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你的身高一不小心要暴露了?这都要怪AI算法和基因组信息!

药明康德AI 药明康德AI 2019-06-30

药明康德AI/报道


我们之前的一篇文章讲到,AI可以从太空中检测某个地区的肥胖率,一不小心就可能暴露了自己体重的秘密。而如今,AI又对身高“下手”了:近日,来自密歇根州立大学(Michigan State University,MSU)的研究人员创建了一种基于AI算法的新型DNA工具,可以准确预测人们的身高,误差仅在1英寸(约2.5厘米)之内!这项研究发表在了《Genetics》上。

本文来源:药明康德AI

传统的基因检测通常会寻找一个人的基因或染色体的特定变化,这些变化可以表明一个人患乳腺癌等疾病的风险是否会更高。此次MSU的研究人员研究了众多的基因组差异,并在数以万计的基因变化基础上构建了一个身高预测模型。


▲每个人的基因组里都有着很多有用的信息(图片来源:123RF)


研究人员利用来自UK Biobank的数据,分析了大约50万人的DNA和基因信息。他们着眼于每个人的基因构成和身高,并利用这些信息对算法进行训练,从而让计算机可以识别出这些信息中的差异。经过这个过程后,算法就可以从每个人的基因组信息中对身高进行预测。在实际验证测试中,算法预测的身高结果与实际身高的误差在一英寸(约2.5厘米)以内


除了预测身高之外,算法还可以从每个人的基因组信息中对他们的骨密度和受教育程度进行预测。虽然这两项指标的精确度不如身高,但是目前的结果已经足以识别出那些骨密度较低、即易患骨质疏松症的人群,或者是在学校表现不佳的人群。


更重要的是,研究人员开发出的这种新方法,可以用来评估人们患心脏病、糖尿病和癌症等严重疾病的风险。研究人员表示,随着计算能力的增强和DNA测序成本的降低,那些曾被认为需要花费5到10年才能完成的研究,如今得以迅速有效的完成。这有助于大幅推进精准健康的实践,使得医生能够尽早介入患者的治疗过程,从而预防或延缓疾病。


这项研究的负责人、MSU研究和研究生事务副校长Stephen Hsu博士(图片来源:Derrick L. Turner, Michigan State University)


我们的团队认为这是医学的未来,”这项研究的负责人、MSU研究和研究生事务副校长Stephen Hsu博士表示:“对于患者来说,基因组测试可以像用棉签擦拭脸部一样简单,并且只需约50美元的费用。 一旦我们计算出遗传相关疾病的预测因子,进行早期干预可以节省数十亿美元的治疗费用,更重要的是可以挽救患者的生命。”


Hsu博士的团队下一步工作是继续改进算法,同时挖掘更大、更多样化的数据集。这些举措将进一步验证新开发出来的技术,并帮助绘制出这些重要性状和疾病风险的遗传结构。 


参考资料:

[1] New DNA tool predicts height, shows promise for serious illness assessment. Retrieved October 18, 2018, from https://www.eurekalert.org/pub_releases/2018-10/msu-ndt100418.php


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