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不知不觉已至少有15篇研究论文关注“武汉新型肺炎”—数据共享功不可没!确诊和疑似病例总和逼近3400例

精准医学编辑部 精准医学前沿 2020-01-26

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------【精准医学前沿原创】------


本期编辑:Alias;内容审核:Etion 博士

精准医学前沿报道 

最新疫情:截至2020年1月25日21时,全国确诊新型肺炎1392例,1983例疑似感染患者,确诊和疑似病例总和高达3375例。已死亡41例,治愈39人。追踪到密切接触者超过15000人,尚有超过14000人正在接受医学观察。但是我们对于患者的流行病学,临床,实验室和放射学特征以及治疗和临床结局,不是很清楚


2020年1月22日,国际顶级期刊《自然》(Nature)发表:”关于新型冠状病毒,这5个问题亟待解答“的评论文章。(点击查看详情:《自然》:关于新型病毒,这五个问题亟待解答)


《精准医学前沿》整理发现,为了回答Nature杂志上专家提出的这5个关键问题。截至2020年1月26日发稿时,短短一个月,国际上的研究人员至少发表了15篇关注武汉新型冠状病毒肺炎的研究性论文,只为系统性的回答这5个关键问题


回答的主要问题包括:武汉新型冠状病毒肺炎的潜在感染人数估计,人与人之间的感染性,流行性,新型病毒的变异性,新型病毒的宿主和来源,临床和实验室以及放射学特征,临床治疗和结局等问题只有更清楚的解答这些问题,才能够更好的应对武汉新型冠状病毒导致的肺炎,指导新型肺炎的精准预防和治疗。


可喜的是!这15篇研究论文中,有11篇来自我国,包括大陆的8篇和香港的3篇这里必须要为我国的科研工作者点个赞其中有7项研究发表在专业期刊上(包括2篇《柳叶刀》1篇《新英格兰医学》1篇《中国科学:生命科学》1篇《医学病毒杂志》等),另外8项研究发表在著名预印本bioRxiv期刊上


那么是什么促进了我国和国际上能够在这么短的时间能取得这么多新的研究进展呢?2020年1月24日,英国伦敦卫生与热带医学院传染病流行病学David L Heymann在国际顶级医学期刊《柳叶刀》发表题为“数据共享和疫情爆发:最佳实践案例”点评文章给出了答案,该评论文章的资深作者称赞到:“我国武汉新型病毒数据共享的非常及时,并认为上述研究成果能够这么迅速的取得,也应该归功于数据的及时共享。”


以下是我们《精准医学前沿》编辑团队按时间发表的先后顺序对这15篇研究性论文介绍,外加6篇国际顶级医学期刊《柳叶刀》发表的评论和通讯文章


(1). 2020年1月18日,英国医学研究理事会(MRC)/伦敦帝国理工学院流行病学专家Neil M. Ferguson根据对武汉潜在感染2019新型冠状病毒者数量进行估计,估计值显示武汉市新型病毒潜在感染人数可能超过1700(95%置信区间427– 4,471人)。点击查看详情:伦敦帝国理工专家估计:武汉市新型病毒潜在感染人数可能超过1700




(2). 2020年1月19日,厦门大学公共卫生学院的陈田木团队在著名预印本bioRxiv期刊发布研究性论文,在该研究中,研究人员建立了一个从蝙蝠-宿主病毒库-人(Bats-Hosts-Reservoir-People)传播数学模型,以评估传播行为



(3). 2020年1月20日,香港城市大学的Sheng Chen团队在著名预印本bioRxiv期刊发布研究性文。在该研究中,研究人员通过对spike蛋白分析发现,该蛋白与ACE2的亲和力要小于SARS病毒,提示该病毒不会很容易地在人与人之间传播,而且不会导致很严重的人感染



(4). 2020年1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩研究员等团队在国际上率先在国际著名学术期刊《中国科学:生命科学》(Top期刊)英文版期刊上发布武汉新型冠状病毒研究成果。该研究成果率先评估了武汉新型冠状病毒的潜在人间传染力,相关结果提示武汉新型冠状病毒可能有很强的人与人之间的传染力,这些研究成果为尽快确认传染源和传播途径、制定高效的防控策略提供了科学理论依据点击查看详情:科学大发现:新型病毒不仅有强传染性,还具强变异性



(5). 2020年1月21日,南开大学高山团队在中文核心期刊《生物信息学》,发表“武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析”的研究文章。其中研究人员最重要的发现beta冠状病毒存在大量的可变翻译,从分子水平揭示了该病毒变异快、多样性高的特点,为beta冠状病毒的防控提供了依据。(点击查看详情:科学大发现:新型病毒不仅有强传染性,还具强变异性



(6). 2020年1月21日,浙江大学医学院第一附属医院肖永红团队在著名预印本bioRxiv期刊发研究性论文。该论文根据深度学习算法模拟得出的结论认为:武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠 SARS样冠状病毒和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)具有相近的感染力蝙蝠冠状病毒与2019-nCoV更为接近。此外,通过比较脊椎动物宿主的所有病毒的感染模式,研究还发现水貂冠状病毒与2019-nCov有着更为接近的感染模式结论认为,蝙蝠和水貂可能是2019-nCoV的两个源头



(7). 2020年1月22日,北京大学、广西中医药大学、宁波大学、武汉生物工程学院的研究人员联在国际权威期刊《医学病毒学杂志》在线发表了一篇研究论文,研究人员通过利用同义密码子使用偏向(RSCU)分析数据,发现导致全国17人死亡、570多人确诊感染的武汉新型肺炎病毒的直接来源最可能是蛇


但是专家质疑上述论述武汉新型病毒来自于蛇的论文只靠分析证据,无实验证据,而且分析方法也不合理,同时蝙蝠是哺乳动物,果子狸和骆驼也是哺乳动物,人也同样是哺乳动物也就是说,SARS和MERS病毒的传递是在哺乳动物之间进行的。但蛇不是哺乳动物(点击查看详情:确诊和疑似病例突破1000!专家质疑“新型病毒来源蛇”:无实验证据,分析方法也不合理)



(8). 2020年1月22日,就当科学家争论不休之时,曾经证实2003年SARS病毒来源是蝙蝠的中科院武汉病毒所石正丽团队在著名预印本网站 BioRxiv在线分布研究论文。该研究对先前的结果提出了新的挑战,认为蝙蝠才是最有可能的携带武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)的野生动物,确定了2019-nCoV进入人体细胞的受体为ACE2



(9). 2020年1月22日,NIH的Vincent Munste与Michael Letko团队在著名预印本bioRxiv期刊发布研究性论文。在该研究中,研究人员开发了一种方法,可以快速筛选beta希冠状病毒,包括SARS-CoV和最新的武汉新型冠状病毒(2019-nCoV),包括病毒所利用的受体情况以及感染的细胞类型。通过此方法,研究人员同样确定了2019-nCoV进入人体细胞的受体为ACE2,这与石正丽团队的研究成果一致



(10). 2020年1月23日,香港理工大学的Daihai He和香港中文大学的Shi Zhao团队在著名预印本bioRxiv期刊发布研究性论文。在该研究中,研究人员绘制了2019-nCoV的流行曲线,定量了该疾病的基本再生数。



(11). 2020年1月23日,瑞士Bern大学的Julien Riou和Christian L. Althaus团队在著名预印本bioRxiv期刊发布研究性论文,在该研究中,研究人员对疾病的早期爆发进行了数据模拟。



(12). 2020年1月24日,意大利University Campus Bio-Medico of Rome的Silvia Angeletti团队在著名预印本bioRxiv期刊发布论文。在该研究中,研究人员对该病毒进行了进化和分子流行病学方面的分析,提示2019-nCoV是一种与SARS不同的病毒,该病毒在从蝙蝠进入中间宿主后有可能发生了变异,进而获得了感染人的能力。



2020年1月25日,非常罕见!同一天,国际顶级医学期刊《柳叶刀》(Lancet)同期连发8篇文章(包括2篇研究性论文和6篇评论和通讯文章)和国际顶级期刊《新英格兰医学杂志》同期发表3(包括1篇研究性论文和2篇评论)篇聚焦武汉新型冠状病毒,相关研究性论文首次揭示武汉肺炎的流行病学,临床,实验室和放射学特征,治疗和临床结局和人传人证据。以下是详细报道:


(13). 北京中日友好医院曹彬及北京协和医学院王建伟团队率先在国际顶级医学期刊《柳叶刀》(Lancet)发表前瞻性重磅研究性论文。该论文研究表明发病时的常见症状为发烧,咳嗽和肌痛或疲劳,并发症包括急性呼吸窘迫综合征,急性心脏损伤和继发感染而且在该研究中,所有纳入研究的患者均患有肺炎,胸部CT检查肺部发现异常。


进一步研究发现,武汉新型冠状病毒感染和2002年“非典”期间的SARS病毒一样,会引起严重的呼吸系统疾病,呼吸系统疾病症状的严重程度与入急诊(ICU)的高死亡率相关。最后,该研究表示对武汉新型冠状病毒的起源,流行病学,人类传播的持续时间以及疾病的临床范围的认识方面还需要有待进一步研究。



(14). 无独有偶,2020年1月25日,国际顶级医学期刊《柳叶刀》(Lancet)同时还刊登了一篇来自香港大学Kwok-Yung Yuen团队的关于武汉新型冠状病毒人传人方面的研究成果。研究人员通过对家族性聚集性肺炎的研究,首次发现了武汉新型冠状病毒人传人的证据,同时该研究还发现与这种新型冠状病毒在医院和家庭环境中的人际传播以及在其他地理区域感染旅行者的报告一致



(15).2020年1月25日,中国疾控中心领衔,北京地坛医院、武汉金银坛医院、湖北疾控中心、中国科学院生物安全大科学研究中心、山东第一医科大学的高福、武桂珍和谭文杰团队在世界顶级医学杂志《新英格兰医学杂志》发表研究论文。该研究通过对肺炎患者的样本进行全基因组测序发现了一种从未见过的Beta冠状病毒属病毒。该病毒从感染者气道上皮细胞中分离出,随后将其命名为2019-nCoV,这种病毒归属于 Sarbe 病毒亚属,正冠状病毒亚科,但形成了另外一簇的进化分枝。2019-nCoV 与 MERS-CoV 和 SARS-CoV 都不同,它成为可以感染人类的冠状病毒科中的第七个成员为了明确 2019-nCoV 感染的人呼吸道上皮细胞内可否观察到病毒颗粒,模拟感染和2019新型冠状病毒感染的人类呼吸道上皮细胞培养物每天用光学显微镜进行观察,培养6天后用透射电镜观察,这是首次在透射电镜下研究该病毒。



此外,同期国际顶级医学期刊还刊发了8篇评论和通讯文章(《柳叶刀》6篇,《新英格兰医学》2篇),聚焦武汉新型冠状病毒最新进展,其中包括


(16).2020年1月25日,英国伦敦卫生与热带医学院传染病流行病学David L Heymann发表题为“数据共享和疫情爆发:最佳实践案例”点评文章,称赞我国武汉新型病毒数据共享的及时,并认为上述研究成果能够这么迅速的取得,也应该归功于数据的及时共享。



(17).2020年1月25日,北京中日友好医院呼吸医学中心肺与重症医学科王辰等人发表题为“一种新的全球卫生关注的冠状病毒爆发”的点评文章,对上述两篇论文研究成果进行了系统的点评,以及对武汉新型冠状病毒的近期进展进行了较系统的回顾。



(18).2020年1月25日,国际顶级医学期刊《柳叶刀》编辑部也发表题为“武汉新型冠状病毒的逐步认识”的评论文章,称赞了上述两篇研究性论文,将进一步帮助和推动我们逐步的认识武汉新型冠状肺炎病毒,为该病毒的防控和治疗提供理论和实践基础



(19).2020年1月25日,昆士兰大学Deanna Anderlini,美国科罗拉多大学奥罗拉分校Matthew Wynia,及维滕/赫德柯克大学Diethard Tauschel连发3篇表题为“在医学上需要增强流行病导致的大屠杀意识”的通讯文章,提示通过这次疫情的爆发,我们要时刻更加防范警惕流行病的不定期爆发总之,上述这6篇《柳叶刀》评论和通讯文章共同聚焦武汉新型冠状病毒肺炎的最近进展和经验教训



(20).2020年1月25日,爱荷华市爱荷华大学微生物学和免疫学系Stanely Perlman在《新英格兰医学杂志》同期发表社论文章。文章认为关于这种感染,仍然有很多信息需要了解。最重要的是,需要确定人际传播的程度和临床疾病的各种表现。SARS-CoV 和 MERS-CoV 的传播在很大程度上是通过超级传播事件发生的。有数据提示 2019-nCoV 传播可能存在超级传播事件,但超级传播事件的相对重要性尚不清楚。



2019-nCoV 的表现可能更像 SARS-CoV,并通过增强与 hACE2 的结合进一步适应人类宿主。因此,重要的是要获得尽可能多的时间和地理上无关的临床分离株,以评估病毒突变的程度,并评估这些突变是否表明对人类宿主的适应性。此外,如果 2019-nCoV 与 SARS-CoV 相似,则该病毒会全身传播。进行尸检时获取患者样本将有助于阐明感染的发病机制,合理地调整治疗干预措施,并将有助于验证从实验动物的实验性感染获得的结果

(21).2020年1月25日,密苏里州汉密尔顿国立卫生研究院国家过敏和传染病研究所病毒学实验室Vincent J. Munster等在《新英格兰医学杂志》同期发表观点文章。文章非常赞赏中国对疫情做出的迅速响应并及时向世界卫生组织(WHO)通报,在发现病原体后与国际社会共享病毒基因序列信息。来自中国、泰国、韩国和日本的最新信息表明,与 SARS 和 MERS 相比,与 2019-nCoV 相关的疾病似乎相对较轻,2019-nCoV 的致病性似乎比 MERS-CoV 和 SARS-CoV 弱。然而,该病毒的出现提出了一个重要问题,即其总体致病性对我们在遏制新病毒、防止其大规模传播和防止其在人类中引起大流行或地方性流行等方面会产生怎样的影响


写在最后:为数据的及时共享点赞,为一线医护人员和科研工作者们致敬,为国家相关部门的积极部署点赞,武汉加油,全国加油!相信在我们的共同努力下,很快就能战胜武汉新型肺炎病毒!!


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