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论文作图只知Graphpad?超详细攻略来了!

小六儿 科研讲坛 2021-02-21

混迹在实验中数年,我们怎能只知道Graphpad,而不知Origin呢!今天小六儿就跟大家分享一下Origin这款强大的制图软件。

Origin是科研人员常用的高级数据分析和制图软件,在功能上,它和其他统计学作图软件基本相同,都是基于数据分析和绘图两大功能完成任务。但是相对于Graphpad而言,它不仅可以满足入门级别简单的制图需要,也可以满足像工程师一样的高级用户对于数据分析和函数拟合的需求。

接下来,我通过具体事例给大家介绍最新版本OriginPro 9.0的页面分布和常规作图介绍。


OriginPro 9.0包括12种图形类型,我们日常用的比较多的有Line(线型)、Symbol (符号)、Line+ Symbol(线型+符号)、Columns/Bars(柱状图)、Multi/Curve(曲线图)、Statistics(统计)、Area(面积)和Specialized(其他特殊类型)。执行菜单命令,点击File-Import即可导入数据。

1、绘制柱状图
打开OriginPro9.0软件,我们可以直接将数据导入到软件中,但是前提条件是需要把数据保存成txtdat格式才可以。

我们可以在OriginPro9.0中使用菜单命令,点击File/Import/Single ASCII,导入数据文件,但这种方式会覆盖软件中已有的数据,所以通常是在空白表格时使用这种方法。当然了,你也可以直接复制粘贴数据。


软件推荐的作图方式是点击菜单栏中的Plot,选择你需要的图形类型。


但是上述步骤操作起来略微复杂,就像在Graphpad中可以直接点击Data查找图片一样,我们可以直接选中A(X)B(Y)两栏数据,点击页面左下角的图形类型直接作出图片。


作图的目的就是让数据可视化,结果不仅要美观更要准确。所以我们在选中图形类型之后,我们还要对横纵坐标、图层以及整体图形进行设置。

坐标轴设置
双击图形中的X轴,页面就会弹出X Axis的对话框。在这里,Tick Labels用来设置坐标轴类型、颜色、大小和小数点位置等等。这里要注意将字体大小调整到最大或者36,因为论文中的图片往往是缩小之后的排版,这样的情况下,虽然能看清楚各组变化趋势,但却看不清文字说明。设置好了之后,点击Apply,相当于是对整个图层的参数设置,以后即使换了其他实验数据,也不需要重新美化图片了。


Scale用来设置坐标轴的起始位置和刻度线的分割情况。Title& Format主要是对坐标轴名称的命名、坐标轴刻度的方向和大小。Custom Tick Labels是对坐标轴分组名称位置的调整。Break 用来设置当坐标轴不是平均分布,数值差异较大的时候,可以在此处省略中间无用的数值。


Y轴的设置同上。

Graph设置
双击Graph中的柱状图,页面会出现Plot Details的对话框。在这个对话框中,我们可以对图形进行各方面的设定。Symbol可以设置每个数据点的表现形式,包括形状、颜色和大小;Line主要针对曲线的相关设置;Drop Line针对的散点图的设置。

我们现在的数据图片是条形图,那么在Plot type中选择Column/Bar,再进行参数的完善。选中【Book1】是对条形图的设置。

选中Layer1是对图层的设置。

OriginPro
OriginPro是小六儿新接触到的一个制图软件,相对于Graphpad而言,OriginPro既可以满足一般的制图需要,也可以进行数据分析、函数拟合的高级需求。
如果你碰到的数据中既有正值也有负值,那么做出的图像会是什么样儿的呢?还是上述的数据,我们将其中几组数据改变成负值,Graphpad做出来的图片如下:


但是我们想要的效果是X轴也同样上调到y=0的位置,这时候可以使用OriginPro满足你的要求。


用鼠标圈选AX)和BY)这两列数据,选择下方的作图类型,OriginPro中有一些自带的图形模板。例如柱状图、曲线等,单击你想要的表达类型即可。


图形的修改和美化与Graphpad 相似。如果想要调整柱状图的颜色、线条粗细等可以用鼠标双击柱状图或坐标轴进行调整,大家可以自己摸索一下,就不一一列举了。
那么如果我们想用OriginPro绘制复式柱状图,该怎么做呢?

2、复式柱状图
首先我们需要添加新的数列。在灰色面板上点击鼠标右键,在下拉栏中选择Add New Column,重复两次操作,就可以添加两列,之后导入数据即可。


之后按照上述的方法,选中所有的数据,点击下方的柱状图图表。


软件添加的数列默认是Y轴数据,但如果我们后续添加的数据是X轴的数据,只需选中这组数据,点击鼠标右键,选择Set As X即可。


OriginPro开头中我们提到的,Y轴的数值正负都有,我们想把X轴的起点对应Y轴的0,该怎么做呢?


这一点,在OriginPro中很好解决,只需要鼠标点击下方的X轴,向上拖动到Y=0的数轴上便可。


3、绘制复杂折线图
我们有时候会在一张图折线图中看到两个X轴和两个Y轴,这其中就涉及到了图层的概念。在一个窗口中绘制多个图层,可以方便我们创建和管理数据曲线。一个图层中含有坐标轴、数据和相应的文字说明,OriginPro利用这种方式将不同的数据图联系起来,相互叠加,形成一个具有更高展示效果的复合型数据图。

首先我们绘制一张简单的数据图。


在图形外单击鼠标右键,选择“New Layer(Axes)”、“Top X+Right YLinked Dimension)”,顶端和右侧就新增加了一个Y轴和X轴。


左上角的凹陷标识标识编辑状态,单击鼠标右键,选择“Layer Contents”,选中新添加的数据,点击右侧箭头将其添加到右侧的方框中。


但是新增加的数据看着和坐标轴并不是很协调,双击右侧坐标轴,在弹出“From”和“To”中根据数据添上合适的起止范围,调整好“Horizontal”的坐标,再调整“Vertical”的坐标,这一步相当于调整了横坐标和纵坐标。


接下来,为了区分开两组数据,分别双击图层2中的线条和文字,修改颜色。双击折线,在弹出的对话框中点击“Line”中的“Color”可修改线条颜色、“Width”可修改线条粗细;点击“Symbol”中的“Symbol color”可修改节点颜色、左下角的“Line+Symbol”可控制节点大小


双击坐标轴上的分组,在弹出的对话框中“Tick Labels”下的“Format/Color”可修改分组颜色,在“Lineand Ticks”中,点击“Thickness”可将相同的坐标轴修改成一样的数值;双击坐标轴,在弹出的对话框中点击“Title”中的“Color”可修改注释颜色。


4、绘制线性相关图片
在论文中,可以根据实验数据的散点图初步判断两组数据是否符合线性关系。
首先,导入数据,做出散点图。根据散点图初步判断为线性关系。

在菜单栏中点击“Analysis”,然后依次选择“Fitting”和“Linear Fit”,在弹出的对话框中,点击OK


在弹出的对话框中,选择“YES”,单击“OK”,就可展示出线性拟合的结果。


5、绘制非线性相关图片
导入数据,做散点图。根据图形初步判定为非线性形状。


单击Analysis”,然后选择“Fitting”和“Nonlinear Curve Fit”,在弹出的对话框中选择合适的“Setting”和“Function Selection”,选择合适的拟合函数,然后点击下方的Fit即可,后面的操作就和线性拟合相同了。


6、OriginPro结果导出
首先是模板的保存。我们可以把对柱状图或散点图的设置格式保存为模板,之后做类似的图形时就可以直接使用了。保存的方法是在菜单栏中点击“File/Save Template As”,在弹出的对话框中选择要保存的目录和模板文件名,单击“OK”即可。


那么在使用模板的时候,只需在菜单栏中选择“Graph/Plot Setup”,在弹出的对话框中,选择保存好的模板,点击“OK”即可。
接下来是图像的导出。有两种导出的方法:一是直接在图像空白处单击鼠标右键,选择“Copy page”,那么在其他工作软件中直接粘贴就可以了。利用这种方法导出的图像,在其他工作软件中依然可以通过双击图形回到OriginPro的编辑界面;


二是导出TIFF或其他格式的图片。点击菜单栏中的“File/Export Graphs”,选择所需要的格式,并可以在Imagesize中修改图片的大小。但是这种方法导出的图片无法双击图片回到OriginPro的编辑界面。


好了,这方面的内容就分享就到这里了。内容有点多,整理地要吐血了,如果中间有错误,欢迎大家批评指正,我们还会做到更好!

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