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首个GPCR激动剂抗体:安进中国

Armstrong 生物制药小编 2021-06-08

2020年1月15日,安进亚洲研发中心章美云博士团队在Science Advance期刊上发表其关于Apelin受体APJ激动剂抗体的研究文章“Structure-guided discovery of a single-domain antibody agonist against human apelin receptor”,文章第一作者为马彦彬。这是首个经报道的GPCR激动剂抗体。
GPCR作为七次跨膜蛋白,本身就很难构建,且A类GPCR的N末端更短,抗原性和免疫原性更弱。安进在GPCR抗体领域布局颇深,首个FDA批准的GPCR抗体CGRPR抗体Erenumab即来自安进(目前共有2款GPCR拮抗剂抗体上市,另一个是协和发酵麒麟的CCR4抗体Poteligeo)。在本文中,研究人员首先特殊设计抗原将APJ组装到Nanodisc和Proteoliposomes(提供类似于双层膜结构以稳定GPCR,常用于解析膜蛋白结构和GPCR抗原的构建),前者用于免疫骆驼,后者用于从骆驼抗体噬菌体库中筛选与APJ特异性结合的纳米抗体。筛选获得的186个纳米抗体中,106个具有拮抗剂活性,80个仅具有中性的结合作用,没有得到激动剂抗体。

通过与Apelin 13竞争性结合实验,筛选JN241作为候选抗体,其亲和力高达83pM,CDR3最长有23个氨基酸。JNJ241与Apelin 13的竞争抑制IC50在2种方法cAMP、β-arrestin 募集检测分别为5.9nM、7.0nM。在I125放射性标记-Apelin 13检测中抑制常数为0.1nM。

随后通过共结晶APJ-JN241复合体解析蛋白结构,得到3.2埃分辨率的晶体结构。APJ与JN241形成类似“酒瓶-瓶塞”(wine stopper)的结构,CDR3占据配体结合的口袋pocket。

下图BCD分别图示了CDR2、CDR1、CDR3与APJ相互作用的细节,蓝色断续线表示氢键,红色stick表示疏水相互作用。


将APJ/多肽配体AMG3054(Apelin 物)与APJ/JN241的结构对比,发现JN241的结合形式与配体高度类似,只是缺少与疏水核心的相互作用。受此启发,研究人员将3个带苯环的氨基酸:苯丙氨酸F、色氨酸W和酪氨酸Y,分别插入CDR3的对应区域(下图C),得到JN241突变体:JN241-7、JN241-8、JN241-9。其中插入老安全的JN241-9,从拮抗剂抗体变为激动剂抗体。cAMP检测中,EC50为36nM;β-arrestin募集检测中,EC50为47nM。

分子模拟中,JN241-9可以很好地与APJ发生疏水相互作用,并引起APJ一系列构象变化,最终激活APJ。


小编总结

由于APJ与JN241-9相互作用的关键氨基酸,在很多多肽配体的GPCR中较为保守,研究人员推测该发现或可对其他多肽配体的GPCR激活过程类似。

近年来,结构解析提示相互作用细节成为抗体研发中的重要手段,如天广实的埃博拉抗体即在ZMAPP基础上通过计算模拟优化相互作用后得到。此外,免疫检验点中刺激性信号的激动剂抗体,结合类似方法也可以提高获得高效激动剂抗体的效率。

安进在GPCR抗体领域几点颇深,小编曾经撰文介绍过安进首个获批GPCR抗体Erenumab的研发过程(扩展阅读:Erenumab:首个GPCR抗体的研发过程)。国内仅鸿运华宁等少数药企专注于GPCR抗体的研发。

Apelin是近年来兴起的新靶点,对于心衰、肾衰等多种疾病显示出潜在的治疗作用。安进、诺华、再生元等药企均有布局,激动剂以Apelin类似物多肽药物为主。


国内该靶点目前较少药企进入,肿瘤免疫新锐凡恩世有Apelin抗体专利已经公开。凡恩世布局的靶点还包括DLL-3、LAG-3、TIM-3、TIP-1、CD73、Claudin 18.2、Folate receptor 1、CD47等。



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