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第一届动物磁共振脑影像数据处理班

杨晓飞 思影科技 2019-06-30

请点击上面蓝色“思影科技”四个字,关注我们,思影是一家数据驱动型科技企业(类似于甲骨文,pied piper之类)。

重庆思影科技有限公司将于2018630-- 201873(周六-下周二)举办第一届动物磁共振脑影像数据处理班(详见课表安排)。

1、培训简介

近年来,世界各国都颁布了各自的脑科学计划,旨在探究大脑运作的神经机制,以推动神经、精神疾病临床、人工智能等领域的发展。运用功能、DTI等磁共振成像技术,各国研究者已取得了广泛成就,顶级期刊上磁共振脑成像相关研究也屡见不鲜。人类磁共振研究虽占据主流,然而一些特殊工作只适合动物研究,因此,针对啮齿类、以及一些非人灵长类动物的研究得到了重视。目前,结合基因、光遗传等技术,基于动物模型的磁共振成像已在抑郁症、卒中、疼痛、老年退行性疾病等领域取得进展,为推动脑科学研究的发展起到了极大的作用。动物磁共振研究和人类具有差异,如脑结构的不同等等,因而数据分析成为了啮齿类动物磁共振脑影像研究者们的难题。

为此,思影科技拟举办动物磁共振影像数据处理培训班,欢迎致力于动物磁共振脑影像的研究者参加,希望通过此次培训,熟练掌握数据处理技能,为开展的研究项目助力。

2、培训对象

本次培训班面向的对象是一些希望利用动物磁共振脑影像进行科研的医生、研究人员等,培训班实行小班教学,授课、操作、指导及问题解决一体化,最终努力使参会学员达到能够独立进行数据处理的目的。

培训内容主要包括:Rat fMRI数据处理、Rat脑功能指标计算及其统计分析、Rat DTI数据处理和基于ROI的脑影像分析、Rat概率性纤维束跟踪等。

注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(9:00 - 21:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。

3课程安排

时间

课程名

主要内容

第一天

吴国榕

6月30日

上午

Rat fMRI数据处理

  • Rat fMRI简介

  • 数据整理及格式转换

  • MRIcron简介

下午

  • Matlab基本操作

  • SPM数据分析原理和流程

  • Rat fMRI数据处理操作

  • 数据处理质量检查

 

 

 

第二天

吴国榕

7月1日

 

 

 

 

 

 

上午

 

 

 

 

Rat脑功能指标计算

及其统计分析

  • 基于GLM的任务态分析

  • ALFF、ReHo指标计算

  • ROI绘制与数据提取

 

下午

  • 种子点功能连接计算

  • 基于SPM、SPSS的统计分析(t检验,方差分析及多重比较校正等)

 

晚上

  • 体素水平的统计结果报告

  • 可视化作图

第三天

谢桑马

7月2日

上午

Rat DTI数据处理

和基于ROI的脑影像分析

  • 扩散磁共振成像基本原理介绍

  • DTI数据基本分析方法概述

  • Linux常用命令及相关软件介绍

  • DTI数据的预处理

下午

  • 扩散张量及相关指标计算

  • ROI的提取

  • ROI的配准和空间转换

  • 基于ROI的DTI相关指标分析

第四天

谢桑马

7月3日

 

上午

Rat概率性纤维束跟踪

  • 概率性纤维束跟踪的基本原理

  • 概率性纤维束跟踪的模型构建

  • 概率性纤维束跟踪的实现


  • 概率性纤维束跟踪的结果查看

  • 概率性纤维束跟踪的量化统计

  • 基于概率纤维跟踪的网络构建

下午

4、培训地点

重庆市渝中区青年路38号重庆国贸中心2004#,具体见会议指南。

5、培训人数

为保证培训质量,此次培训限定人数20人左右,报名请从速。

6、培训费用

所有参会人员3000/人(含资料费、培训费和午餐费,交通及住宿费自理)。

7、报名方式

请将报名回执发送至:syfmri@163.com

8、缴费方式

银行转账或者支付宝(18580429226,户名:杨晓飞),谢绝录像,主办方提供发票。

9、联系方式

联系人:彭庭烨。电话:023-63084468/15123187262

10、备注

请各位培训学员自带笔记本电脑(windows 64位系统、i58G内存、50G剩余存储空间等基本配置);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;并在620前进行缴费及将回执表发给彭小姐,便于培训安排。

报名回执表

单位名称

(发票抬头)


姓名


性别


QQ


电话号码


科室/专业


缴费方式

□转帐  □支付宝 (请选择在□打

银行信息

户名:重庆思影科技有限公司

账号:123909127710102

开户银行:招商银行重庆分行渝中支行

汇款备注

 

第一届动物磁共振脑影像数据处理班

 

注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!

11、在线支持服务

参加培训学员将得到在线技术支持服务,伴随参加培训班的学员共同成长。

12、培训人员简介:

吴国榕,博士,西南大学心理学部副研究员。主要研究方向是基于神经影像数据的动态脑功能活动和脑连接分析算法开发。相关文章发表在MedicalImage Analysis,Brain Stimulation等学术期刊上。开发了Brain GPS,NICE和DynamicBC(http://restfmri.net/forum/DynamicBC)等数据分析软件。目前,主持一项国自然青年项目,参与多项国自然面上和重点项目。

谢桑马,博士,20171月毕业于中国科学院自动化研究所。主要研究方向为扩散磁共振成像的计算理论和方法、脑影像数据分析软件开发以及扩散磁共振成像在精神疾病中的应用。扩散磁共振成像分析软件DiffusionKit的主要开发者,获得软件著作权一项。熟练掌握扩散磁共振成像领域的主流方法,精通相关软件的操作使用。目前,已在PLOS ONEJournal ofNeuroscience MethodsTranslational Psychiatry等国际杂志以第一作者发表SCI论文3篇,参与多项国家自然基金项目,同时担任国际期刊IEEE Transactions onMedical Imaging等杂志审稿人。

 

WORD版本下载链接:

链接: https://pan.baidu.com/s/1tSqfOwJzLmdtC3LkKibnMQ 密码: 8npt


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