-11-16


关键词:无序系统,重整化群,关联函数,临界指数,西奈模型


论文题目:Experimental Test of Sinai’s Model in DNA Unzipping论文来源:Physical Review Letters论文链接:https://journals.aps.org/prl/abstract/10.1103/PhysRevLett.130.208401

自薛定谔视基因为非周期晶体以来,无序就被认为是生命的关键组分。混乱和无规则的物质要素组成无序系统,其中的关联函数和临界指数的实验测量是检验重整化群(renormalization group,RG)预测的关键。“重整化”的意思是,每到你感兴趣的一个空间尺度,都能暂停下来总结所得。

最近发表在Physical Review Letters的一篇文章用光镊(optical tweezers)解码了 DNA发夹结构(DNA hairpin structure,由于DNA单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,形成氢键结合而成)。这个光镊就是西奈模型(Sinai model),即一维随机力场中粒子扩散运动的实验实现。

他们认为解拉链力(unzipping forces)Fw 是平衡态陷阱位置 w 的函数,并计算了力-力关联器 Δm(w),发现其振幅、关联长度与理论预测一致。他们研究了泛标度性质,发现在解链连接处碱基对位置的波动u标度及其粗糙度指数与理论预测相差无几。他们的研究为处于平衡状态的无序弹性系统提供了有效的重整化群方法的单分子测试

图1. a)实验装置;b)解码与重编码下的力-距曲线;c)不同盐浓度情况下的力-距曲线。


图2. 实测力-力相关器Δm(w)。



编译|朱欣怡

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